Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6YX79

Protein Details
Accession A0A5N6YX79    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-204LLPCWRRISRLHKGFRRAREDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSDNLSEADKIRNKRLAKLGNPSPSSRPEGAEPSSRPQSPSSVPGRSRPQSNAGSAASSRAASPRPDLQLSEGKRIKITPAVSSITGPERSQSVTPVSGTPPPSRAEESIETFEDRTLSAVFKLTLQEDRQRDIHGQRLTYLAGLKSELEDQGRDLRIETAVLDQALLEAASNAPQQKPLDYLLPCWRRISRLHKGFRRAREDDPKFIVICEARRLCLSYCMFAITMPEMFGVESSGQSPLKPYLLLDPEDDKGLDFEFLSEAVKRFEEDESIKPAFIAAVEGMSKDLAAMTINDDYKPYVTALRNLVRHAVVGAAITESSLFNASGDAALFEKDTLLGPWFRLSPLQSAVTMTYFSSPKTRDQAYILNAQRSQRMMQQILSSDLFDIINHLIRASKDARERVLDWFAAALNINHKRRAMQVDPNTVSSDGFMFNLTTCLDQLCEPFMDANFTKIDRIDAGYLHRNPRVDMKDETKINADQHASDEFYSRKVDGTSNFITEIFFLTVAAHHYGSESLTSKLDQLEKDLRQMESTITKFEQERHRWSSNPMQLRVFEQALKKYKDKLDLGIALKYSLQGVLFDDQWQARSMLFMRYVIVFLLRLVSGKNFPKEQIQLPLPEQQQEVWKCLPEYFVDGVVSNFKFIMWCMPQIITATQGDELVMLCVAFLESTGYIKNPYLKAGLVSILFRGTWPRPGGARGVLVDILNSMPFANEYLLHALMKFYIEAEHTGTHTQFFDKFNIRFEIFQIIKCVWPNTLYRAKLYNQSKRNLDFFVRFVNLLLNDVTFVLDESFGAFITIHKTQTELRNAADMDPTVRQEKEEQLASAQRIAKSYMQLTNETVAMLKLFTDALADSFTMPEIVQRLADMLDYNLDAMVGSKSSNLRVDNLQEYGFNPRALLSEIVDVYLNLMNKENFIVAVARDGRSYKPANFEKAADILRKWSLKSPEELRRWEQLQRKVREAKEADEQAEEDLGEVPDEFLDPLMYTLMEDPVILPGSRVSIDRSTIRSHLLSDPHDPFNRVPLKMEDVAPDTELKAKIEAFKAERMAQRRRPATETASETMDTSAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.64
3 0.64
4 0.64
5 0.69
6 0.7
7 0.72
8 0.73
9 0.69
10 0.64
11 0.6
12 0.6
13 0.52
14 0.46
15 0.41
16 0.43
17 0.44
18 0.46
19 0.45
20 0.46
21 0.51
22 0.49
23 0.47
24 0.43
25 0.45
26 0.4
27 0.45
28 0.45
29 0.46
30 0.48
31 0.53
32 0.61
33 0.6
34 0.62
35 0.58
36 0.59
37 0.55
38 0.56
39 0.53
40 0.44
41 0.42
42 0.37
43 0.35
44 0.28
45 0.23
46 0.21
47 0.19
48 0.21
49 0.2
50 0.25
51 0.29
52 0.33
53 0.35
54 0.35
55 0.37
56 0.43
57 0.44
58 0.5
59 0.47
60 0.43
61 0.43
62 0.43
63 0.41
64 0.38
65 0.36
66 0.3
67 0.31
68 0.33
69 0.32
70 0.32
71 0.32
72 0.3
73 0.31
74 0.26
75 0.23
76 0.21
77 0.23
78 0.23
79 0.23
80 0.22
81 0.21
82 0.23
83 0.24
84 0.25
85 0.27
86 0.3
87 0.3
88 0.29
89 0.29
90 0.32
91 0.34
92 0.32
93 0.33
94 0.34
95 0.36
96 0.37
97 0.37
98 0.35
99 0.31
100 0.3
101 0.24
102 0.19
103 0.16
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.16
111 0.17
112 0.21
113 0.24
114 0.32
115 0.33
116 0.37
117 0.37
118 0.37
119 0.41
120 0.39
121 0.44
122 0.4
123 0.37
124 0.34
125 0.34
126 0.32
127 0.28
128 0.27
129 0.19
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.14
138 0.16
139 0.21
140 0.23
141 0.22
142 0.21
143 0.2
144 0.19
145 0.19
146 0.17
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.07
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.16
163 0.17
164 0.18
165 0.2
166 0.21
167 0.25
168 0.24
169 0.29
170 0.35
171 0.39
172 0.39
173 0.41
174 0.41
175 0.38
176 0.45
177 0.49
178 0.5
179 0.55
180 0.64
181 0.67
182 0.76
183 0.8
184 0.81
185 0.81
186 0.75
187 0.73
188 0.74
189 0.72
190 0.69
191 0.66
192 0.59
193 0.5
194 0.46
195 0.41
196 0.33
197 0.3
198 0.32
199 0.28
200 0.26
201 0.27
202 0.29
203 0.26
204 0.31
205 0.3
206 0.23
207 0.22
208 0.23
209 0.22
210 0.19
211 0.2
212 0.13
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.17
232 0.21
233 0.22
234 0.22
235 0.23
236 0.23
237 0.24
238 0.23
239 0.16
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.15
256 0.17
257 0.2
258 0.25
259 0.25
260 0.24
261 0.23
262 0.22
263 0.18
264 0.14
265 0.12
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.12
287 0.14
288 0.15
289 0.19
290 0.25
291 0.3
292 0.31
293 0.31
294 0.33
295 0.27
296 0.26
297 0.22
298 0.16
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.13
332 0.14
333 0.16
334 0.17
335 0.16
336 0.16
337 0.16
338 0.15
339 0.14
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.15
345 0.16
346 0.2
347 0.24
348 0.26
349 0.25
350 0.28
351 0.32
352 0.31
353 0.38
354 0.36
355 0.35
356 0.35
357 0.35
358 0.34
359 0.3
360 0.28
361 0.24
362 0.26
363 0.24
364 0.24
365 0.25
366 0.23
367 0.25
368 0.24
369 0.19
370 0.14
371 0.14
372 0.12
373 0.09
374 0.1
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.14
382 0.15
383 0.19
384 0.22
385 0.24
386 0.26
387 0.27
388 0.29
389 0.29
390 0.29
391 0.24
392 0.19
393 0.17
394 0.15
395 0.13
396 0.12
397 0.08
398 0.12
399 0.2
400 0.22
401 0.23
402 0.23
403 0.24
404 0.28
405 0.34
406 0.32
407 0.33
408 0.39
409 0.46
410 0.47
411 0.47
412 0.44
413 0.37
414 0.33
415 0.24
416 0.18
417 0.09
418 0.08
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.11
436 0.1
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.08
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.12
448 0.18
449 0.21
450 0.24
451 0.25
452 0.24
453 0.24
454 0.31
455 0.31
456 0.28
457 0.28
458 0.29
459 0.34
460 0.34
461 0.35
462 0.3
463 0.29
464 0.26
465 0.25
466 0.21
467 0.15
468 0.16
469 0.16
470 0.14
471 0.12
472 0.14
473 0.11
474 0.12
475 0.13
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.13
480 0.12
481 0.18
482 0.17
483 0.17
484 0.17
485 0.17
486 0.16
487 0.14
488 0.14
489 0.08
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.07
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.09
507 0.1
508 0.13
509 0.11
510 0.14
511 0.2
512 0.2
513 0.23
514 0.24
515 0.23
516 0.21
517 0.21
518 0.19
519 0.17
520 0.17
521 0.16
522 0.14
523 0.15
524 0.15
525 0.2
526 0.28
527 0.28
528 0.34
529 0.39
530 0.41
531 0.41
532 0.44
533 0.48
534 0.45
535 0.46
536 0.41
537 0.36
538 0.35
539 0.36
540 0.34
541 0.26
542 0.22
543 0.19
544 0.23
545 0.28
546 0.31
547 0.31
548 0.33
549 0.35
550 0.38
551 0.37
552 0.33
553 0.31
554 0.33
555 0.33
556 0.29
557 0.26
558 0.2
559 0.19
560 0.17
561 0.13
562 0.07
563 0.06
564 0.05
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.08
569 0.09
570 0.09
571 0.1
572 0.1
573 0.1
574 0.08
575 0.09
576 0.09
577 0.1
578 0.11
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.09
584 0.08
585 0.06
586 0.05
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.07
592 0.11
593 0.15
594 0.17
595 0.17
596 0.18
597 0.22
598 0.24
599 0.25
600 0.26
601 0.25
602 0.25
603 0.26
604 0.32
605 0.28
606 0.27
607 0.25
608 0.21
609 0.26
610 0.25
611 0.26
612 0.2
613 0.21
614 0.2
615 0.2
616 0.2
617 0.13
618 0.16
619 0.13
620 0.13
621 0.13
622 0.12
623 0.12
624 0.15
625 0.14
626 0.1
627 0.09
628 0.08
629 0.08
630 0.08
631 0.13
632 0.11
633 0.11
634 0.12
635 0.13
636 0.14
637 0.15
638 0.15
639 0.11
640 0.1
641 0.1
642 0.09
643 0.09
644 0.08
645 0.07
646 0.07
647 0.05
648 0.05
649 0.04
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.03
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.04
658 0.05
659 0.06
660 0.07
661 0.08
662 0.13
663 0.12
664 0.14
665 0.14
666 0.14
667 0.14
668 0.14
669 0.15
670 0.11
671 0.11
672 0.1
673 0.09
674 0.08
675 0.08
676 0.11
677 0.11
678 0.16
679 0.16
680 0.18
681 0.18
682 0.2
683 0.22
684 0.2
685 0.2
686 0.15
687 0.15
688 0.14
689 0.13
690 0.12
691 0.1
692 0.08
693 0.07
694 0.06
695 0.05
696 0.04
697 0.04
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.07
702 0.09
703 0.1
704 0.1
705 0.09
706 0.09
707 0.09
708 0.09
709 0.07
710 0.05
711 0.06
712 0.06
713 0.07
714 0.09
715 0.1
716 0.11
717 0.12
718 0.12
719 0.12
720 0.12
721 0.13
722 0.14
723 0.15
724 0.19
725 0.24
726 0.25
727 0.27
728 0.31
729 0.3
730 0.27
731 0.27
732 0.31
733 0.25
734 0.25
735 0.25
736 0.21
737 0.22
738 0.23
739 0.22
740 0.14
741 0.16
742 0.17
743 0.21
744 0.28
745 0.27
746 0.28
747 0.31
748 0.33
749 0.39
750 0.46
751 0.48
752 0.47
753 0.53
754 0.56
755 0.55
756 0.56
757 0.5
758 0.46
759 0.39
760 0.34
761 0.33
762 0.29
763 0.25
764 0.23
765 0.22
766 0.19
767 0.17
768 0.16
769 0.11
770 0.1
771 0.1
772 0.09
773 0.06
774 0.06
775 0.06
776 0.05
777 0.05
778 0.05
779 0.06
780 0.05
781 0.06
782 0.05
783 0.05
784 0.1
785 0.12
786 0.12
787 0.12
788 0.14
789 0.18
790 0.25
791 0.31
792 0.29
793 0.28
794 0.31
795 0.32
796 0.31
797 0.28
798 0.21
799 0.17
800 0.17
801 0.18
802 0.17
803 0.17
804 0.17
805 0.18
806 0.23
807 0.25
808 0.25
809 0.23
810 0.23
811 0.28
812 0.27
813 0.3
814 0.29
815 0.25
816 0.25
817 0.27
818 0.26
819 0.25
820 0.28
821 0.27
822 0.26
823 0.27
824 0.27
825 0.26
826 0.24
827 0.21
828 0.17
829 0.12
830 0.1
831 0.08
832 0.07
833 0.06
834 0.05
835 0.05
836 0.06
837 0.06
838 0.06
839 0.07
840 0.07
841 0.07
842 0.07
843 0.07
844 0.07
845 0.07
846 0.08
847 0.09
848 0.09
849 0.09
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.08
855 0.07
856 0.08
857 0.08
858 0.08
859 0.07
860 0.06
861 0.06
862 0.06
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.08
867 0.1
868 0.13
869 0.17
870 0.17
871 0.19
872 0.22
873 0.27
874 0.27
875 0.28
876 0.26
877 0.22
878 0.22
879 0.27
880 0.26
881 0.22
882 0.18
883 0.17
884 0.18
885 0.2
886 0.2
887 0.14
888 0.15
889 0.15
890 0.16
891 0.15
892 0.13
893 0.13
894 0.14
895 0.14
896 0.11
897 0.14
898 0.13
899 0.14
900 0.15
901 0.13
902 0.1
903 0.11
904 0.12
905 0.09
906 0.15
907 0.17
908 0.17
909 0.18
910 0.2
911 0.21
912 0.26
913 0.3
914 0.27
915 0.34
916 0.39
917 0.44
918 0.45
919 0.45
920 0.41
921 0.42
922 0.43
923 0.36
924 0.32
925 0.29
926 0.33
927 0.34
928 0.32
929 0.35
930 0.39
931 0.38
932 0.45
933 0.5
934 0.54
935 0.59
936 0.63
937 0.6
938 0.6
939 0.6
940 0.61
941 0.61
942 0.61
943 0.64
944 0.63
945 0.68
946 0.69
947 0.68
948 0.7
949 0.64
950 0.58
951 0.58
952 0.57
953 0.49
954 0.42
955 0.41
956 0.31
957 0.29
958 0.24
959 0.15
960 0.13
961 0.11
962 0.09
963 0.09
964 0.08
965 0.08
966 0.08
967 0.08
968 0.06
969 0.07
970 0.06
971 0.07
972 0.07
973 0.07
974 0.07
975 0.08
976 0.09
977 0.08
978 0.08
979 0.08
980 0.1
981 0.12
982 0.11
983 0.1
984 0.1
985 0.12
986 0.13
987 0.14
988 0.16
989 0.17
990 0.22
991 0.26
992 0.29
993 0.31
994 0.32
995 0.35
996 0.32
997 0.32
998 0.34
999 0.35
1000 0.36
1001 0.39
1002 0.42
1003 0.45
1004 0.47
1005 0.46
1006 0.41
1007 0.45
1008 0.48
1009 0.41
1010 0.4
1011 0.37
1012 0.41
1013 0.41
1014 0.42
1015 0.37
1016 0.34
1017 0.34
1018 0.31
1019 0.28
1020 0.23
1021 0.25
1022 0.25
1023 0.22
1024 0.21
1025 0.21
1026 0.26
1027 0.28
1028 0.35
1029 0.32
1030 0.36
1031 0.4
1032 0.44
1033 0.48
1034 0.51
1035 0.57
1036 0.59
1037 0.65
1038 0.67
1039 0.68
1040 0.66
1041 0.65
1042 0.64
1043 0.62
1044 0.6
1045 0.52
1046 0.48
1047 0.43
1048 0.4