FuNGI

A0A5N5QTW8

Protein Details

Accession

A0A5N5QTW8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
517-555	VHKTITRPRNESKEDKKARKEAARNQKQNRKAEKSAMKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
525-556	RNESKEDKKARKEAARNQKQNRKAEKSAMKEA

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MAPKSIWRQPGVQHFQLVHRSQRDPLIHDPEASAHVLKGFERENVTRKGKTRTDLERSLPNIESGRANVGEAAEYGVYFDDTDYDYMQHLRPVGITADAILLEAPSKSNSKGKAQEIVSLPDESLPSQKELSLAAARDAMQSIPSELAGFNPNLDQHLRQTLEALDDDAFVENNDQAGEEALDDIFEELLRGGRRQEGEGGEWDKWEFREEGINERSTATASKQAEDVGDDLISRVAAFKKVQGDAPTELSGDENDPECSEGGDTIGNLPSLPPIPVVGGKRRRMGAHSDASGFSMSSSSVFRSDGLRGLDAQFDRVGRDLQLDHDEDIQDSEDDDGVRTSRDHTEDDSDEAPELLDTREDLEGMMDEFLEKYELVGNKIRPVLGGITGPEKLATLRHALVDENDGDGGLRARAIIKKGNFIDALGDDFVPEPCDIDRGYEQDRWDCETILSTYSNLENHPRLILARDKRPVPRIHLNPQTGLPSVTEASSQHDIMPTRPGSTMREEVSGATVVESVHKTITRPRNESKEDKKARKEAARNQKQNRKAEKSAMKEAFSSERKTQRKTAIGVPNGSIRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.53
3	0.57
4	0.54
5	0.52
6	0.49
7	0.49
8	0.47
9	0.53
10	0.51
11	0.48
12	0.52
13	0.52
14	0.48
15	0.46
16	0.43
17	0.37
18	0.36
19	0.32
20	0.24
21	0.16
22	0.17
23	0.17
24	0.16
25	0.19
26	0.18
27	0.19
28	0.24
29	0.29
30	0.33
31	0.41
32	0.47
33	0.49
34	0.53
35	0.58
36	0.58
37	0.59
38	0.61
39	0.62
40	0.65
41	0.65
42	0.65
43	0.64
44	0.61
45	0.6
46	0.52
47	0.45
48	0.38
49	0.33
50	0.31
51	0.24
52	0.25
53	0.2
54	0.2
55	0.17
56	0.16
57	0.15
58	0.13
59	0.13
60	0.09
61	0.08
62	0.08
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.06
67	0.06
68	0.08
69	0.09
70	0.1
71	0.1
72	0.11
73	0.14
74	0.15
75	0.15
76	0.15
77	0.14
78	0.14
79	0.15
80	0.14
81	0.13
82	0.12
83	0.1
84	0.1
85	0.09
86	0.09
87	0.07
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.06
92	0.08
93	0.1
94	0.13
95	0.18
96	0.22
97	0.29
98	0.36
99	0.39
100	0.45
101	0.44
102	0.48
103	0.45
104	0.46
105	0.4
106	0.33
107	0.3
108	0.24
109	0.23
110	0.17
111	0.18
112	0.16
113	0.15
114	0.15
115	0.16
116	0.15
117	0.15
118	0.18
119	0.17
120	0.16
121	0.15
122	0.16
123	0.16
124	0.16
125	0.16
126	0.12
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.09
131	0.08
132	0.08
133	0.07
134	0.09
135	0.11
136	0.1
137	0.1
138	0.11
139	0.11
140	0.12
141	0.14
142	0.14
143	0.14
144	0.2
145	0.21
146	0.2
147	0.21
148	0.2
149	0.2
150	0.19
151	0.17
152	0.11
153	0.1
154	0.11
155	0.09
156	0.09
157	0.07
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.05
163	0.05
164	0.06
165	0.06
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.04
171	0.05
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.03
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.13
181	0.14
182	0.15
183	0.19
184	0.17
185	0.18
186	0.23
187	0.24
188	0.21
189	0.2
190	0.19
191	0.17
192	0.15
193	0.16
194	0.12
195	0.1
196	0.16
197	0.17
198	0.24
199	0.26
200	0.27
201	0.25
202	0.25
203	0.24
204	0.18
205	0.18
206	0.12
207	0.16
208	0.16
209	0.16
210	0.16
211	0.16
212	0.16
213	0.15
214	0.15
215	0.08
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.05
222	0.06
223	0.06
224	0.08
225	0.08
226	0.11
227	0.15
228	0.16
229	0.18
230	0.19
231	0.21
232	0.21
233	0.23
234	0.2
235	0.17
236	0.16
237	0.14
238	0.13
239	0.1
240	0.09
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.09
264	0.12
265	0.19
266	0.26
267	0.29
268	0.32
269	0.34
270	0.34
271	0.33
272	0.36
273	0.34
274	0.3
275	0.29
276	0.27
277	0.25
278	0.25
279	0.23
280	0.17
281	0.11
282	0.07
283	0.06
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.09
291	0.1
292	0.12
293	0.13
294	0.12
295	0.12
296	0.13
297	0.15
298	0.14
299	0.14
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.11
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.1
309	0.12
310	0.13
311	0.13
312	0.13
313	0.13
314	0.12
315	0.12
316	0.11
317	0.08
318	0.07
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.08
328	0.11
329	0.13
330	0.14
331	0.15
332	0.19
333	0.2
334	0.22
335	0.21
336	0.18
337	0.16
338	0.14
339	0.13
340	0.08
341	0.08
342	0.05
343	0.05
344	0.04
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.09
361	0.1
362	0.12
363	0.17
364	0.18
365	0.21
366	0.22
367	0.21
368	0.17
369	0.18
370	0.16
371	0.13
372	0.13
373	0.1
374	0.11
375	0.12
376	0.12
377	0.1
378	0.09
379	0.08
380	0.09
381	0.1
382	0.11
383	0.11
384	0.12
385	0.13
386	0.13
387	0.14
388	0.15
389	0.14
390	0.11
391	0.1
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.07
400	0.1
401	0.13
402	0.19
403	0.2
404	0.27
405	0.28
406	0.31
407	0.29
408	0.26
409	0.26
410	0.2
411	0.21
412	0.14
413	0.13
414	0.1
415	0.11
416	0.11
417	0.1
418	0.09
419	0.08
420	0.07
421	0.09
422	0.09
423	0.12
424	0.14
425	0.16
426	0.2
427	0.23
428	0.24
429	0.28
430	0.29
431	0.31
432	0.3
433	0.27
434	0.23
435	0.22
436	0.22
437	0.19
438	0.18
439	0.13
440	0.14
441	0.15
442	0.16
443	0.15
444	0.19
445	0.19
446	0.19
447	0.19
448	0.18
449	0.17
450	0.2
451	0.28
452	0.29
453	0.35
454	0.4
455	0.45
456	0.5
457	0.57
458	0.58
459	0.58
460	0.61
461	0.61
462	0.65
463	0.69
464	0.65
465	0.6
466	0.57
467	0.52
468	0.43
469	0.36
470	0.27
471	0.2
472	0.18
473	0.16
474	0.15
475	0.12
476	0.17
477	0.19
478	0.19
479	0.17
480	0.2
481	0.21
482	0.21
483	0.28
484	0.23
485	0.22
486	0.24
487	0.25
488	0.25
489	0.3
490	0.34
491	0.28
492	0.29
493	0.28
494	0.27
495	0.27
496	0.24
497	0.18
498	0.13
499	0.12
500	0.1
501	0.13
502	0.14
503	0.12
504	0.14
505	0.15
506	0.16
507	0.25
508	0.35
509	0.4
510	0.47
511	0.54
512	0.61
513	0.68
514	0.77
515	0.77
516	0.78
517	0.8
518	0.83
519	0.84
520	0.83
521	0.84
522	0.84
523	0.84
524	0.84
525	0.84
526	0.86
527	0.87
528	0.89
529	0.89
530	0.88
531	0.89
532	0.89
533	0.86
534	0.81
535	0.81
536	0.8
537	0.78
538	0.8
539	0.74
540	0.65
541	0.57
542	0.55
543	0.54
544	0.49
545	0.48
546	0.45
547	0.5
548	0.56
549	0.6
550	0.65
551	0.65
552	0.68
553	0.66
554	0.67
555	0.67
556	0.67
557	0.64
558	0.58
559	0.58

A0A5N5QTW8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer