FuNGI

A0A5N6ZE80

Protein Details

Accession

A0A5N6ZE80

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
331-350	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
446-469	NTGSQAKRKGAKAKRGKNGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
113-121	KDKGKGKAK
335-340	RRKKRK
452-463	KRKGAKAKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 10, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRPQNDPLIHDASADDRILHPVSGPAAGAAVSGAHGKNLSDLVGEFGVESIRRNEGEAANYGIFYDDSNYDYMQHLRELGTGSGDSYFVEAKSKDKGKGKAKGMRLEDALREVTLDDSRSEFGAGSIYASDIRSTASSYVRQATYQDQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEYVDAEDEEDVFGKLTTYAEEMDRGDWEDTLFDEEDDDGWESDATEKAPVQPSRTDYKPSLKDTPAQGISQDAEPGELPDHDVPAPDLHPEDQGWMREFAKFKKDGKVKVAPAAPASIVPSEQRSTLASTVFTAGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSIARTEGHRLLDDRFDRVEALYALDEEGEDEYDDSMSMVSGMTGMTGMTGMTGFSTASSQAPSLIDANGRAVAPRHDFNEVMDNFLAGWDGNTGSQAKRKGAKAKRGKNGNEAIGIKMLDEIRQGLGPAKMSGKASGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.62
4	0.63
5	0.58
6	0.53
7	0.55
8	0.53
9	0.54
10	0.6
11	0.53
12	0.45
13	0.48
14	0.47
15	0.39
16	0.36
17	0.32
18	0.24
19	0.25
20	0.22
21	0.17
22	0.13
23	0.17
24	0.18
25	0.17
26	0.15
27	0.14
28	0.15
29	0.15
30	0.14
31	0.1
32	0.09
33	0.09
34	0.08
35	0.06
36	0.05
37	0.05
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.09
42	0.09
43	0.11
44	0.11
45	0.11
46	0.09
47	0.09
48	0.11
49	0.11
50	0.11
51	0.09
52	0.08
53	0.1
54	0.09
55	0.11
56	0.1
57	0.13
58	0.13
59	0.15
60	0.19
61	0.2
62	0.22
63	0.23
64	0.24
65	0.22
66	0.21
67	0.2
68	0.17
69	0.14
70	0.11
71	0.12
72	0.09
73	0.1
74	0.11
75	0.11
76	0.12
77	0.14
78	0.16
79	0.15
80	0.15
81	0.14
82	0.14
83	0.15
84	0.16
85	0.14
86	0.14
87	0.12
88	0.12
89	0.11
90	0.11
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.08
95	0.11
96	0.11
97	0.13
98	0.2
99	0.25
100	0.3
101	0.37
102	0.46
103	0.51
104	0.6
105	0.67
106	0.68
107	0.7
108	0.71
109	0.68
110	0.63
111	0.57
112	0.5
113	0.42
114	0.37
115	0.31
116	0.23
117	0.19
118	0.15
119	0.14
120	0.13
121	0.12
122	0.1
123	0.11
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.1
128	0.09
129	0.09
130	0.08
131	0.07
132	0.06
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.06
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.1
142	0.12
143	0.13
144	0.16
145	0.2
146	0.19
147	0.19
148	0.2
149	0.22
150	0.26
151	0.27
152	0.28
153	0.24
154	0.25
155	0.26
156	0.25
157	0.2
158	0.16
159	0.12
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.08
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.13
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.12
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.07
183	0.06
184	0.05
185	0.04
186	0.03
187	0.03
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.1
207	0.09
208	0.08
209	0.08
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.08
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.07
219	0.07
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.08
230	0.15
231	0.15
232	0.17
233	0.19
234	0.22
235	0.26
236	0.27
237	0.29
238	0.26
239	0.33
240	0.36
241	0.39
242	0.41
243	0.37
244	0.4
245	0.38
246	0.41
247	0.34
248	0.29
249	0.24
250	0.2
251	0.19
252	0.16
253	0.14
254	0.08
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.06
260	0.08
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.09
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.11
275	0.13
276	0.14
277	0.15
278	0.15
279	0.17
280	0.19
281	0.2
282	0.25
283	0.28
284	0.29
285	0.36
286	0.41
287	0.43
288	0.48
289	0.53
290	0.48
291	0.49
292	0.49
293	0.41
294	0.36
295	0.32
296	0.25
297	0.18
298	0.17
299	0.11
300	0.09
301	0.09
302	0.11
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.11
307	0.13
308	0.14
309	0.14
310	0.12
311	0.12
312	0.13
313	0.12
314	0.11
315	0.08
316	0.08
317	0.11
318	0.13
319	0.18
320	0.25
321	0.36
322	0.42
323	0.47
324	0.56
325	0.63
326	0.71
327	0.75
328	0.78
329	0.77
330	0.79
331	0.8
332	0.72
333	0.64
334	0.54
335	0.43
336	0.34
337	0.25
338	0.18
339	0.14
340	0.13
341	0.11
342	0.12
343	0.13
344	0.12
345	0.14
346	0.18
347	0.2
348	0.22
349	0.22
350	0.23
351	0.24
352	0.31
353	0.3
354	0.26
355	0.24
356	0.23
357	0.22
358	0.2
359	0.21
360	0.13
361	0.13
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.09
366	0.09
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.05
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.03
381	0.04
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.06
398	0.07
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.12
404	0.12
405	0.12
406	0.13
407	0.12
408	0.14
409	0.14
410	0.13
411	0.13
412	0.13
413	0.17
414	0.21
415	0.23
416	0.24
417	0.25
418	0.26
419	0.27
420	0.35
421	0.3
422	0.29
423	0.26
424	0.24
425	0.2
426	0.2
427	0.18
428	0.08
429	0.09
430	0.06
431	0.07
432	0.07
433	0.09
434	0.11
435	0.13
436	0.19
437	0.23
438	0.28
439	0.35
440	0.42
441	0.5
442	0.58
443	0.66
444	0.71
445	0.77
446	0.81
447	0.84
448	0.83
449	0.82
450	0.8
451	0.74
452	0.7
453	0.61
454	0.53
455	0.46
456	0.41
457	0.31
458	0.27
459	0.23
460	0.17
461	0.17
462	0.16
463	0.15
464	0.16
465	0.16
466	0.16
467	0.18
468	0.19
469	0.2
470	0.21
471	0.23
472	0.23
473	0.28

A0A5N6ZE80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer