Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6YY40

Protein Details
Accession A0A5N6YY40    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-106VFHFWGTRKNRRKAREWAHAHHydrophilic
413-434KFLERERERGQKRSMKKYSKRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
363-434KIRHSREEEIKKLRRADEEEKAEERKLAAEKIKKEERERLLRGMTAEEQRKFLERERERGQKRSMKKYSKRG
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9, mito 6, nucl 5.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MAGLFKNVFGSQPSGPAKVEDDFADFVKVPEPSPASILAAAPAGVPASSTPGVVPYTKWYRVWERTSPKDFLQEAMVMPFILLIVVFHFWGTRKNRRKAREWAHAHAPALQNEFAVIGFNGIQKSADEAVSVLTSPDTILKEKTPQEFASYATGRQNVAFVDVAIKLPKRYNPITYWMDLVFGFLFESWSSPTETYEAIAYTFDGKEKDIVPVPAKDTSSLKVNNSSYDGFIWAIVHKNYMRQFRQDRYDASMTFTKENQTLPPWITVMTESAEITDALLTPELIQAVEKAGDDFKYLIVTDQPTDKPLKIEETVPRKRVHICLSLPSSAAGYTSSLPLFNQFLRFADRLVAVAHFRAEVMRKIRHSREEEIKKLRRADEEEKAEERKLAAEKIKKEERERLLRGMTAEEQRKFLERERERGQKRSMKKYSKRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.29
4 0.3
5 0.27
6 0.28
7 0.21
8 0.21
9 0.2
10 0.2
11 0.22
12 0.19
13 0.18
14 0.2
15 0.19
16 0.16
17 0.2
18 0.22
19 0.2
20 0.21
21 0.22
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.15
26 0.13
27 0.12
28 0.1
29 0.09
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.05
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.13
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.19
43 0.26
44 0.3
45 0.32
46 0.35
47 0.43
48 0.5
49 0.56
50 0.58
51 0.6
52 0.66
53 0.7
54 0.68
55 0.61
56 0.6
57 0.54
58 0.45
59 0.39
60 0.31
61 0.26
62 0.24
63 0.22
64 0.14
65 0.13
66 0.11
67 0.07
68 0.05
69 0.04
70 0.03
71 0.04
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.15
78 0.23
79 0.33
80 0.43
81 0.53
82 0.61
83 0.68
84 0.75
85 0.78
86 0.8
87 0.8
88 0.78
89 0.74
90 0.74
91 0.7
92 0.62
93 0.57
94 0.51
95 0.43
96 0.39
97 0.32
98 0.23
99 0.2
100 0.2
101 0.14
102 0.11
103 0.08
104 0.06
105 0.06
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.07
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.12
127 0.13
128 0.19
129 0.24
130 0.27
131 0.28
132 0.27
133 0.29
134 0.28
135 0.28
136 0.29
137 0.26
138 0.24
139 0.24
140 0.25
141 0.21
142 0.21
143 0.2
144 0.13
145 0.14
146 0.12
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.14
155 0.17
156 0.21
157 0.23
158 0.27
159 0.27
160 0.34
161 0.36
162 0.34
163 0.33
164 0.27
165 0.26
166 0.21
167 0.19
168 0.11
169 0.08
170 0.07
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.17
201 0.18
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.15
206 0.19
207 0.19
208 0.18
209 0.21
210 0.22
211 0.21
212 0.23
213 0.22
214 0.18
215 0.16
216 0.16
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.07
221 0.09
222 0.09
223 0.11
224 0.1
225 0.15
226 0.2
227 0.27
228 0.28
229 0.33
230 0.38
231 0.41
232 0.47
233 0.45
234 0.42
235 0.41
236 0.43
237 0.36
238 0.34
239 0.33
240 0.29
241 0.27
242 0.26
243 0.21
244 0.19
245 0.2
246 0.18
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.14
253 0.14
254 0.13
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.15
290 0.15
291 0.17
292 0.2
293 0.2
294 0.19
295 0.19
296 0.23
297 0.2
298 0.24
299 0.3
300 0.38
301 0.45
302 0.48
303 0.48
304 0.46
305 0.48
306 0.49
307 0.46
308 0.44
309 0.38
310 0.42
311 0.44
312 0.43
313 0.39
314 0.34
315 0.28
316 0.2
317 0.18
318 0.11
319 0.09
320 0.08
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.12
326 0.14
327 0.14
328 0.16
329 0.15
330 0.16
331 0.22
332 0.22
333 0.2
334 0.21
335 0.19
336 0.17
337 0.17
338 0.18
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.11
343 0.1
344 0.12
345 0.14
346 0.19
347 0.24
348 0.29
349 0.34
350 0.42
351 0.49
352 0.55
353 0.58
354 0.6
355 0.65
356 0.68
357 0.72
358 0.74
359 0.76
360 0.74
361 0.74
362 0.71
363 0.67
364 0.65
365 0.64
366 0.63
367 0.62
368 0.61
369 0.6
370 0.58
371 0.52
372 0.45
373 0.38
374 0.33
375 0.3
376 0.3
377 0.34
378 0.38
379 0.44
380 0.52
381 0.6
382 0.62
383 0.65
384 0.69
385 0.7
386 0.72
387 0.71
388 0.69
389 0.63
390 0.59
391 0.54
392 0.49
393 0.45
394 0.43
395 0.46
396 0.41
397 0.4
398 0.4
399 0.43
400 0.42
401 0.43
402 0.45
403 0.44
404 0.51
405 0.57
406 0.66
407 0.67
408 0.72
409 0.75
410 0.73
411 0.77
412 0.79
413 0.81
414 0.82