Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179UBY3

Protein Details
Accession A0A179UBY3    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-65TEEFRRVKRKPTKSTQAPGSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 5, cyto 5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG bgh:BDBG_01849  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01717  Sm_B  
Amino Acid Sequences MSANKQGKMQNLINYRMRVTLTDGRQMTGQMLAFDKHMNLVLADTEEFRRVKRKPTKSTQAPGSSTPTLVEAEEKRTLGLTIVRGTHVVSCSVDGPPPADPAARLGTTVPGVSGAAAATLAAGPGISRPAGRGLPVGLGGPAAGVGGPPPPGGFGAFPPAGFPGAPPPGFPGRGGPPGGPPGFGPPPGFGGPGVPGGPPGGFQPPPGFQPPPGQGRGYPPPGFGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.49
3 0.44
4 0.4
5 0.33
6 0.34
7 0.35
8 0.32
9 0.38
10 0.37
11 0.36
12 0.36
13 0.35
14 0.28
15 0.23
16 0.2
17 0.13
18 0.14
19 0.14
20 0.14
21 0.15
22 0.14
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.15
34 0.15
35 0.16
36 0.23
37 0.24
38 0.34
39 0.43
40 0.52
41 0.58
42 0.68
43 0.77
44 0.79
45 0.84
46 0.82
47 0.79
48 0.71
49 0.64
50 0.6
51 0.49
52 0.4
53 0.33
54 0.25
55 0.19
56 0.16
57 0.18
58 0.13
59 0.16
60 0.18
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.13
66 0.14
67 0.12
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.12
75 0.11
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.12
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.07
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.06
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.19
155 0.22
156 0.23
157 0.23
158 0.22
159 0.22
160 0.26
161 0.27
162 0.24
163 0.23
164 0.29
165 0.29
166 0.25
167 0.21
168 0.23
169 0.24
170 0.25
171 0.24
172 0.18
173 0.22
174 0.22
175 0.23
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.15
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.14
188 0.14
189 0.16
190 0.2
191 0.21
192 0.25
193 0.3
194 0.3
195 0.27
196 0.35
197 0.4
198 0.42
199 0.43
200 0.41
201 0.38
202 0.44
203 0.5
204 0.5
205 0.44
206 0.39