Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6YY17

Protein Details
Accession A0A5N6YY17    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
863-883AQSGKPSPSQVRRRCVRCCEIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10, cyto 7.5, pero 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021665  Mediator_Med16  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF11635  Med16  
Amino Acid Sequences MIMDDGINVDDLFGESASLELGLPSTATTSTSTKGFAQRLDEMRLLGCCQKIAWSKQGCIAYISQDTLRVNLRHLECRPSDGKWVLSEDTPLHPVVEAHGGQPLVHLCWNEIGSELAVVDSSGRVSIYNIAISLNSLAGQRQAAFDPIDDGAQMVGMTWLNIKRPVHAFNVAAMVQGRRAYSPFRRRPIGPFHPAGKAALLCITRSGMMRLLYQNPDNKWAEISAELKNASYSDRLLTHAALVATQNGILIVTYSACQKIYFYRVQINWTPPQWDPSQLKQAPNQFPTPNFRFMHCKVEAPCIIPSASRNGEETPNDLVTSANPLYCLTRLDIVLAAHDNSAGLTTNPWIIAVFSIPPHATPDPSQQQSPSSVIVRWQLESAPQVLHPKFDEVTSKKNNAQIKPKSMLRRLEDMYCDRYVITIEQTEHGNVLAVTYDDNTVTFYDPKTMAVLNGSDDTNTLTSLAQAGFHYPPDSASGLHISFSPSGCNAVTLDGEGQAQLRVMEHSYGAENGLYDENKFSAAVASLTLAFCRGCGSEFNTDDILLILKRQLSSDAQVSFINEVYRALGVNCNYTQENDKLMSHQYLPKCLSIQAALGFIDKYKSRNFASNVPWTILQLRHASVLYALFLQYLKGGVQAEPPDPDAIRILLGNTKWALDLLHYVLNELLDLADELESLLSDQEAFAQKLKTINSLPLIILLSSMSRAFLRFICRGLRGIHAGYATAPVTGDSGVYYAEIYQTLDKSPVRIDVYEKLLAGVDSTVRHVYHGAGFGDNERPGPEKELLVNGRIHPVLVTAVSTILRQTVPALKPEIDRMAIYIGDYSWLGLGSDRRAELYRRTRDVDIIKKIPFRSTTSVGSDEAQSGKPSPSQVRRRCVRCCEIMYGAYPPRPMLSSRMMYKLGYVRYCICGGGWTLETDFNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.05
7 0.04
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.07
13 0.07
14 0.08
15 0.11
16 0.13
17 0.15
18 0.17
19 0.19
20 0.22
21 0.29
22 0.31
23 0.31
24 0.34
25 0.4
26 0.44
27 0.47
28 0.43
29 0.37
30 0.35
31 0.34
32 0.31
33 0.27
34 0.24
35 0.19
36 0.18
37 0.25
38 0.31
39 0.35
40 0.41
41 0.42
42 0.43
43 0.49
44 0.52
45 0.45
46 0.4
47 0.37
48 0.32
49 0.29
50 0.29
51 0.24
52 0.25
53 0.24
54 0.24
55 0.3
56 0.26
57 0.26
58 0.31
59 0.35
60 0.39
61 0.41
62 0.46
63 0.4
64 0.46
65 0.47
66 0.41
67 0.45
68 0.4
69 0.4
70 0.35
71 0.38
72 0.33
73 0.31
74 0.32
75 0.26
76 0.26
77 0.26
78 0.23
79 0.19
80 0.18
81 0.17
82 0.16
83 0.19
84 0.17
85 0.15
86 0.18
87 0.17
88 0.17
89 0.19
90 0.18
91 0.14
92 0.16
93 0.15
94 0.13
95 0.17
96 0.17
97 0.15
98 0.15
99 0.14
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.12
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.09
146 0.11
147 0.13
148 0.19
149 0.19
150 0.22
151 0.27
152 0.3
153 0.31
154 0.34
155 0.32
156 0.29
157 0.32
158 0.27
159 0.24
160 0.22
161 0.18
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.14
167 0.2
168 0.29
169 0.4
170 0.47
171 0.52
172 0.56
173 0.58
174 0.63
175 0.67
176 0.66
177 0.62
178 0.58
179 0.55
180 0.54
181 0.52
182 0.46
183 0.38
184 0.28
185 0.22
186 0.21
187 0.18
188 0.14
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.14
195 0.15
196 0.18
197 0.2
198 0.24
199 0.27
200 0.3
201 0.34
202 0.32
203 0.38
204 0.36
205 0.33
206 0.29
207 0.26
208 0.23
209 0.21
210 0.22
211 0.18
212 0.19
213 0.18
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.15
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.15
227 0.14
228 0.12
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.12
247 0.18
248 0.2
249 0.22
250 0.28
251 0.29
252 0.34
253 0.38
254 0.4
255 0.39
256 0.37
257 0.38
258 0.31
259 0.33
260 0.29
261 0.32
262 0.31
263 0.32
264 0.41
265 0.42
266 0.44
267 0.45
268 0.54
269 0.53
270 0.52
271 0.51
272 0.43
273 0.42
274 0.48
275 0.47
276 0.45
277 0.39
278 0.38
279 0.41
280 0.41
281 0.46
282 0.39
283 0.39
284 0.33
285 0.4
286 0.39
287 0.34
288 0.32
289 0.25
290 0.24
291 0.2
292 0.19
293 0.18
294 0.19
295 0.17
296 0.18
297 0.18
298 0.22
299 0.22
300 0.23
301 0.2
302 0.19
303 0.18
304 0.16
305 0.14
306 0.11
307 0.15
308 0.13
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.09
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.14
349 0.21
350 0.26
351 0.28
352 0.29
353 0.26
354 0.27
355 0.28
356 0.27
357 0.22
358 0.16
359 0.15
360 0.16
361 0.2
362 0.19
363 0.17
364 0.16
365 0.14
366 0.14
367 0.15
368 0.14
369 0.1
370 0.11
371 0.17
372 0.16
373 0.17
374 0.16
375 0.17
376 0.16
377 0.17
378 0.23
379 0.19
380 0.27
381 0.31
382 0.33
383 0.34
384 0.39
385 0.44
386 0.42
387 0.5
388 0.47
389 0.49
390 0.5
391 0.53
392 0.55
393 0.55
394 0.56
395 0.5
396 0.49
397 0.45
398 0.43
399 0.41
400 0.37
401 0.34
402 0.28
403 0.25
404 0.19
405 0.17
406 0.15
407 0.12
408 0.11
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.1
415 0.09
416 0.08
417 0.06
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.05
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.07
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.07
459 0.08
460 0.09
461 0.1
462 0.08
463 0.08
464 0.1
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.09
469 0.1
470 0.09
471 0.09
472 0.07
473 0.09
474 0.08
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.11
524 0.16
525 0.17
526 0.19
527 0.19
528 0.18
529 0.18
530 0.16
531 0.14
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.08
538 0.1
539 0.1
540 0.12
541 0.16
542 0.15
543 0.15
544 0.15
545 0.16
546 0.14
547 0.14
548 0.12
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.09
556 0.09
557 0.12
558 0.12
559 0.14
560 0.14
561 0.15
562 0.18
563 0.16
564 0.18
565 0.16
566 0.17
567 0.16
568 0.18
569 0.18
570 0.17
571 0.22
572 0.21
573 0.24
574 0.26
575 0.25
576 0.24
577 0.23
578 0.22
579 0.17
580 0.17
581 0.13
582 0.12
583 0.11
584 0.11
585 0.1
586 0.09
587 0.11
588 0.1
589 0.12
590 0.13
591 0.17
592 0.18
593 0.25
594 0.28
595 0.33
596 0.37
597 0.43
598 0.42
599 0.39
600 0.37
601 0.32
602 0.32
603 0.26
604 0.23
605 0.18
606 0.17
607 0.17
608 0.17
609 0.16
610 0.13
611 0.13
612 0.1
613 0.08
614 0.08
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.07
622 0.08
623 0.08
624 0.11
625 0.14
626 0.15
627 0.15
628 0.16
629 0.16
630 0.15
631 0.15
632 0.12
633 0.1
634 0.1
635 0.09
636 0.09
637 0.11
638 0.11
639 0.12
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.11
644 0.1
645 0.08
646 0.1
647 0.1
648 0.12
649 0.12
650 0.12
651 0.12
652 0.12
653 0.11
654 0.09
655 0.06
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.04
666 0.03
667 0.03
668 0.03
669 0.07
670 0.1
671 0.11
672 0.13
673 0.14
674 0.16
675 0.19
676 0.2
677 0.21
678 0.19
679 0.22
680 0.22
681 0.23
682 0.21
683 0.2
684 0.19
685 0.15
686 0.14
687 0.1
688 0.08
689 0.08
690 0.08
691 0.07
692 0.07
693 0.08
694 0.09
695 0.12
696 0.17
697 0.18
698 0.2
699 0.23
700 0.24
701 0.26
702 0.27
703 0.28
704 0.25
705 0.25
706 0.24
707 0.21
708 0.19
709 0.17
710 0.17
711 0.14
712 0.1
713 0.09
714 0.07
715 0.08
716 0.08
717 0.07
718 0.05
719 0.05
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.05
724 0.06
725 0.06
726 0.07
727 0.09
728 0.1
729 0.11
730 0.15
731 0.15
732 0.16
733 0.17
734 0.21
735 0.22
736 0.22
737 0.25
738 0.26
739 0.31
740 0.31
741 0.29
742 0.24
743 0.22
744 0.21
745 0.18
746 0.13
747 0.1
748 0.09
749 0.11
750 0.13
751 0.12
752 0.13
753 0.13
754 0.14
755 0.16
756 0.19
757 0.18
758 0.16
759 0.17
760 0.18
761 0.22
762 0.21
763 0.18
764 0.16
765 0.18
766 0.18
767 0.22
768 0.22
769 0.2
770 0.21
771 0.29
772 0.29
773 0.29
774 0.31
775 0.28
776 0.3
777 0.28
778 0.26
779 0.18
780 0.17
781 0.15
782 0.12
783 0.12
784 0.08
785 0.09
786 0.09
787 0.1
788 0.09
789 0.1
790 0.09
791 0.09
792 0.12
793 0.19
794 0.2
795 0.24
796 0.27
797 0.28
798 0.29
799 0.34
800 0.34
801 0.27
802 0.26
803 0.23
804 0.22
805 0.19
806 0.18
807 0.14
808 0.1
809 0.1
810 0.1
811 0.09
812 0.07
813 0.07
814 0.07
815 0.08
816 0.11
817 0.13
818 0.17
819 0.17
820 0.19
821 0.21
822 0.24
823 0.32
824 0.4
825 0.46
826 0.48
827 0.52
828 0.52
829 0.56
830 0.62
831 0.61
832 0.6
833 0.57
834 0.57
835 0.59
836 0.58
837 0.57
838 0.52
839 0.49
840 0.47
841 0.46
842 0.46
843 0.45
844 0.46
845 0.41
846 0.39
847 0.34
848 0.29
849 0.27
850 0.23
851 0.2
852 0.2
853 0.21
854 0.22
855 0.26
856 0.33
857 0.4
858 0.5
859 0.57
860 0.65
861 0.73
862 0.78
863 0.82
864 0.82
865 0.79
866 0.77
867 0.73
868 0.69
869 0.64
870 0.58
871 0.52
872 0.49
873 0.46
874 0.4
875 0.36
876 0.31
877 0.28
878 0.27
879 0.27
880 0.26
881 0.29
882 0.33
883 0.37
884 0.42
885 0.41
886 0.4
887 0.43
888 0.44
889 0.43
890 0.38
891 0.37
892 0.35
893 0.37
894 0.38
895 0.33
896 0.26
897 0.22
898 0.21
899 0.22
900 0.2
901 0.18
902 0.19