Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6ZDI3

Protein Details
Accession A0A5N6ZDI3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-27SEDDGTTPRKKRKITPPKAAPYMLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-16RKKRKI
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MVSEDDGTTPRKKRKITPPKAAPYMLRPLFDQVPLTADDPNDDVHITCVEYWNDNLYIGTSAAEILHFVCLPPDPSDNSNEPSFILASRLPIPFSRNTSATKRQQGIQQILLLPSVNKACILCNGTATFYLLPELSPAFRENTKVNNCCWIGGLDRNVPMDEPERPVVMIATQNKMMLVRIGDDARLVRNIEFPGCLTASRRGIIACAADTHAYSLLDVEHQQKIPLFPMSFFDEALASGQVEDMPPASLSPSSSPVEGQSHGRSPSLNTFAGMLQPNAPSASQDRASSVTPELSPTSGTPTRSRSKERGGSISPNMSSEHPSHDSPSSPRETPEPLPSLPKQPPAQLKPHILSPTSSEFLLVRGTEETEPGVGMFVNVDGDVVRGTITFHRYPESVVIDKGDENNLIGAPNDTRDDLILAVVEADRDGQPRKFLEVQLWDVDPGEAENHKSWIEIPSIQDSQPSHIGLLHTLTPSQLEIREMGGLLQMVRLRTPSLSPHVPATDPRTQASIEQLQKEKELFDSQEATDTEGSKKDTPDWEAERNTDEAKFARELGKTQSSLVLWSGNQIWRVVRNPLTTQLNDALQNAQESREGGHSLLKRDVIVDIFKMVQEAEPRSEAEFLGLNYVKQKSSLLLFGDLVSMDPTVRDGTTIDATEKALVAGELDPRVALLLVPLLRQEVLQGPQGIWIHAGLAEIAEVYLKRLEDVKGARGSDVFDSGILNMVKRFLLGWQQKRGYGSITDDAYIFDSVDAALLHLLLEQDSSIAPEERLSSSTRSELNRLVDNWKGNFDRAVALLETYQRLFLLSRLYQSQKMSRNVLKTWRRIIEGEEDFGGETTALGIEAQMRRYLVKIKDAQLVEDYGSWLARRNPRLGIQYTQYADDLLSYYLDTVLSVLETSPAARESLSESYSTYRALQPPKPTYMNFITENTPSESWWQSRLRLLQLLGGGGSSQFSSVPSPKFTYSIPAVLARIEPFQNELVSESIILDGLQGRHREALHLLTHGLGDYDSAVRYCLFGGPQSTSSTSTLAEFAERSHQCELFGYLLDEFLHIQDPSECIERTSDLLARFASWFDVGEVLRLVPDHWSVDILSGFLAHVFRVLLSQSRETRIERTLSAGLNLRVGTEYIEGVEKVGGWVEDGEGLRRLKDGNTRLTVPVDDGDDFGDMVEPPGGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.78
3 0.81
4 0.84
5 0.85
6 0.87
7 0.88
8 0.82
9 0.75
10 0.7
11 0.7
12 0.62
13 0.52
14 0.44
15 0.42
16 0.41
17 0.38
18 0.34
19 0.24
20 0.23
21 0.24
22 0.23
23 0.2
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.12
35 0.16
36 0.17
37 0.18
38 0.19
39 0.21
40 0.21
41 0.2
42 0.19
43 0.16
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.13
59 0.15
60 0.18
61 0.2
62 0.23
63 0.29
64 0.32
65 0.34
66 0.33
67 0.3
68 0.27
69 0.25
70 0.24
71 0.18
72 0.17
73 0.14
74 0.16
75 0.2
76 0.21
77 0.21
78 0.22
79 0.26
80 0.29
81 0.34
82 0.36
83 0.35
84 0.39
85 0.46
86 0.53
87 0.58
88 0.62
89 0.59
90 0.58
91 0.61
92 0.64
93 0.62
94 0.56
95 0.51
96 0.44
97 0.41
98 0.38
99 0.32
100 0.24
101 0.21
102 0.19
103 0.15
104 0.14
105 0.13
106 0.14
107 0.19
108 0.22
109 0.19
110 0.21
111 0.22
112 0.22
113 0.22
114 0.23
115 0.18
116 0.15
117 0.16
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.1
123 0.12
124 0.13
125 0.15
126 0.16
127 0.2
128 0.21
129 0.29
130 0.38
131 0.39
132 0.39
133 0.45
134 0.44
135 0.41
136 0.39
137 0.31
138 0.26
139 0.29
140 0.32
141 0.27
142 0.29
143 0.3
144 0.29
145 0.27
146 0.26
147 0.24
148 0.22
149 0.22
150 0.22
151 0.21
152 0.2
153 0.2
154 0.18
155 0.17
156 0.21
157 0.2
158 0.21
159 0.22
160 0.22
161 0.22
162 0.22
163 0.2
164 0.16
165 0.13
166 0.12
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.17
172 0.16
173 0.18
174 0.17
175 0.15
176 0.18
177 0.19
178 0.19
179 0.18
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.22
186 0.23
187 0.23
188 0.23
189 0.19
190 0.2
191 0.21
192 0.19
193 0.13
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.12
206 0.14
207 0.17
208 0.17
209 0.18
210 0.2
211 0.21
212 0.22
213 0.25
214 0.22
215 0.18
216 0.21
217 0.25
218 0.24
219 0.23
220 0.21
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.13
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.17
244 0.19
245 0.2
246 0.22
247 0.22
248 0.25
249 0.26
250 0.26
251 0.24
252 0.24
253 0.29
254 0.3
255 0.26
256 0.22
257 0.22
258 0.22
259 0.26
260 0.24
261 0.18
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.14
267 0.12
268 0.13
269 0.17
270 0.16
271 0.16
272 0.17
273 0.19
274 0.2
275 0.2
276 0.19
277 0.17
278 0.15
279 0.17
280 0.16
281 0.15
282 0.15
283 0.13
284 0.19
285 0.2
286 0.22
287 0.24
288 0.3
289 0.37
290 0.41
291 0.48
292 0.47
293 0.53
294 0.58
295 0.59
296 0.59
297 0.55
298 0.56
299 0.53
300 0.51
301 0.42
302 0.36
303 0.33
304 0.27
305 0.26
306 0.22
307 0.23
308 0.22
309 0.23
310 0.24
311 0.24
312 0.26
313 0.25
314 0.3
315 0.29
316 0.27
317 0.27
318 0.27
319 0.31
320 0.31
321 0.35
322 0.33
323 0.29
324 0.34
325 0.35
326 0.39
327 0.38
328 0.41
329 0.36
330 0.39
331 0.47
332 0.46
333 0.51
334 0.5
335 0.52
336 0.47
337 0.51
338 0.47
339 0.38
340 0.34
341 0.31
342 0.3
343 0.25
344 0.24
345 0.19
346 0.17
347 0.17
348 0.17
349 0.13
350 0.09
351 0.09
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.07
359 0.07
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.03
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.08
375 0.13
376 0.14
377 0.15
378 0.17
379 0.18
380 0.19
381 0.21
382 0.23
383 0.19
384 0.18
385 0.18
386 0.17
387 0.18
388 0.18
389 0.15
390 0.11
391 0.09
392 0.1
393 0.09
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.07
415 0.1
416 0.11
417 0.14
418 0.14
419 0.19
420 0.2
421 0.2
422 0.23
423 0.25
424 0.27
425 0.26
426 0.25
427 0.21
428 0.19
429 0.18
430 0.13
431 0.09
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.11
440 0.12
441 0.13
442 0.13
443 0.14
444 0.17
445 0.19
446 0.19
447 0.21
448 0.19
449 0.2
450 0.2
451 0.19
452 0.14
453 0.14
454 0.15
455 0.12
456 0.13
457 0.12
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.1
482 0.11
483 0.15
484 0.17
485 0.17
486 0.19
487 0.19
488 0.19
489 0.2
490 0.24
491 0.25
492 0.24
493 0.24
494 0.23
495 0.22
496 0.22
497 0.25
498 0.26
499 0.23
500 0.25
501 0.27
502 0.27
503 0.27
504 0.27
505 0.23
506 0.17
507 0.16
508 0.13
509 0.13
510 0.15
511 0.13
512 0.18
513 0.17
514 0.17
515 0.16
516 0.16
517 0.15
518 0.15
519 0.17
520 0.15
521 0.15
522 0.16
523 0.18
524 0.19
525 0.24
526 0.26
527 0.28
528 0.28
529 0.28
530 0.27
531 0.26
532 0.24
533 0.19
534 0.16
535 0.12
536 0.13
537 0.12
538 0.12
539 0.14
540 0.14
541 0.15
542 0.18
543 0.21
544 0.19
545 0.19
546 0.2
547 0.16
548 0.17
549 0.16
550 0.12
551 0.08
552 0.09
553 0.11
554 0.1
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.12
559 0.14
560 0.16
561 0.17
562 0.18
563 0.18
564 0.23
565 0.26
566 0.23
567 0.24
568 0.22
569 0.2
570 0.18
571 0.18
572 0.14
573 0.11
574 0.11
575 0.09
576 0.08
577 0.07
578 0.07
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.13
584 0.14
585 0.16
586 0.17
587 0.16
588 0.15
589 0.15
590 0.15
591 0.11
592 0.1
593 0.08
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.06
599 0.07
600 0.09
601 0.1
602 0.1
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.13
607 0.11
608 0.1
609 0.09
610 0.08
611 0.11
612 0.11
613 0.1
614 0.12
615 0.13
616 0.12
617 0.12
618 0.12
619 0.09
620 0.1
621 0.13
622 0.11
623 0.11
624 0.11
625 0.11
626 0.11
627 0.1
628 0.09
629 0.07
630 0.06
631 0.04
632 0.04
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.07
639 0.08
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.09
646 0.07
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.05
658 0.04
659 0.03
660 0.05
661 0.05
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.08
669 0.09
670 0.12
671 0.12
672 0.12
673 0.15
674 0.16
675 0.15
676 0.12
677 0.11
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.04
682 0.04
683 0.04
684 0.03
685 0.03
686 0.03
687 0.03
688 0.04
689 0.05
690 0.05
691 0.06
692 0.08
693 0.09
694 0.13
695 0.15
696 0.19
697 0.21
698 0.22
699 0.22
700 0.2
701 0.21
702 0.17
703 0.16
704 0.11
705 0.08
706 0.08
707 0.08
708 0.11
709 0.1
710 0.1
711 0.08
712 0.09
713 0.09
714 0.09
715 0.09
716 0.06
717 0.16
718 0.24
719 0.3
720 0.36
721 0.38
722 0.4
723 0.41
724 0.4
725 0.33
726 0.26
727 0.24
728 0.2
729 0.19
730 0.18
731 0.17
732 0.16
733 0.16
734 0.14
735 0.1
736 0.06
737 0.06
738 0.05
739 0.06
740 0.05
741 0.04
742 0.04
743 0.04
744 0.04
745 0.04
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.03
750 0.04
751 0.04
752 0.05
753 0.05
754 0.06
755 0.06
756 0.07
757 0.09
758 0.09
759 0.11
760 0.12
761 0.13
762 0.14
763 0.17
764 0.2
765 0.2
766 0.22
767 0.25
768 0.26
769 0.28
770 0.28
771 0.28
772 0.28
773 0.3
774 0.28
775 0.28
776 0.26
777 0.24
778 0.23
779 0.21
780 0.18
781 0.15
782 0.16
783 0.11
784 0.1
785 0.11
786 0.11
787 0.12
788 0.11
789 0.1
790 0.08
791 0.09
792 0.09
793 0.09
794 0.13
795 0.13
796 0.15
797 0.19
798 0.22
799 0.25
800 0.28
801 0.34
802 0.36
803 0.39
804 0.43
805 0.44
806 0.45
807 0.45
808 0.52
809 0.53
810 0.52
811 0.55
812 0.52
813 0.5
814 0.46
815 0.45
816 0.44
817 0.38
818 0.33
819 0.26
820 0.23
821 0.2
822 0.19
823 0.17
824 0.07
825 0.05
826 0.04
827 0.04
828 0.04
829 0.03
830 0.03
831 0.08
832 0.1
833 0.11
834 0.12
835 0.12
836 0.13
837 0.14
838 0.22
839 0.19
840 0.26
841 0.3
842 0.33
843 0.39
844 0.39
845 0.39
846 0.33
847 0.32
848 0.25
849 0.2
850 0.17
851 0.11
852 0.11
853 0.1
854 0.11
855 0.17
856 0.23
857 0.26
858 0.28
859 0.32
860 0.36
861 0.43
862 0.43
863 0.4
864 0.37
865 0.39
866 0.37
867 0.35
868 0.29
869 0.23
870 0.2
871 0.16
872 0.14
873 0.08
874 0.08
875 0.06
876 0.06
877 0.06
878 0.06
879 0.06
880 0.05
881 0.04
882 0.04
883 0.04
884 0.04
885 0.05
886 0.05
887 0.05
888 0.06
889 0.07
890 0.07
891 0.07
892 0.07
893 0.11
894 0.14
895 0.15
896 0.14
897 0.15
898 0.17
899 0.18
900 0.19
901 0.17
902 0.18
903 0.24
904 0.3
905 0.34
906 0.4
907 0.45
908 0.49
909 0.51
910 0.47
911 0.48
912 0.46
913 0.45
914 0.39
915 0.36
916 0.33
917 0.3
918 0.32
919 0.3
920 0.25
921 0.21
922 0.22
923 0.24
924 0.22
925 0.28
926 0.28
927 0.27
928 0.32
929 0.36
930 0.35
931 0.35
932 0.34
933 0.3
934 0.28
935 0.26
936 0.2
937 0.16
938 0.12
939 0.09
940 0.09
941 0.06
942 0.05
943 0.05
944 0.06
945 0.1
946 0.15
947 0.17
948 0.2
949 0.24
950 0.25
951 0.26
952 0.26
953 0.28
954 0.26
955 0.26
956 0.25
957 0.23
958 0.22
959 0.22
960 0.23
961 0.18
962 0.18
963 0.16
964 0.15
965 0.15
966 0.16
967 0.15
968 0.14
969 0.14
970 0.12
971 0.12
972 0.12
973 0.1
974 0.08
975 0.08
976 0.07
977 0.06
978 0.08
979 0.1
980 0.14
981 0.15
982 0.16
983 0.2
984 0.2
985 0.21
986 0.21
987 0.23
988 0.21
989 0.21
990 0.21
991 0.18
992 0.18
993 0.16
994 0.14
995 0.09
996 0.07
997 0.07
998 0.08
999 0.08
1000 0.08
1001 0.09
1002 0.09
1003 0.09
1004 0.1
1005 0.1
1006 0.1
1007 0.12
1008 0.14
1009 0.17
1010 0.19
1011 0.21
1012 0.22
1013 0.23
1014 0.24
1015 0.23
1016 0.21
1017 0.18
1018 0.17
1019 0.15
1020 0.14
1021 0.12
1022 0.12
1023 0.2
1024 0.2
1025 0.23
1026 0.26
1027 0.26
1028 0.25
1029 0.26
1030 0.27
1031 0.19
1032 0.2
1033 0.17
1034 0.14
1035 0.14
1036 0.14
1037 0.13
1038 0.11
1039 0.1
1040 0.12
1041 0.1
1042 0.11
1043 0.11
1044 0.12
1045 0.15
1046 0.18
1047 0.17
1048 0.16
1049 0.18
1050 0.18
1051 0.19
1052 0.21
1053 0.22
1054 0.19
1055 0.21
1056 0.21
1057 0.21
1058 0.2
1059 0.18
1060 0.17
1061 0.13
1062 0.12
1063 0.11
1064 0.14
1065 0.13
1066 0.13
1067 0.13
1068 0.12
1069 0.12
1070 0.11
1071 0.11
1072 0.1
1073 0.12
1074 0.12
1075 0.12
1076 0.13
1077 0.13
1078 0.15
1079 0.15
1080 0.12
1081 0.1
1082 0.09
1083 0.09
1084 0.09
1085 0.09
1086 0.06
1087 0.07
1088 0.07
1089 0.07
1090 0.08
1091 0.1
1092 0.14
1093 0.18
1094 0.25
1095 0.28
1096 0.33
1097 0.37
1098 0.38
1099 0.41
1100 0.41
1101 0.4
1102 0.34
1103 0.35
1104 0.35
1105 0.32
1106 0.33
1107 0.34
1108 0.3
1109 0.29
1110 0.28
1111 0.24
1112 0.2
1113 0.19
1114 0.18
1115 0.13
1116 0.13
1117 0.11
1118 0.13
1119 0.12
1120 0.12
1121 0.12
1122 0.1
1123 0.09
1124 0.11
1125 0.09
1126 0.08
1127 0.09
1128 0.08
1129 0.12
1130 0.13
1131 0.15
1132 0.19
1133 0.19
1134 0.19
1135 0.2
1136 0.21
1137 0.21
1138 0.3
1139 0.34
1140 0.38
1141 0.43
1142 0.46
1143 0.47
1144 0.48
1145 0.45
1146 0.38
1147 0.33
1148 0.27
1149 0.22
1150 0.19
1151 0.18
1152 0.16
1153 0.15
1154 0.12
1155 0.12
1156 0.09
1157 0.09