Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6YY98

Protein Details
Accession A0A5N6YY98    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-137APAPKEKTTKPKGNIKAKKPEPBasic
198-222NIPDSKKAKRKILKKQKENKQEAEEHydrophilic
310-337WKGANRRFKRTPWNRIEKKRLEKGKTREBasic
406-433KKNADDTPKKAKKDKKKGAKATEQETPKBasic
445-465SPPVTRAATKAKKAKKTKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-76KKDKKRKAAAAATAAADSPAKKTKKVEAKSAESTNVAPKASLKKNKENGAEKPAAKLKVNGEPTRQAKPRKR
106-135KKTKKADGTAAPAPKEKTTKPKGNIKAKKP
203-215KKAKRKILKKQKE
312-357GANRRFKRTPWNRIEKKRLEKGKTREQWSDRIVREQKRRLAKAKHL
407-465KNADDTPKKAKKDKKKGAKATEQETPKENPKKETSAAISPPVTRAATKAKKAKKTKAKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.333, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MALDKKDKKRKAAAAATAAADSPAKKTKKVEAKSAESTNVAPKASLKKNKENGAEKPAAKLKVNGEPTRQAKPRKRAADFLSDNDDSEPEDVPETKVETEKQSTNKKTKKADGTAAPAPKEKTTKPKGNIKAKKPEPVAEESDDDEMDDEESAASGASTSEDEEEDDRTAALIRGFESSGDEDESGDEGFKPDQPVPNIPDSKKAKRKILKKQKENKQEAEEPGTVYVGRIPHGFYEHQMKAYFSQFGDISRLRLSRNRITGSSKHYAFIEFTSTSVAKVVAATMDNYLMYGHILKCKYVPQEQLHPELWKGANRRFKRTPWNRIEKKRLEKGKTREQWSDRIVREQKRRLAKAKHLKALGYELELPQLKSVDEVPVQQEENKMIEASETAPEEPPQAIEAPKEEKKNADDTPKKAKKDKKKGAKATEQETPKENPKKETSAAISPPVTRAATKAKKAKKTKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.71
3 0.63
4 0.54
5 0.45
6 0.35
7 0.27
8 0.2
9 0.18
10 0.23
11 0.24
12 0.28
13 0.32
14 0.41
15 0.51
16 0.55
17 0.61
18 0.61
19 0.67
20 0.7
21 0.7
22 0.62
23 0.54
24 0.5
25 0.47
26 0.41
27 0.33
28 0.26
29 0.28
30 0.34
31 0.42
32 0.5
33 0.51
34 0.58
35 0.66
36 0.74
37 0.78
38 0.76
39 0.73
40 0.72
41 0.72
42 0.62
43 0.61
44 0.6
45 0.54
46 0.48
47 0.46
48 0.42
49 0.43
50 0.51
51 0.48
52 0.46
53 0.51
54 0.54
55 0.58
56 0.61
57 0.62
58 0.64
59 0.69
60 0.74
61 0.75
62 0.76
63 0.75
64 0.73
65 0.73
66 0.67
67 0.61
68 0.58
69 0.49
70 0.45
71 0.37
72 0.32
73 0.22
74 0.2
75 0.17
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.18
85 0.21
86 0.25
87 0.29
88 0.35
89 0.44
90 0.51
91 0.59
92 0.64
93 0.67
94 0.7
95 0.73
96 0.75
97 0.71
98 0.7
99 0.65
100 0.65
101 0.64
102 0.61
103 0.54
104 0.48
105 0.43
106 0.39
107 0.38
108 0.35
109 0.39
110 0.44
111 0.51
112 0.55
113 0.63
114 0.69
115 0.76
116 0.81
117 0.8
118 0.81
119 0.77
120 0.78
121 0.71
122 0.66
123 0.6
124 0.56
125 0.51
126 0.43
127 0.4
128 0.33
129 0.31
130 0.25
131 0.2
132 0.15
133 0.11
134 0.09
135 0.07
136 0.06
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.07
150 0.07
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.1
179 0.11
180 0.15
181 0.17
182 0.21
183 0.23
184 0.3
185 0.33
186 0.31
187 0.38
188 0.41
189 0.48
190 0.53
191 0.55
192 0.58
193 0.61
194 0.7
195 0.72
196 0.77
197 0.78
198 0.81
199 0.86
200 0.86
201 0.9
202 0.87
203 0.81
204 0.75
205 0.7
206 0.62
207 0.57
208 0.47
209 0.37
210 0.3
211 0.25
212 0.18
213 0.13
214 0.12
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.1
221 0.11
222 0.1
223 0.17
224 0.17
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.19
229 0.2
230 0.2
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.16
236 0.14
237 0.14
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.2
242 0.25
243 0.27
244 0.32
245 0.33
246 0.33
247 0.37
248 0.4
249 0.42
250 0.43
251 0.37
252 0.33
253 0.31
254 0.29
255 0.25
256 0.21
257 0.18
258 0.12
259 0.12
260 0.14
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.18
285 0.22
286 0.25
287 0.32
288 0.31
289 0.4
290 0.43
291 0.47
292 0.44
293 0.41
294 0.36
295 0.34
296 0.31
297 0.27
298 0.28
299 0.3
300 0.38
301 0.4
302 0.49
303 0.5
304 0.54
305 0.61
306 0.67
307 0.71
308 0.71
309 0.79
310 0.8
311 0.85
312 0.89
313 0.87
314 0.87
315 0.85
316 0.84
317 0.8
318 0.8
319 0.79
320 0.79
321 0.78
322 0.74
323 0.74
324 0.68
325 0.68
326 0.65
327 0.65
328 0.55
329 0.57
330 0.59
331 0.59
332 0.65
333 0.65
334 0.67
335 0.69
336 0.74
337 0.73
338 0.74
339 0.76
340 0.77
341 0.78
342 0.78
343 0.7
344 0.63
345 0.56
346 0.53
347 0.43
348 0.35
349 0.28
350 0.21
351 0.24
352 0.25
353 0.23
354 0.19
355 0.18
356 0.15
357 0.14
358 0.15
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.17
363 0.19
364 0.2
365 0.21
366 0.22
367 0.2
368 0.2
369 0.19
370 0.17
371 0.13
372 0.13
373 0.12
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.14
379 0.15
380 0.16
381 0.15
382 0.14
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.17
388 0.23
389 0.28
390 0.32
391 0.32
392 0.35
393 0.37
394 0.43
395 0.44
396 0.48
397 0.5
398 0.52
399 0.62
400 0.65
401 0.68
402 0.71
403 0.75
404 0.75
405 0.79
406 0.84
407 0.84
408 0.87
409 0.91
410 0.92
411 0.93
412 0.89
413 0.83
414 0.81
415 0.75
416 0.67
417 0.61
418 0.57
419 0.56
420 0.58
421 0.56
422 0.55
423 0.57
424 0.6
425 0.58
426 0.6
427 0.56
428 0.55
429 0.54
430 0.53
431 0.48
432 0.43
433 0.42
434 0.38
435 0.34
436 0.26
437 0.27
438 0.32
439 0.38
440 0.46
441 0.54
442 0.6
443 0.69
444 0.78
445 0.85