Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179V4J4

Protein Details
Accession A0A179V4J4    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-423LLSHAHRKKYRRRARIPPPVTLHydrophilic
645-666ASSPTQRRSKKLNIDLRPERLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-426HRKKYRRRARIPPPVTLKRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019313  Mediator_Med17  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10156  Med17  
Amino Acid Sequences MHRYHRTDLQEALEVLEQPKPNQLPPTPQAVKMEESFPLPLRPFIQKSAREPDSLPIRIAQINSQRGSFRNVTEQSLQAEIDAQRARAAAGLEAEETEETESQEVKSTDRLEQLFKSRAEIVDFVAQAHAEANYALDLVSLLISKYTPRQAEISMSPYLKQKAPLGSLGIDIIKTPEKTESAQKEIVDLSRGWKLETFDFAANKLLQAASRLEQEVAAETKYWADVLSIKEKGWKICRIPRERQTLGVQCGFLEATPTLRDRGLAALRRGDGGDLILDRGLQPSQPRSLRVRVQQHDQIVGCSKLISLELAPGDDTIEHRIRLARDVLYEEELFHELNREARTLLQHGIQSKENLIQFQASDNQQILIDMVGLDAYNISDLNQQEHAEDALAEAVAQSLRLLLSHAHRKKYRRRARIPPPVTLKRRPNPEYSLIRPIVSYLQHKSALQWLRSFLSTITRTLQLAGLKCKHDVSPLIFVRLPPMNKTIPSPSEPDTLPFVERLVDTFLTPLESIVTGTFLSPTSNFKIRIVTNISPNGYGTEFEIATNMTSGSRTKSSSSRFGLRDDLQQLLLHRFTIDLVYLIPTLAWDTGTESSPPPISSQQKQEQGQAQVQTEQTHFNTPVQPRASHPTPWTPTSPENGELVASSPTQRRSKKLNIDLRPERLTIQCQWLGAGLDANLGEALESMARGGNVIYSWSDDGGGEEKTLQSVMGLLSQSETRPEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.27
4 0.24
5 0.21
6 0.28
7 0.28
8 0.3
9 0.36
10 0.39
11 0.42
12 0.44
13 0.54
14 0.49
15 0.5
16 0.52
17 0.47
18 0.47
19 0.4
20 0.39
21 0.3
22 0.29
23 0.29
24 0.25
25 0.28
26 0.25
27 0.26
28 0.27
29 0.34
30 0.35
31 0.39
32 0.46
33 0.47
34 0.53
35 0.6
36 0.59
37 0.54
38 0.52
39 0.52
40 0.52
41 0.48
42 0.42
43 0.34
44 0.34
45 0.34
46 0.34
47 0.33
48 0.33
49 0.38
50 0.39
51 0.39
52 0.38
53 0.37
54 0.43
55 0.39
56 0.33
57 0.35
58 0.36
59 0.39
60 0.4
61 0.4
62 0.35
63 0.34
64 0.31
65 0.21
66 0.24
67 0.19
68 0.23
69 0.22
70 0.2
71 0.19
72 0.19
73 0.19
74 0.17
75 0.17
76 0.12
77 0.11
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.19
94 0.21
95 0.24
96 0.29
97 0.31
98 0.29
99 0.33
100 0.39
101 0.4
102 0.38
103 0.38
104 0.35
105 0.34
106 0.33
107 0.3
108 0.25
109 0.25
110 0.24
111 0.21
112 0.19
113 0.18
114 0.15
115 0.14
116 0.11
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.07
132 0.11
133 0.17
134 0.18
135 0.19
136 0.22
137 0.23
138 0.28
139 0.29
140 0.29
141 0.27
142 0.27
143 0.27
144 0.29
145 0.31
146 0.28
147 0.28
148 0.29
149 0.29
150 0.31
151 0.31
152 0.28
153 0.26
154 0.24
155 0.23
156 0.18
157 0.14
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.16
165 0.18
166 0.27
167 0.3
168 0.32
169 0.35
170 0.34
171 0.34
172 0.33
173 0.32
174 0.26
175 0.2
176 0.17
177 0.19
178 0.19
179 0.18
180 0.19
181 0.2
182 0.19
183 0.22
184 0.22
185 0.21
186 0.21
187 0.21
188 0.22
189 0.2
190 0.18
191 0.16
192 0.13
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.11
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.06
211 0.06
212 0.09
213 0.12
214 0.18
215 0.18
216 0.18
217 0.24
218 0.26
219 0.31
220 0.33
221 0.36
222 0.37
223 0.43
224 0.53
225 0.55
226 0.62
227 0.66
228 0.69
229 0.64
230 0.62
231 0.62
232 0.58
233 0.54
234 0.47
235 0.39
236 0.29
237 0.29
238 0.24
239 0.17
240 0.12
241 0.08
242 0.07
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.14
250 0.19
251 0.22
252 0.23
253 0.25
254 0.25
255 0.25
256 0.25
257 0.2
258 0.15
259 0.1
260 0.09
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.06
268 0.07
269 0.09
270 0.11
271 0.18
272 0.19
273 0.23
274 0.26
275 0.32
276 0.37
277 0.43
278 0.49
279 0.46
280 0.51
281 0.52
282 0.49
283 0.47
284 0.41
285 0.35
286 0.28
287 0.25
288 0.19
289 0.14
290 0.12
291 0.09
292 0.09
293 0.07
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.14
308 0.14
309 0.16
310 0.18
311 0.14
312 0.13
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.09
322 0.1
323 0.08
324 0.11
325 0.12
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.13
330 0.13
331 0.14
332 0.13
333 0.14
334 0.15
335 0.17
336 0.18
337 0.17
338 0.16
339 0.18
340 0.16
341 0.15
342 0.13
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.13
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.02
362 0.02
363 0.02
364 0.02
365 0.03
366 0.06
367 0.07
368 0.09
369 0.1
370 0.11
371 0.1
372 0.11
373 0.1
374 0.07
375 0.07
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.04
389 0.05
390 0.1
391 0.21
392 0.25
393 0.32
394 0.37
395 0.44
396 0.54
397 0.64
398 0.69
399 0.7
400 0.75
401 0.79
402 0.85
403 0.89
404 0.82
405 0.79
406 0.78
407 0.76
408 0.74
409 0.72
410 0.7
411 0.65
412 0.71
413 0.66
414 0.63
415 0.58
416 0.6
417 0.58
418 0.53
419 0.54
420 0.46
421 0.42
422 0.37
423 0.32
424 0.27
425 0.23
426 0.22
427 0.17
428 0.2
429 0.21
430 0.21
431 0.21
432 0.26
433 0.29
434 0.27
435 0.26
436 0.25
437 0.25
438 0.25
439 0.25
440 0.17
441 0.19
442 0.19
443 0.19
444 0.19
445 0.19
446 0.18
447 0.19
448 0.21
449 0.17
450 0.18
451 0.23
452 0.24
453 0.24
454 0.25
455 0.26
456 0.24
457 0.23
458 0.24
459 0.21
460 0.27
461 0.27
462 0.29
463 0.28
464 0.28
465 0.29
466 0.3
467 0.27
468 0.2
469 0.24
470 0.22
471 0.22
472 0.25
473 0.27
474 0.26
475 0.27
476 0.28
477 0.27
478 0.29
479 0.28
480 0.27
481 0.25
482 0.23
483 0.22
484 0.18
485 0.15
486 0.13
487 0.13
488 0.12
489 0.12
490 0.11
491 0.1
492 0.11
493 0.1
494 0.11
495 0.11
496 0.09
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.06
506 0.07
507 0.08
508 0.12
509 0.15
510 0.2
511 0.21
512 0.21
513 0.27
514 0.26
515 0.31
516 0.35
517 0.33
518 0.35
519 0.38
520 0.38
521 0.33
522 0.33
523 0.29
524 0.22
525 0.19
526 0.14
527 0.12
528 0.11
529 0.11
530 0.11
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.08
535 0.06
536 0.07
537 0.08
538 0.11
539 0.13
540 0.15
541 0.18
542 0.24
543 0.29
544 0.36
545 0.4
546 0.45
547 0.44
548 0.45
549 0.48
550 0.44
551 0.46
552 0.4
553 0.36
554 0.29
555 0.29
556 0.28
557 0.26
558 0.24
559 0.17
560 0.15
561 0.14
562 0.13
563 0.12
564 0.11
565 0.07
566 0.07
567 0.09
568 0.09
569 0.08
570 0.08
571 0.07
572 0.08
573 0.07
574 0.07
575 0.06
576 0.09
577 0.11
578 0.12
579 0.13
580 0.13
581 0.15
582 0.17
583 0.17
584 0.17
585 0.23
586 0.28
587 0.32
588 0.41
589 0.47
590 0.53
591 0.55
592 0.58
593 0.57
594 0.56
595 0.55
596 0.5
597 0.44
598 0.39
599 0.38
600 0.35
601 0.29
602 0.29
603 0.25
604 0.26
605 0.26
606 0.26
607 0.32
608 0.31
609 0.38
610 0.37
611 0.37
612 0.36
613 0.44
614 0.44
615 0.42
616 0.44
617 0.46
618 0.47
619 0.5
620 0.49
621 0.46
622 0.45
623 0.46
624 0.45
625 0.37
626 0.33
627 0.3
628 0.27
629 0.22
630 0.2
631 0.16
632 0.13
633 0.14
634 0.17
635 0.25
636 0.33
637 0.37
638 0.41
639 0.48
640 0.58
641 0.65
642 0.71
643 0.74
644 0.74
645 0.81
646 0.82
647 0.81
648 0.74
649 0.64
650 0.57
651 0.51
652 0.47
653 0.41
654 0.41
655 0.36
656 0.33
657 0.32
658 0.31
659 0.28
660 0.23
661 0.2
662 0.12
663 0.12
664 0.11
665 0.11
666 0.09
667 0.08
668 0.07
669 0.06
670 0.06
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.06
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.09
681 0.09
682 0.11
683 0.12
684 0.12
685 0.13
686 0.12
687 0.14
688 0.14
689 0.14
690 0.12
691 0.12
692 0.12
693 0.13
694 0.13
695 0.1
696 0.08
697 0.09
698 0.09
699 0.11
700 0.11
701 0.11
702 0.12
703 0.14
704 0.15