Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6ZFD0

Protein Details
Accession A0A5N6ZFD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
664-683LPHARPPSRGHPRPPPPGYPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
661-698PSPLPHARPPSRGHPRPPPPGYPGRPGSRPGTPGPPGP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0030695  F:GTPase regulator activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
cd09397  LIM1_UF1  
Amino Acid Sequences MAATMDIGLLPTIKCSNCGRSVEISVMGDHVCEPMLVSATPPPPPPKSHSPSKSMGRSGIPPPIDPSKANQPFMRLEAVMRSKGDITPFPGGRLSPPRQLLRSQTTPLPTDLRSSDQDEIPKFPLPRSMSQQRSKTMVPLDNPYKALPVPQDQETVQPLKSIRLPLGEEAVAPPPLPKDDVPGPLPTFSHKHSYSTDSRSSYRTSIASSRYDSRRSTSMSIRRPSFGSMAHQYKFMDDAPPLPSMIPSGLLHDSTTPTFSESTILHNGVKSGEDQEIRPSALRVSSHTSSDRLSSTRGSAELFFRSPTLSSAGTSSELPDFSPTSPTDLPSIEYRAYKSPGLPHPQPPALGNYVGPSEMLRKNSDAISEGGLSITNFARELGLDDLDSLAESSTGSSDSSPSDTRSGTSLSSIASDVSLSRRNPSDQGQLGTLVDDLKQRNSPDEMMLDRLEPPRMPDPLFSPDSPTDPAISAGSVSLIRDKPSPDAKENRPEPPPTMSPTRERAARAAPRPKGPCRGCSEMIFGKSVSSADGRLTGRYHRACFVCYDCKTPFKTADFYVMDDHPYCAQHYHQRNGSLCHTCRTGIEGEYLETVERRGHGPADSYKFHPDCLTCRTCQVVLKGDYFEWNGQVYCERDARRAAASVPPAPRFQRPGPGLLPPSPLPHARPPSRGHPRPPPPGYPGRPGSRPGTPGPPGPPGPPMTRLPPPSAFDGPYGAASDSSRRFPARRTTKLMMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.23
3 0.3
4 0.35
5 0.39
6 0.4
7 0.41
8 0.43
9 0.42
10 0.4
11 0.34
12 0.27
13 0.25
14 0.21
15 0.16
16 0.14
17 0.12
18 0.09
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.1
23 0.09
24 0.1
25 0.16
26 0.19
27 0.22
28 0.26
29 0.3
30 0.33
31 0.38
32 0.44
33 0.49
34 0.53
35 0.61
36 0.63
37 0.63
38 0.67
39 0.72
40 0.72
41 0.65
42 0.63
43 0.56
44 0.55
45 0.52
46 0.52
47 0.44
48 0.37
49 0.38
50 0.4
51 0.39
52 0.35
53 0.37
54 0.4
55 0.46
56 0.49
57 0.45
58 0.44
59 0.44
60 0.45
61 0.44
62 0.33
63 0.27
64 0.31
65 0.34
66 0.32
67 0.3
68 0.29
69 0.27
70 0.28
71 0.31
72 0.25
73 0.25
74 0.31
75 0.31
76 0.3
77 0.3
78 0.29
79 0.32
80 0.38
81 0.38
82 0.37
83 0.43
84 0.47
85 0.48
86 0.53
87 0.54
88 0.54
89 0.54
90 0.5
91 0.48
92 0.47
93 0.46
94 0.45
95 0.41
96 0.33
97 0.32
98 0.3
99 0.3
100 0.29
101 0.31
102 0.32
103 0.31
104 0.36
105 0.34
106 0.36
107 0.34
108 0.36
109 0.32
110 0.3
111 0.35
112 0.33
113 0.37
114 0.42
115 0.49
116 0.53
117 0.61
118 0.66
119 0.62
120 0.62
121 0.57
122 0.53
123 0.5
124 0.47
125 0.41
126 0.44
127 0.45
128 0.43
129 0.44
130 0.39
131 0.34
132 0.29
133 0.29
134 0.24
135 0.26
136 0.26
137 0.26
138 0.28
139 0.27
140 0.3
141 0.31
142 0.3
143 0.24
144 0.23
145 0.22
146 0.22
147 0.26
148 0.25
149 0.22
150 0.23
151 0.24
152 0.22
153 0.25
154 0.22
155 0.19
156 0.18
157 0.19
158 0.15
159 0.13
160 0.13
161 0.11
162 0.12
163 0.14
164 0.12
165 0.16
166 0.2
167 0.24
168 0.26
169 0.29
170 0.29
171 0.28
172 0.28
173 0.26
174 0.25
175 0.23
176 0.29
177 0.25
178 0.28
179 0.29
180 0.35
181 0.38
182 0.41
183 0.45
184 0.4
185 0.42
186 0.41
187 0.41
188 0.36
189 0.33
190 0.27
191 0.25
192 0.26
193 0.28
194 0.29
195 0.29
196 0.35
197 0.37
198 0.4
199 0.38
200 0.37
201 0.37
202 0.38
203 0.39
204 0.4
205 0.45
206 0.49
207 0.54
208 0.53
209 0.51
210 0.48
211 0.46
212 0.39
213 0.31
214 0.29
215 0.29
216 0.33
217 0.31
218 0.32
219 0.29
220 0.28
221 0.28
222 0.23
223 0.17
224 0.12
225 0.14
226 0.14
227 0.15
228 0.15
229 0.13
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.08
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.13
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.12
248 0.1
249 0.14
250 0.16
251 0.17
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.14
256 0.15
257 0.11
258 0.1
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.16
263 0.16
264 0.17
265 0.16
266 0.15
267 0.12
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.19
272 0.19
273 0.21
274 0.22
275 0.23
276 0.21
277 0.22
278 0.21
279 0.15
280 0.16
281 0.14
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.12
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.09
309 0.12
310 0.11
311 0.15
312 0.15
313 0.16
314 0.16
315 0.15
316 0.16
317 0.15
318 0.17
319 0.14
320 0.15
321 0.16
322 0.17
323 0.19
324 0.18
325 0.18
326 0.22
327 0.26
328 0.32
329 0.33
330 0.35
331 0.37
332 0.38
333 0.37
334 0.31
335 0.28
336 0.23
337 0.21
338 0.16
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.07
344 0.1
345 0.12
346 0.14
347 0.14
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.17
352 0.13
353 0.12
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.06
386 0.08
387 0.09
388 0.11
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.08
398 0.09
399 0.09
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.08
405 0.13
406 0.12
407 0.14
408 0.16
409 0.18
410 0.2
411 0.23
412 0.27
413 0.25
414 0.26
415 0.24
416 0.23
417 0.22
418 0.19
419 0.16
420 0.09
421 0.08
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.15
426 0.15
427 0.17
428 0.19
429 0.19
430 0.17
431 0.18
432 0.17
433 0.17
434 0.17
435 0.15
436 0.15
437 0.16
438 0.16
439 0.13
440 0.16
441 0.17
442 0.19
443 0.19
444 0.18
445 0.2
446 0.25
447 0.28
448 0.24
449 0.25
450 0.24
451 0.26
452 0.26
453 0.23
454 0.18
455 0.16
456 0.16
457 0.12
458 0.11
459 0.09
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.1
465 0.11
466 0.12
467 0.14
468 0.15
469 0.19
470 0.27
471 0.31
472 0.33
473 0.4
474 0.44
475 0.52
476 0.55
477 0.55
478 0.52
479 0.5
480 0.46
481 0.44
482 0.41
483 0.36
484 0.39
485 0.37
486 0.38
487 0.4
488 0.41
489 0.39
490 0.37
491 0.36
492 0.38
493 0.42
494 0.46
495 0.5
496 0.51
497 0.56
498 0.61
499 0.63
500 0.64
501 0.59
502 0.57
503 0.55
504 0.58
505 0.53
506 0.49
507 0.5
508 0.44
509 0.42
510 0.36
511 0.29
512 0.22
513 0.2
514 0.18
515 0.13
516 0.1
517 0.09
518 0.08
519 0.14
520 0.14
521 0.16
522 0.17
523 0.19
524 0.26
525 0.3
526 0.31
527 0.31
528 0.32
529 0.31
530 0.33
531 0.36
532 0.36
533 0.34
534 0.37
535 0.35
536 0.39
537 0.42
538 0.42
539 0.41
540 0.36
541 0.38
542 0.34
543 0.39
544 0.34
545 0.33
546 0.32
547 0.28
548 0.27
549 0.24
550 0.24
551 0.17
552 0.17
553 0.16
554 0.15
555 0.18
556 0.25
557 0.31
558 0.37
559 0.4
560 0.45
561 0.47
562 0.5
563 0.53
564 0.53
565 0.47
566 0.44
567 0.41
568 0.35
569 0.33
570 0.31
571 0.27
572 0.19
573 0.21
574 0.18
575 0.17
576 0.18
577 0.18
578 0.14
579 0.12
580 0.12
581 0.1
582 0.1
583 0.11
584 0.12
585 0.13
586 0.14
587 0.18
588 0.25
589 0.3
590 0.31
591 0.33
592 0.4
593 0.39
594 0.39
595 0.38
596 0.32
597 0.31
598 0.37
599 0.38
600 0.31
601 0.33
602 0.36
603 0.35
604 0.36
605 0.36
606 0.36
607 0.35
608 0.37
609 0.36
610 0.33
611 0.34
612 0.32
613 0.29
614 0.22
615 0.2
616 0.17
617 0.16
618 0.2
619 0.19
620 0.2
621 0.25
622 0.25
623 0.27
624 0.3
625 0.31
626 0.3
627 0.29
628 0.28
629 0.28
630 0.31
631 0.34
632 0.36
633 0.37
634 0.39
635 0.4
636 0.44
637 0.45
638 0.43
639 0.46
640 0.43
641 0.47
642 0.45
643 0.49
644 0.48
645 0.44
646 0.46
647 0.37
648 0.38
649 0.36
650 0.37
651 0.35
652 0.39
653 0.47
654 0.47
655 0.52
656 0.54
657 0.61
658 0.69
659 0.72
660 0.71
661 0.72
662 0.76
663 0.8
664 0.8
665 0.75
666 0.72
667 0.75
668 0.72
669 0.7
670 0.68
671 0.64
672 0.62
673 0.6
674 0.57
675 0.53
676 0.52
677 0.47
678 0.48
679 0.44
680 0.46
681 0.46
682 0.48
683 0.44
684 0.42
685 0.43
686 0.39
687 0.4
688 0.4
689 0.39
690 0.38
691 0.44
692 0.46
693 0.47
694 0.48
695 0.47
696 0.48
697 0.48
698 0.44
699 0.37
700 0.36
701 0.31
702 0.26
703 0.25
704 0.19
705 0.17
706 0.16
707 0.22
708 0.23
709 0.25
710 0.29
711 0.32
712 0.34
713 0.39
714 0.49
715 0.52
716 0.58
717 0.63