Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6YTD8

Protein Details
Accession A0A5N6YTD8    Localization Confidence Low Confidence Score 7.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-55CTVTQWFKQHGKRLRDKDTDQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8.5cyto_nucl 8.5, cyto 7.5, mito 4, plas 2, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd08039  Adenylation_DNA_ligase_Fungal  
Amino Acid Sequences MGFKFSHLCDLLSSLENSRVLKATTDARNRDPDVCTVTQWFKQHGKRLRDKDTDQLAVLSCMFPEKRTDRVYWLQNTSLARVVGRCLLLGSSRREELERWRVSGGIDLAQCVENVMRQAENHVSDDQEVTVEEVDDALNRIASRCKFSGPRVRRQRGAVDVDEALSPLYRRLSSRDAKWLTRMILKCYSPVILPQTLILRSFHFLLPHLLLFQDSFEATLNMLASEPISHFPPHPELALARDLGIIAMQHLSPVVGVKIGRPDYYKARSLKHCCQMIGHRRMSIERKYDGEYCQIHIDLSKNSNPIQIFSKSGKDSTADRSGIHHVIRDSLMIGKSGCTFSRRCILEGELLVWSDRHGKIMDFHKLRKFIARSGTFIGTESDSAPQPYEHLMIVFFDILLLDDDICLKKPHRERRLLLKDVIQVMSGRAHIAEQWILDFCRSGSRSKLESIFAKGVAERWEGFVLKGCEDPYFTILPNRENGSSGRWIKLKKDYIPGLGDTVDLAIVGGRYDSRDAVGLKQIKKLLWTHFFIGCLVNKEAVLQSKSKPRFRLVDVINHPCMSAKNMQILNQFGEYSACGIDSGHGFDIEYGPGNIPRVDVIFKSPFVVEMLGSGFEKPSGASYYTLRFPRILKIHWDRSFEDAASFSELQLLAEDARAVPSDELSQEENEWNKRLKLGKASSKYLVNRSQSPASLSTGLTQSPVKGPIPNEATSSPMNRTSVQNCPRKSTERSSEGIHTKHPIPIYIDETMASMSSSDDSDIHGNFLTCNDNLSSHQDRHQQKTNSSTMDSSSNNKHNKPSDETENPNRSTPSERPATHTHSSIQIHKALTDPLTTQNPSRNSPNPPLPTHLITTNPPTTKEPNTTLPLTLIPKMNTFLKYLTSKPPHNHPKSTPTLGILLLNPTQTPLGPTLLELTTNLYKSLQTQSHPNSRPSAGKIFFLDSSFLDLGPGMADPRSHLPLTWEDVGRKYFYASISWSWGRMDEIPCTPMEECSKGGLNPRPRVSVGFDRGSLVVLGSVVNGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.23
3 0.25
4 0.25
5 0.25
6 0.24
7 0.23
8 0.23
9 0.24
10 0.28
11 0.35
12 0.43
13 0.46
14 0.5
15 0.56
16 0.58
17 0.59
18 0.53
19 0.49
20 0.47
21 0.43
22 0.39
23 0.38
24 0.39
25 0.4
26 0.41
27 0.43
28 0.45
29 0.51
30 0.58
31 0.62
32 0.67
33 0.73
34 0.78
35 0.82
36 0.82
37 0.78
38 0.78
39 0.76
40 0.69
41 0.59
42 0.52
43 0.43
44 0.36
45 0.33
46 0.23
47 0.15
48 0.18
49 0.17
50 0.16
51 0.23
52 0.25
53 0.31
54 0.36
55 0.39
56 0.41
57 0.49
58 0.56
59 0.56
60 0.57
61 0.51
62 0.52
63 0.51
64 0.46
65 0.41
66 0.33
67 0.27
68 0.23
69 0.23
70 0.22
71 0.21
72 0.18
73 0.15
74 0.15
75 0.19
76 0.23
77 0.27
78 0.28
79 0.29
80 0.3
81 0.32
82 0.33
83 0.38
84 0.43
85 0.41
86 0.39
87 0.38
88 0.37
89 0.36
90 0.38
91 0.3
92 0.25
93 0.21
94 0.19
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.15
99 0.14
100 0.1
101 0.11
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.16
106 0.21
107 0.23
108 0.24
109 0.23
110 0.23
111 0.23
112 0.23
113 0.19
114 0.14
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.1
128 0.16
129 0.19
130 0.24
131 0.24
132 0.3
133 0.33
134 0.42
135 0.52
136 0.53
137 0.62
138 0.67
139 0.73
140 0.72
141 0.72
142 0.71
143 0.68
144 0.67
145 0.58
146 0.5
147 0.43
148 0.39
149 0.34
150 0.26
151 0.18
152 0.13
153 0.11
154 0.09
155 0.12
156 0.12
157 0.14
158 0.19
159 0.28
160 0.33
161 0.38
162 0.46
163 0.49
164 0.5
165 0.53
166 0.52
167 0.47
168 0.48
169 0.46
170 0.41
171 0.43
172 0.41
173 0.39
174 0.36
175 0.34
176 0.26
177 0.27
178 0.27
179 0.21
180 0.2
181 0.21
182 0.23
183 0.22
184 0.23
185 0.2
186 0.17
187 0.17
188 0.19
189 0.19
190 0.16
191 0.16
192 0.19
193 0.2
194 0.18
195 0.17
196 0.14
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.09
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.16
219 0.2
220 0.2
221 0.19
222 0.19
223 0.18
224 0.2
225 0.21
226 0.18
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.07
233 0.05
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.15
246 0.17
247 0.18
248 0.2
249 0.23
250 0.29
251 0.34
252 0.4
253 0.37
254 0.42
255 0.5
256 0.56
257 0.62
258 0.62
259 0.61
260 0.54
261 0.55
262 0.58
263 0.59
264 0.6
265 0.54
266 0.47
267 0.45
268 0.5
269 0.52
270 0.48
271 0.43
272 0.37
273 0.37
274 0.38
275 0.4
276 0.37
277 0.37
278 0.32
279 0.28
280 0.28
281 0.25
282 0.22
283 0.2
284 0.21
285 0.17
286 0.2
287 0.21
288 0.21
289 0.21
290 0.25
291 0.24
292 0.24
293 0.25
294 0.22
295 0.23
296 0.23
297 0.28
298 0.26
299 0.26
300 0.25
301 0.23
302 0.24
303 0.26
304 0.3
305 0.26
306 0.25
307 0.27
308 0.3
309 0.32
310 0.29
311 0.26
312 0.19
313 0.2
314 0.2
315 0.17
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.13
326 0.14
327 0.16
328 0.24
329 0.24
330 0.23
331 0.24
332 0.25
333 0.26
334 0.25
335 0.24
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.12
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.18
347 0.24
348 0.33
349 0.31
350 0.36
351 0.4
352 0.42
353 0.42
354 0.44
355 0.41
356 0.36
357 0.42
358 0.39
359 0.36
360 0.37
361 0.38
362 0.3
363 0.28
364 0.25
365 0.16
366 0.15
367 0.13
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.06
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.16
396 0.25
397 0.35
398 0.43
399 0.51
400 0.54
401 0.64
402 0.73
403 0.7
404 0.63
405 0.57
406 0.51
407 0.46
408 0.42
409 0.31
410 0.21
411 0.18
412 0.17
413 0.13
414 0.09
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.11
428 0.13
429 0.14
430 0.16
431 0.2
432 0.21
433 0.24
434 0.26
435 0.23
436 0.23
437 0.26
438 0.24
439 0.2
440 0.19
441 0.16
442 0.16
443 0.15
444 0.15
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.15
451 0.14
452 0.13
453 0.14
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.13
458 0.11
459 0.11
460 0.1
461 0.13
462 0.14
463 0.15
464 0.16
465 0.17
466 0.15
467 0.15
468 0.16
469 0.16
470 0.21
471 0.22
472 0.22
473 0.24
474 0.25
475 0.27
476 0.34
477 0.36
478 0.33
479 0.38
480 0.37
481 0.37
482 0.37
483 0.34
484 0.27
485 0.22
486 0.18
487 0.11
488 0.09
489 0.06
490 0.04
491 0.04
492 0.03
493 0.02
494 0.02
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.06
502 0.07
503 0.08
504 0.14
505 0.19
506 0.2
507 0.23
508 0.25
509 0.23
510 0.25
511 0.27
512 0.27
513 0.26
514 0.27
515 0.27
516 0.26
517 0.26
518 0.24
519 0.23
520 0.18
521 0.16
522 0.15
523 0.13
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.13
528 0.14
529 0.12
530 0.15
531 0.23
532 0.3
533 0.34
534 0.35
535 0.36
536 0.39
537 0.41
538 0.47
539 0.4
540 0.43
541 0.44
542 0.46
543 0.44
544 0.39
545 0.36
546 0.28
547 0.26
548 0.2
549 0.18
550 0.14
551 0.19
552 0.2
553 0.23
554 0.24
555 0.25
556 0.23
557 0.2
558 0.18
559 0.12
560 0.12
561 0.09
562 0.08
563 0.06
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.08
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.12
588 0.13
589 0.13
590 0.14
591 0.14
592 0.13
593 0.12
594 0.12
595 0.08
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.05
605 0.06
606 0.07
607 0.08
608 0.1
609 0.11
610 0.14
611 0.19
612 0.21
613 0.2
614 0.2
615 0.2
616 0.26
617 0.28
618 0.27
619 0.31
620 0.38
621 0.46
622 0.49
623 0.52
624 0.46
625 0.47
626 0.46
627 0.38
628 0.3
629 0.21
630 0.17
631 0.18
632 0.16
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.11
637 0.11
638 0.1
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.05
643 0.05
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.07
649 0.07
650 0.09
651 0.1
652 0.1
653 0.1
654 0.13
655 0.16
656 0.17
657 0.2
658 0.2
659 0.19
660 0.23
661 0.26
662 0.27
663 0.32
664 0.38
665 0.45
666 0.48
667 0.52
668 0.5
669 0.52
670 0.52
671 0.49
672 0.49
673 0.43
674 0.42
675 0.42
676 0.42
677 0.36
678 0.36
679 0.31
680 0.27
681 0.25
682 0.21
683 0.18
684 0.17
685 0.16
686 0.15
687 0.13
688 0.12
689 0.12
690 0.15
691 0.14
692 0.16
693 0.17
694 0.22
695 0.27
696 0.26
697 0.27
698 0.25
699 0.27
700 0.26
701 0.27
702 0.22
703 0.21
704 0.21
705 0.21
706 0.24
707 0.25
708 0.33
709 0.4
710 0.45
711 0.44
712 0.48
713 0.51
714 0.53
715 0.56
716 0.55
717 0.55
718 0.52
719 0.52
720 0.5
721 0.52
722 0.52
723 0.47
724 0.41
725 0.36
726 0.32
727 0.34
728 0.31
729 0.25
730 0.23
731 0.25
732 0.26
733 0.23
734 0.22
735 0.19
736 0.18
737 0.17
738 0.13
739 0.1
740 0.06
741 0.05
742 0.06
743 0.06
744 0.06
745 0.06
746 0.08
747 0.1
748 0.1
749 0.11
750 0.11
751 0.11
752 0.1
753 0.12
754 0.13
755 0.1
756 0.12
757 0.11
758 0.12
759 0.14
760 0.21
761 0.25
762 0.24
763 0.3
764 0.37
765 0.42
766 0.48
767 0.55
768 0.53
769 0.52
770 0.57
771 0.57
772 0.51
773 0.47
774 0.41
775 0.34
776 0.34
777 0.32
778 0.29
779 0.31
780 0.37
781 0.41
782 0.42
783 0.47
784 0.49
785 0.53
786 0.55
787 0.54
788 0.55
789 0.56
790 0.61
791 0.64
792 0.65
793 0.61
794 0.57
795 0.52
796 0.45
797 0.44
798 0.4
799 0.37
800 0.38
801 0.37
802 0.4
803 0.46
804 0.51
805 0.47
806 0.46
807 0.41
808 0.39
809 0.42
810 0.41
811 0.38
812 0.35
813 0.33
814 0.31
815 0.31
816 0.26
817 0.24
818 0.2
819 0.18
820 0.19
821 0.23
822 0.24
823 0.25
824 0.3
825 0.33
826 0.36
827 0.41
828 0.41
829 0.43
830 0.5
831 0.56
832 0.55
833 0.54
834 0.56
835 0.54
836 0.51
837 0.47
838 0.41
839 0.35
840 0.32
841 0.36
842 0.37
843 0.34
844 0.34
845 0.36
846 0.39
847 0.41
848 0.44
849 0.42
850 0.42
851 0.45
852 0.44
853 0.4
854 0.37
855 0.35
856 0.33
857 0.31
858 0.29
859 0.26
860 0.26
861 0.28
862 0.31
863 0.28
864 0.27
865 0.24
866 0.26
867 0.28
868 0.3
869 0.37
870 0.4
871 0.45
872 0.48
873 0.58
874 0.63
875 0.67
876 0.71
877 0.67
878 0.69
879 0.7
880 0.71
881 0.62
882 0.53
883 0.48
884 0.41
885 0.37
886 0.29
887 0.24
888 0.2
889 0.19
890 0.16
891 0.15
892 0.15
893 0.13
894 0.14
895 0.13
896 0.13
897 0.13
898 0.13
899 0.16
900 0.15
901 0.16
902 0.14
903 0.17
904 0.19
905 0.19
906 0.2
907 0.17
908 0.17
909 0.2
910 0.27
911 0.26
912 0.24
913 0.33
914 0.41
915 0.5
916 0.55
917 0.55
918 0.52
919 0.52
920 0.55
921 0.51
922 0.53
923 0.44
924 0.43
925 0.42
926 0.4
927 0.38
928 0.34
929 0.3
930 0.21
931 0.25
932 0.22
933 0.2
934 0.16
935 0.15
936 0.13
937 0.12
938 0.12
939 0.07
940 0.07
941 0.07
942 0.1
943 0.15
944 0.19
945 0.19
946 0.19
947 0.22
948 0.26
949 0.32
950 0.35
951 0.33
952 0.31
953 0.35
954 0.38
955 0.36
956 0.32
957 0.28
958 0.25
959 0.23
960 0.24
961 0.24
962 0.24
963 0.29
964 0.3
965 0.29
966 0.26
967 0.26
968 0.26
969 0.28
970 0.27
971 0.25
972 0.27
973 0.28
974 0.27
975 0.29
976 0.27
977 0.26
978 0.28
979 0.26
980 0.24
981 0.26
982 0.29
983 0.28
984 0.36
985 0.4
986 0.45
987 0.51
988 0.54
989 0.55
990 0.53
991 0.55
992 0.54
993 0.55
994 0.53
995 0.48
996 0.44
997 0.42
998 0.4
999 0.38
1000 0.31
1001 0.21
1002 0.14
1003 0.1
1004 0.09