Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6YTR1

Protein Details
Accession A0A5N6YTR1    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1196-1217TKDGSIQPSKRKEKQGAFLQPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1206-1209RKEK
1216-1239PAGPIKRPQQPGSRGGRRGGLGMK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd12299  RRM4_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MMDINSLLSPQDSNSQSGRSSPTVGPASVSNPSMPSTGPSQKPLRKSRAGQTRQGMTSSPLAQHVFAPPHVSEPSPPAISPTVGPSIGGGSGTPPAADLPPPRQPSTPGMDTLADLASMQHHQPQRSSAPLLRNTESYESQLSPSTMYPHVSSVAHNTPTPRSSFDIAMSDGPSEAARRNYMDTSLVPNAQRLATELFTQIQENPQSHDAHVNFVRLLHAGFVNHVYPPNNPDIHGNPRKYDLLKDMRTAREEMDKLFAMGEDLWAEWIQDESMLAQTVDERIAVMELCQRSVEEEYGSTKLWSIYGEWVLYLYNSAHGEGGPNQWTEEDRMIGREVFSWQSVLDVWQRGAEATRWRIHDSHLVWDRLLDLQMQDTARNPTQEKIGHVRGLFDIRLQTPHANWDQTFQTFSGFVSTYYNANYEKIMADTAGRYATACKEKYSAREEFEIRLRNATESGDLTLEWNIFTEYIEWEVSNNHRKRHSHFDLVNAVYQRAVLRYPTDADRWEDLVMFLIDESMHGNANTTTISTLDRATRHCPCSGTLWSQYLLSSEREGQSFAKIADIKHKATSTGLLDAGGMEEVLKVHTAWCSYLRRRAFMPDSTDEDLDVAEVGIRSAIESVQELGEKKYGRSYQGDPLFRLERIYIRYLSESGSWDSARETFKGLVGRRGNSYEFWLTYYEWELISWSKFVQGEATVDAARRTPNPSYATAVLKQAIKRTDLDWPEKIMQTYIAHCEDYEDSEELQLAILETRKAMRAVTARRERDARELAAQQAQQAPGSGQAPHPEKRKREEETSVNGLPAKRARGEEEALSAEAESTALQRDRENATVVVKNLPHQITEHKVRQFFRHCGTINSVRMLPGDENSAVAVIEFNSKDEALVAQTRDQKSIDDNTIEVQLGSCPTLFVANFPPEADETYIRDLFHESGEVIDVRFPSLKYNTHRRFCYVQFKTLEAADSATKLDGTTVGNNLKLVAKISDPSQKQDRCGPMYEGREVHVSNIHWKANEDDLRELFAKYGTVELVRIPKKVDGGSKGFGYIVFSSKEEATAALAMHEQEYRSRALHVKISTPQSAKRSSTTIVSRVGKSQSPAAEVNGHRKSADTDGRSGDRAARTLGLMNIPDTVNDARVRALVEPYGNLVKIVLRPDHQGAIVEFTNVSHAGRASLELEGQEIVPGRKLHVGTVPEMLKQSAETKDGSIQPSKRKEKQGAFLQPAGPIKRPQQPGSRGGRRGGLGMKRAALLSHGESRAHDGEKMMTTTMMTTDSAPSAEGGKTKKSNGDFRAMIQRGREE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.26
4 0.3
5 0.34
6 0.28
7 0.32
8 0.29
9 0.34
10 0.35
11 0.34
12 0.32
13 0.28
14 0.29
15 0.28
16 0.28
17 0.21
18 0.19
19 0.21
20 0.2
21 0.19
22 0.18
23 0.22
24 0.29
25 0.32
26 0.37
27 0.46
28 0.51
29 0.61
30 0.68
31 0.7
32 0.7
33 0.73
34 0.76
35 0.78
36 0.78
37 0.77
38 0.75
39 0.74
40 0.67
41 0.62
42 0.53
43 0.46
44 0.45
45 0.39
46 0.32
47 0.29
48 0.28
49 0.27
50 0.27
51 0.3
52 0.27
53 0.25
54 0.27
55 0.23
56 0.26
57 0.27
58 0.26
59 0.22
60 0.24
61 0.29
62 0.26
63 0.26
64 0.26
65 0.26
66 0.26
67 0.25
68 0.24
69 0.22
70 0.21
71 0.21
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.1
77 0.08
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.14
85 0.18
86 0.22
87 0.31
88 0.36
89 0.39
90 0.39
91 0.42
92 0.44
93 0.48
94 0.45
95 0.38
96 0.36
97 0.33
98 0.32
99 0.3
100 0.24
101 0.16
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.17
108 0.21
109 0.24
110 0.26
111 0.31
112 0.33
113 0.36
114 0.41
115 0.4
116 0.44
117 0.49
118 0.53
119 0.5
120 0.47
121 0.46
122 0.45
123 0.41
124 0.36
125 0.33
126 0.28
127 0.27
128 0.28
129 0.24
130 0.21
131 0.21
132 0.22
133 0.2
134 0.21
135 0.2
136 0.19
137 0.21
138 0.2
139 0.2
140 0.23
141 0.27
142 0.28
143 0.28
144 0.29
145 0.31
146 0.33
147 0.34
148 0.31
149 0.29
150 0.3
151 0.3
152 0.3
153 0.28
154 0.27
155 0.27
156 0.24
157 0.2
158 0.17
159 0.16
160 0.14
161 0.12
162 0.14
163 0.15
164 0.16
165 0.18
166 0.22
167 0.22
168 0.23
169 0.24
170 0.23
171 0.26
172 0.27
173 0.29
174 0.26
175 0.26
176 0.26
177 0.24
178 0.22
179 0.18
180 0.18
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.18
186 0.19
187 0.17
188 0.19
189 0.22
190 0.22
191 0.25
192 0.27
193 0.27
194 0.27
195 0.34
196 0.29
197 0.32
198 0.33
199 0.3
200 0.26
201 0.25
202 0.25
203 0.18
204 0.18
205 0.12
206 0.12
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.16
213 0.15
214 0.16
215 0.19
216 0.24
217 0.23
218 0.23
219 0.26
220 0.29
221 0.38
222 0.45
223 0.44
224 0.4
225 0.43
226 0.47
227 0.44
228 0.43
229 0.41
230 0.42
231 0.43
232 0.47
233 0.49
234 0.49
235 0.5
236 0.48
237 0.41
238 0.39
239 0.37
240 0.33
241 0.3
242 0.26
243 0.24
244 0.23
245 0.2
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.16
280 0.16
281 0.12
282 0.12
283 0.15
284 0.16
285 0.17
286 0.15
287 0.14
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.07
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.12
307 0.12
308 0.16
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.16
314 0.17
315 0.17
316 0.15
317 0.13
318 0.15
319 0.16
320 0.16
321 0.15
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.12
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.18
340 0.22
341 0.26
342 0.28
343 0.31
344 0.31
345 0.32
346 0.37
347 0.32
348 0.36
349 0.38
350 0.37
351 0.34
352 0.33
353 0.31
354 0.25
355 0.24
356 0.15
357 0.09
358 0.09
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.17
364 0.18
365 0.21
366 0.22
367 0.2
368 0.25
369 0.27
370 0.29
371 0.31
372 0.33
373 0.33
374 0.32
375 0.32
376 0.29
377 0.29
378 0.25
379 0.19
380 0.18
381 0.16
382 0.17
383 0.18
384 0.18
385 0.15
386 0.21
387 0.22
388 0.22
389 0.21
390 0.23
391 0.23
392 0.22
393 0.23
394 0.18
395 0.16
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.11
400 0.1
401 0.12
402 0.13
403 0.12
404 0.13
405 0.15
406 0.12
407 0.13
408 0.13
409 0.11
410 0.1
411 0.1
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.13
422 0.18
423 0.19
424 0.19
425 0.22
426 0.24
427 0.3
428 0.34
429 0.33
430 0.29
431 0.34
432 0.34
433 0.34
434 0.38
435 0.38
436 0.33
437 0.32
438 0.3
439 0.26
440 0.25
441 0.22
442 0.18
443 0.12
444 0.13
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.09
450 0.08
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.09
462 0.15
463 0.24
464 0.26
465 0.29
466 0.35
467 0.38
468 0.43
469 0.52
470 0.52
471 0.52
472 0.5
473 0.52
474 0.52
475 0.5
476 0.48
477 0.38
478 0.32
479 0.23
480 0.22
481 0.16
482 0.11
483 0.1
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.12
488 0.13
489 0.15
490 0.16
491 0.18
492 0.19
493 0.19
494 0.18
495 0.16
496 0.14
497 0.13
498 0.11
499 0.08
500 0.06
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.04
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.05
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.07
517 0.08
518 0.1
519 0.12
520 0.15
521 0.2
522 0.25
523 0.26
524 0.27
525 0.27
526 0.25
527 0.29
528 0.3
529 0.29
530 0.26
531 0.25
532 0.24
533 0.23
534 0.21
535 0.18
536 0.16
537 0.13
538 0.11
539 0.12
540 0.13
541 0.13
542 0.14
543 0.13
544 0.13
545 0.13
546 0.12
547 0.13
548 0.13
549 0.13
550 0.21
551 0.24
552 0.24
553 0.25
554 0.25
555 0.22
556 0.21
557 0.24
558 0.16
559 0.15
560 0.13
561 0.11
562 0.1
563 0.1
564 0.09
565 0.06
566 0.05
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.04
572 0.03
573 0.04
574 0.05
575 0.06
576 0.07
577 0.11
578 0.17
579 0.2
580 0.27
581 0.28
582 0.29
583 0.29
584 0.34
585 0.34
586 0.31
587 0.34
588 0.29
589 0.33
590 0.33
591 0.32
592 0.26
593 0.22
594 0.18
595 0.13
596 0.1
597 0.05
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.04
608 0.04
609 0.05
610 0.06
611 0.07
612 0.07
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.16
617 0.17
618 0.18
619 0.21
620 0.24
621 0.28
622 0.35
623 0.36
624 0.32
625 0.34
626 0.32
627 0.29
628 0.27
629 0.19
630 0.15
631 0.16
632 0.18
633 0.15
634 0.15
635 0.16
636 0.15
637 0.16
638 0.14
639 0.13
640 0.11
641 0.12
642 0.11
643 0.1
644 0.11
645 0.13
646 0.13
647 0.12
648 0.12
649 0.11
650 0.13
651 0.18
652 0.18
653 0.23
654 0.25
655 0.25
656 0.25
657 0.27
658 0.26
659 0.21
660 0.24
661 0.18
662 0.15
663 0.15
664 0.15
665 0.13
666 0.13
667 0.14
668 0.11
669 0.1
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.07
676 0.08
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.08
681 0.09
682 0.09
683 0.1
684 0.08
685 0.09
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.12
691 0.12
692 0.17
693 0.19
694 0.2
695 0.23
696 0.24
697 0.26
698 0.24
699 0.24
700 0.21
701 0.21
702 0.2
703 0.21
704 0.2
705 0.19
706 0.19
707 0.19
708 0.24
709 0.26
710 0.29
711 0.26
712 0.28
713 0.29
714 0.29
715 0.28
716 0.21
717 0.19
718 0.16
719 0.16
720 0.16
721 0.15
722 0.14
723 0.14
724 0.15
725 0.13
726 0.14
727 0.14
728 0.11
729 0.1
730 0.1
731 0.1
732 0.08
733 0.08
734 0.06
735 0.04
736 0.04
737 0.05
738 0.05
739 0.05
740 0.06
741 0.07
742 0.08
743 0.08
744 0.11
745 0.16
746 0.22
747 0.31
748 0.39
749 0.4
750 0.42
751 0.45
752 0.43
753 0.44
754 0.42
755 0.33
756 0.29
757 0.28
758 0.28
759 0.29
760 0.27
761 0.22
762 0.21
763 0.19
764 0.15
765 0.14
766 0.12
767 0.1
768 0.11
769 0.11
770 0.09
771 0.14
772 0.18
773 0.23
774 0.31
775 0.36
776 0.39
777 0.45
778 0.52
779 0.51
780 0.53
781 0.55
782 0.53
783 0.52
784 0.54
785 0.48
786 0.41
787 0.38
788 0.32
789 0.28
790 0.25
791 0.21
792 0.17
793 0.18
794 0.2
795 0.22
796 0.24
797 0.22
798 0.21
799 0.2
800 0.18
801 0.17
802 0.13
803 0.1
804 0.08
805 0.07
806 0.05
807 0.04
808 0.06
809 0.08
810 0.08
811 0.09
812 0.12
813 0.15
814 0.17
815 0.18
816 0.17
817 0.19
818 0.21
819 0.21
820 0.21
821 0.19
822 0.19
823 0.23
824 0.22
825 0.19
826 0.18
827 0.22
828 0.24
829 0.31
830 0.36
831 0.35
832 0.4
833 0.41
834 0.47
835 0.5
836 0.48
837 0.45
838 0.46
839 0.42
840 0.4
841 0.45
842 0.44
843 0.4
844 0.37
845 0.34
846 0.27
847 0.26
848 0.25
849 0.19
850 0.13
851 0.13
852 0.11
853 0.11
854 0.1
855 0.1
856 0.08
857 0.07
858 0.07
859 0.04
860 0.08
861 0.08
862 0.08
863 0.09
864 0.09
865 0.09
866 0.09
867 0.09
868 0.08
869 0.11
870 0.12
871 0.15
872 0.23
873 0.24
874 0.25
875 0.25
876 0.24
877 0.24
878 0.28
879 0.26
880 0.2
881 0.19
882 0.19
883 0.2
884 0.19
885 0.15
886 0.11
887 0.08
888 0.08
889 0.08
890 0.07
891 0.06
892 0.06
893 0.08
894 0.07
895 0.08
896 0.12
897 0.14
898 0.14
899 0.14
900 0.15
901 0.14
902 0.16
903 0.16
904 0.13
905 0.14
906 0.18
907 0.2
908 0.19
909 0.19
910 0.19
911 0.18
912 0.16
913 0.15
914 0.1
915 0.09
916 0.1
917 0.1
918 0.08
919 0.09
920 0.08
921 0.09
922 0.11
923 0.11
924 0.14
925 0.17
926 0.23
927 0.28
928 0.4
929 0.47
930 0.53
931 0.55
932 0.55
933 0.57
934 0.57
935 0.62
936 0.54
937 0.53
938 0.48
939 0.48
940 0.44
941 0.39
942 0.34
943 0.23
944 0.21
945 0.14
946 0.12
947 0.11
948 0.1
949 0.09
950 0.08
951 0.08
952 0.08
953 0.09
954 0.1
955 0.14
956 0.15
957 0.16
958 0.16
959 0.17
960 0.16
961 0.15
962 0.14
963 0.12
964 0.11
965 0.12
966 0.16
967 0.23
968 0.23
969 0.28
970 0.36
971 0.37
972 0.38
973 0.45
974 0.48
975 0.44
976 0.46
977 0.46
978 0.43
979 0.45
980 0.46
981 0.39
982 0.34
983 0.34
984 0.31
985 0.27
986 0.24
987 0.21
988 0.24
989 0.28
990 0.28
991 0.25
992 0.26
993 0.27
994 0.32
995 0.34
996 0.3
997 0.29
998 0.28
999 0.31
1000 0.31
1001 0.29
1002 0.21
1003 0.17
1004 0.15
1005 0.11
1006 0.12
1007 0.09
1008 0.09
1009 0.09
1010 0.11
1011 0.19
1012 0.21
1013 0.22
1014 0.23
1015 0.24
1016 0.26
1017 0.29
1018 0.32
1019 0.29
1020 0.32
1021 0.34
1022 0.33
1023 0.31
1024 0.29
1025 0.25
1026 0.23
1027 0.18
1028 0.16
1029 0.15
1030 0.15
1031 0.16
1032 0.16
1033 0.17
1034 0.14
1035 0.12
1036 0.11
1037 0.11
1038 0.1
1039 0.09
1040 0.09
1041 0.09
1042 0.1
1043 0.11
1044 0.1
1045 0.11
1046 0.13
1047 0.14
1048 0.14
1049 0.17
1050 0.21
1051 0.23
1052 0.29
1053 0.29
1054 0.32
1055 0.36
1056 0.41
1057 0.44
1058 0.43
1059 0.45
1060 0.44
1061 0.48
1062 0.46
1063 0.42
1064 0.41
1065 0.36
1066 0.4
1067 0.39
1068 0.38
1069 0.4
1070 0.41
1071 0.4
1072 0.41
1073 0.43
1074 0.38
1075 0.35
1076 0.36
1077 0.3
1078 0.3
1079 0.3
1080 0.28
1081 0.32
1082 0.32
1083 0.39
1084 0.38
1085 0.36
1086 0.32
1087 0.32
1088 0.33
1089 0.33
1090 0.39
1091 0.33
1092 0.33
1093 0.37
1094 0.4
1095 0.4
1096 0.38
1097 0.35
1098 0.3
1099 0.28
1100 0.26
1101 0.21
1102 0.2
1103 0.21
1104 0.22
1105 0.19
1106 0.17
1107 0.16
1108 0.17
1109 0.16
1110 0.15
1111 0.16
1112 0.15
1113 0.16
1114 0.16
1115 0.16
1116 0.15
1117 0.16
1118 0.17
1119 0.15
1120 0.17
1121 0.16
1122 0.16
1123 0.16
1124 0.19
1125 0.2
1126 0.19
1127 0.17
1128 0.15
1129 0.15
1130 0.17
1131 0.21
1132 0.21
1133 0.2
1134 0.24
1135 0.27
1136 0.29
1137 0.27
1138 0.27
1139 0.23
1140 0.25
1141 0.23
1142 0.19
1143 0.16
1144 0.14
1145 0.16
1146 0.14
1147 0.14
1148 0.1
1149 0.1
1150 0.1
1151 0.11
1152 0.12
1153 0.11
1154 0.12
1155 0.12
1156 0.11
1157 0.12
1158 0.11
1159 0.1
1160 0.11
1161 0.12
1162 0.12
1163 0.15
1164 0.16
1165 0.17
1166 0.22
1167 0.22
1168 0.23
1169 0.26
1170 0.28
1171 0.26
1172 0.32
1173 0.32
1174 0.29
1175 0.3
1176 0.28
1177 0.22
1178 0.21
1179 0.24
1180 0.2
1181 0.21
1182 0.2
1183 0.2
1184 0.26
1185 0.3
1186 0.33
1187 0.36
1188 0.39
1189 0.47
1190 0.56
1191 0.64
1192 0.66
1193 0.71
1194 0.77
1195 0.77
1196 0.81
1197 0.82
1198 0.81
1199 0.78
1200 0.74
1201 0.66
1202 0.61
1203 0.59
1204 0.53
1205 0.46
1206 0.41
1207 0.42
1208 0.46
1209 0.51
1210 0.53
1211 0.56
1212 0.6
1213 0.65
1214 0.71
1215 0.74
1216 0.69
1217 0.65
1218 0.64
1219 0.55
1220 0.53
1221 0.51
1222 0.47
1223 0.43
1224 0.42
1225 0.4
1226 0.36
1227 0.36
1228 0.31
1229 0.25
1230 0.23
1231 0.22
1232 0.26
1233 0.27
1234 0.26
1235 0.27
1236 0.33
1237 0.36
1238 0.33
1239 0.3
1240 0.23
1241 0.26
1242 0.29
1243 0.29
1244 0.24
1245 0.2
1246 0.18
1247 0.18
1248 0.17
1249 0.15
1250 0.12
1251 0.12
1252 0.13
1253 0.14
1254 0.14
1255 0.13
1256 0.13
1257 0.14
1258 0.15
1259 0.18
1260 0.19
1261 0.27
1262 0.31
1263 0.34
1264 0.41
1265 0.46
1266 0.53
1267 0.53
1268 0.59
1269 0.52
1270 0.53
1271 0.6
1272 0.56
1273 0.51