Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6Z7I7

Protein Details
Accession A0A5N6Z7I7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-441RRRRQVEERKLANEKRRKEEAQAREERARKRRRS
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 8, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSNKYPKIISPVIEEQPYEVNGEQIPVDATRPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPANEQEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAREADEKKEEFRKQFLKKSKEDQEIHEEVIQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRAAPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQESKARTCHLCGQAGHKAEECRGQAKEKNGQFDEKGKGTSLKPFIWLNVSILREYLAVELYVPHQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPVMEGYLTKDGHVDFKKAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQVEERKLANEKRRKEEAQAREERARKRRRSSPNYEAYEPPTSNRARGSGGGSGGGGDAAPPNGLELITPGRGELSRETRELTHSMVVNRGAVYRANMANKSAAAVLKSKLMKGSQDSDAPEESSPMPDADGPADNNPEPTSPSVLGKRKADGPEEETETPGNDAEPTPKPSKGDEMPPDTVRLWEEGYAERYYEQKFDVGPEDKEFRHKVARAYAEGLAWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIGDIDLSFEKGTPFKPFEQLMGVLPASSNHAIPEVFHDLMQDPNSEIIDFYPEDFAVDLNGKKFAWQGVILLPFIDETRLLAAMEKKYPLLSDEEKLRNTVGREVLLLSDGHPLYQDLVANFYSKKQGAPRYKLNMRISEGLAGKVERNETYIPHSSLVSSLEEYGMPTLEDDRSLMVNYEIPKSSHIHKSMLLRGVKFPPPALDNADIQATKAKAQHSGRSFGGAPLRNGHGNRGGRINYAGDRPNPFAAHLDPNFMPSGNAGAQMMPSGWVPPVPGSTNFSRGPPPPPRGGMSHQHRNTHGSGYSQQSSYQETNYGRGDYYGRGHQGHQHQGSHGNQSGQYNGRSSGYGGQEYRGGGSQRGGYQGQGQGRDHYSSRNQGGYGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.47
6 0.44
7 0.46
8 0.47
9 0.44
10 0.42
11 0.35
12 0.34
13 0.33
14 0.28
15 0.21
16 0.18
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.13
21 0.14
22 0.11
23 0.13
24 0.14
25 0.16
26 0.24
27 0.26
28 0.28
29 0.29
30 0.31
31 0.32
32 0.31
33 0.33
34 0.28
35 0.28
36 0.26
37 0.24
38 0.22
39 0.19
40 0.17
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.28
53 0.36
54 0.44
55 0.5
56 0.5
57 0.54
58 0.57
59 0.6
60 0.52
61 0.46
62 0.39
63 0.34
64 0.32
65 0.24
66 0.18
67 0.14
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.14
73 0.14
74 0.18
75 0.2
76 0.28
77 0.37
78 0.44
79 0.46
80 0.45
81 0.46
82 0.45
83 0.44
84 0.39
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.36
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.79
104 0.8
105 0.77
106 0.73
107 0.75
108 0.74
109 0.68
110 0.69
111 0.62
112 0.57
113 0.61
114 0.56
115 0.47
116 0.46
117 0.42
118 0.38
119 0.45
120 0.49
121 0.44
122 0.51
123 0.59
124 0.58
125 0.67
126 0.72
127 0.72
128 0.72
129 0.78
130 0.79
131 0.79
132 0.74
133 0.7
134 0.68
135 0.63
136 0.58
137 0.51
138 0.45
139 0.36
140 0.36
141 0.31
142 0.22
143 0.2
144 0.18
145 0.19
146 0.17
147 0.19
148 0.2
149 0.22
150 0.22
151 0.21
152 0.22
153 0.19
154 0.17
155 0.15
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.16
171 0.2
172 0.27
173 0.27
174 0.3
175 0.3
176 0.32
177 0.36
178 0.33
179 0.3
180 0.26
181 0.32
182 0.29
183 0.29
184 0.26
185 0.21
186 0.24
187 0.24
188 0.21
189 0.16
190 0.15
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.12
200 0.13
201 0.16
202 0.23
203 0.24
204 0.24
205 0.27
206 0.3
207 0.33
208 0.34
209 0.4
210 0.37
211 0.43
212 0.44
213 0.43
214 0.47
215 0.42
216 0.38
217 0.29
218 0.26
219 0.2
220 0.21
221 0.19
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.08
227 0.06
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.05
234 0.07
235 0.08
236 0.11
237 0.13
238 0.14
239 0.18
240 0.2
241 0.24
242 0.25
243 0.26
244 0.25
245 0.28
246 0.27
247 0.24
248 0.28
249 0.24
250 0.24
251 0.25
252 0.24
253 0.21
254 0.24
255 0.32
256 0.3
257 0.34
258 0.33
259 0.37
260 0.42
261 0.43
262 0.41
263 0.36
264 0.32
265 0.29
266 0.33
267 0.28
268 0.26
269 0.25
270 0.29
271 0.31
272 0.36
273 0.43
274 0.4
275 0.46
276 0.44
277 0.46
278 0.42
279 0.44
280 0.43
281 0.36
282 0.34
283 0.27
284 0.29
285 0.27
286 0.32
287 0.31
288 0.26
289 0.27
290 0.27
291 0.27
292 0.27
293 0.26
294 0.21
295 0.21
296 0.22
297 0.19
298 0.18
299 0.17
300 0.14
301 0.14
302 0.12
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.08
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.18
315 0.19
316 0.15
317 0.16
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.19
322 0.13
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.08
327 0.07
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.12
343 0.15
344 0.16
345 0.15
346 0.16
347 0.16
348 0.15
349 0.15
350 0.1
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.07
366 0.09
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.18
373 0.18
374 0.2
375 0.17
376 0.21
377 0.24
378 0.23
379 0.24
380 0.2
381 0.2
382 0.18
383 0.2
384 0.19
385 0.16
386 0.17
387 0.16
388 0.13
389 0.12
390 0.15
391 0.14
392 0.21
393 0.26
394 0.28
395 0.37
396 0.39
397 0.43
398 0.48
399 0.57
400 0.59
401 0.63
402 0.65
403 0.63
404 0.68
405 0.69
406 0.69
407 0.66
408 0.62
409 0.59
410 0.61
411 0.57
412 0.57
413 0.61
414 0.6
415 0.62
416 0.63
417 0.6
418 0.61
419 0.65
420 0.65
421 0.66
422 0.67
423 0.65
424 0.65
425 0.71
426 0.75
427 0.78
428 0.8
429 0.8
430 0.79
431 0.76
432 0.71
433 0.63
434 0.56
435 0.51
436 0.42
437 0.33
438 0.29
439 0.25
440 0.24
441 0.23
442 0.2
443 0.17
444 0.18
445 0.2
446 0.16
447 0.15
448 0.14
449 0.13
450 0.11
451 0.1
452 0.08
453 0.05
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.04
464 0.06
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.09
471 0.11
472 0.15
473 0.17
474 0.18
475 0.19
476 0.19
477 0.21
478 0.21
479 0.19
480 0.15
481 0.15
482 0.15
483 0.16
484 0.16
485 0.14
486 0.13
487 0.12
488 0.1
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.12
493 0.14
494 0.14
495 0.14
496 0.14
497 0.13
498 0.13
499 0.11
500 0.09
501 0.08
502 0.1
503 0.09
504 0.13
505 0.14
506 0.14
507 0.14
508 0.14
509 0.15
510 0.16
511 0.19
512 0.16
513 0.18
514 0.19
515 0.19
516 0.19
517 0.19
518 0.16
519 0.14
520 0.12
521 0.1
522 0.1
523 0.08
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.11
535 0.1
536 0.1
537 0.1
538 0.11
539 0.1
540 0.13
541 0.19
542 0.23
543 0.27
544 0.27
545 0.28
546 0.3
547 0.32
548 0.32
549 0.27
550 0.27
551 0.26
552 0.29
553 0.28
554 0.24
555 0.22
556 0.19
557 0.17
558 0.13
559 0.1
560 0.06
561 0.06
562 0.09
563 0.12
564 0.17
565 0.18
566 0.2
567 0.21
568 0.21
569 0.26
570 0.24
571 0.29
572 0.3
573 0.33
574 0.35
575 0.35
576 0.36
577 0.31
578 0.29
579 0.22
580 0.18
581 0.13
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.14
586 0.13
587 0.13
588 0.12
589 0.14
590 0.14
591 0.14
592 0.13
593 0.11
594 0.11
595 0.12
596 0.17
597 0.17
598 0.17
599 0.19
600 0.22
601 0.21
602 0.26
603 0.26
604 0.23
605 0.27
606 0.28
607 0.28
608 0.32
609 0.35
610 0.31
611 0.32
612 0.31
613 0.24
614 0.22
615 0.19
616 0.12
617 0.09
618 0.07
619 0.04
620 0.03
621 0.03
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.06
626 0.07
627 0.07
628 0.12
629 0.16
630 0.15
631 0.19
632 0.2
633 0.25
634 0.28
635 0.3
636 0.28
637 0.24
638 0.24
639 0.21
640 0.2
641 0.15
642 0.12
643 0.09
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.06
648 0.05
649 0.05
650 0.04
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.06
657 0.07
658 0.08
659 0.12
660 0.15
661 0.16
662 0.2
663 0.2
664 0.21
665 0.22
666 0.22
667 0.18
668 0.18
669 0.16
670 0.12
671 0.11
672 0.1
673 0.11
674 0.11
675 0.1
676 0.08
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.14
681 0.15
682 0.15
683 0.14
684 0.15
685 0.15
686 0.17
687 0.18
688 0.14
689 0.1
690 0.1
691 0.11
692 0.1
693 0.09
694 0.07
695 0.09
696 0.09
697 0.09
698 0.09
699 0.09
700 0.09
701 0.09
702 0.08
703 0.07
704 0.09
705 0.1
706 0.09
707 0.11
708 0.11
709 0.11
710 0.13
711 0.12
712 0.12
713 0.11
714 0.12
715 0.14
716 0.16
717 0.15
718 0.14
719 0.13
720 0.11
721 0.11
722 0.1
723 0.06
724 0.05
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.09
729 0.13
730 0.15
731 0.17
732 0.18
733 0.17
734 0.17
735 0.17
736 0.16
737 0.18
738 0.18
739 0.2
740 0.27
741 0.32
742 0.32
743 0.33
744 0.32
745 0.29
746 0.28
747 0.29
748 0.23
749 0.19
750 0.19
751 0.18
752 0.18
753 0.16
754 0.14
755 0.1
756 0.14
757 0.13
758 0.12
759 0.12
760 0.12
761 0.12
762 0.14
763 0.14
764 0.09
765 0.11
766 0.12
767 0.13
768 0.13
769 0.14
770 0.17
771 0.16
772 0.19
773 0.23
774 0.33
775 0.41
776 0.48
777 0.55
778 0.6
779 0.64
780 0.71
781 0.69
782 0.65
783 0.6
784 0.57
785 0.49
786 0.45
787 0.4
788 0.32
789 0.28
790 0.23
791 0.2
792 0.18
793 0.19
794 0.14
795 0.16
796 0.16
797 0.16
798 0.22
799 0.26
800 0.25
801 0.24
802 0.24
803 0.21
804 0.22
805 0.22
806 0.17
807 0.13
808 0.12
809 0.11
810 0.11
811 0.11
812 0.11
813 0.09
814 0.07
815 0.07
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.08
820 0.09
821 0.1
822 0.1
823 0.1
824 0.09
825 0.12
826 0.14
827 0.17
828 0.17
829 0.17
830 0.19
831 0.21
832 0.26
833 0.31
834 0.32
835 0.31
836 0.33
837 0.39
838 0.44
839 0.48
840 0.47
841 0.4
842 0.42
843 0.45
844 0.46
845 0.41
846 0.35
847 0.32
848 0.3
849 0.31
850 0.31
851 0.28
852 0.24
853 0.24
854 0.26
855 0.23
856 0.21
857 0.23
858 0.19
859 0.19
860 0.21
861 0.21
862 0.26
863 0.3
864 0.38
865 0.38
866 0.42
867 0.39
868 0.4
869 0.4
870 0.35
871 0.39
872 0.34
873 0.32
874 0.31
875 0.34
876 0.35
877 0.34
878 0.35
879 0.36
880 0.35
881 0.36
882 0.38
883 0.36
884 0.33
885 0.34
886 0.34
887 0.28
888 0.31
889 0.33
890 0.31
891 0.34
892 0.35
893 0.37
894 0.34
895 0.32
896 0.29
897 0.29
898 0.33
899 0.29
900 0.31
901 0.27
902 0.29
903 0.29
904 0.26
905 0.22
906 0.14
907 0.17
908 0.13
909 0.14
910 0.12
911 0.11
912 0.11
913 0.11
914 0.11
915 0.08
916 0.08
917 0.08
918 0.08
919 0.08
920 0.09
921 0.1
922 0.13
923 0.15
924 0.17
925 0.22
926 0.25
927 0.3
928 0.3
929 0.31
930 0.33
931 0.33
932 0.39
933 0.43
934 0.46
935 0.47
936 0.49
937 0.5
938 0.51
939 0.54
940 0.55
941 0.56
942 0.61
943 0.6
944 0.62
945 0.61
946 0.61
947 0.57
948 0.51
949 0.44
950 0.38
951 0.37
952 0.39
953 0.4
954 0.36
955 0.36
956 0.32
957 0.37
958 0.34
959 0.3
960 0.3
961 0.28
962 0.32
963 0.32
964 0.32
965 0.26
966 0.26
967 0.26
968 0.23
969 0.26
970 0.28
971 0.3
972 0.3
973 0.32
974 0.38
975 0.44
976 0.5
977 0.51
978 0.47
979 0.45
980 0.51
981 0.52
982 0.52
983 0.47
984 0.4
985 0.37
986 0.37
987 0.4
988 0.37
989 0.36
990 0.31
991 0.29
992 0.27
993 0.25
994 0.26
995 0.27
996 0.27
997 0.3
998 0.29
999 0.28
1000 0.3
1001 0.29
1002 0.29
1003 0.27
1004 0.24
1005 0.2
1006 0.23
1007 0.26
1008 0.25
1009 0.29
1010 0.28
1011 0.25
1012 0.29
1013 0.33
1014 0.35
1015 0.36
1016 0.35
1017 0.36
1018 0.39
1019 0.42
1020 0.37
1021 0.38
1022 0.41
1023 0.44
1024 0.47
1025 0.45
1026 0.42