Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6Z3C3

Protein Details
Accession A0A5N6Z3C3    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-47AVEPQGKKAKREEKKEKKRKSKAVVEDVKVQDBasic
49-93GAEEQAKSDKKEKKKEKKDKKEKKEKKEKKEKKEKKEKEEEEESQBasic
116-149DEKAQAKKDRKEKAKQEKKAKKEKKKTEVAQREGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-37GKKAKREEKKEKKRKSK
55-86KSDKKEKKKEKKDKKEKKEKKEKKEKKEKKEK
121-141AKKDRKEKAKQEKKAKKEKKK
270-280KAKIEAKNKKL
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGDKKRKIVENNPEEAVEPQGKKAKREEKKEKKRKSKAVVEDVKVQDAGAEEQAKSDKKEKKKEKKDKKEKKEKKEKKEKKEKKEKEEEEESQKDAPEVNGAEEEKQETTDAMEMDEKAQAKKDRKEKAKQEKKAKKEKKKTEVAQREGQEQKPESNEQQSQDEPAEDGASKQTGARFICFVGNLPYSANHESLSAHFEKITPVSVRVATQKENPTKCRGFGFIEFDNYDRMKTCLKLYHHSMFDDKKYPPRRINVELTAGGGGNNENRKAKIEAKNKKLFEERQRDAKSIQHQKERKAKVEETGVDGYEGVHPSRLSRMA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.45
3 0.4
4 0.36
5 0.28
6 0.29
7 0.35
8 0.37
9 0.39
10 0.48
11 0.53
12 0.56
13 0.66
14 0.72
15 0.76
16 0.85
17 0.92
18 0.93
19 0.94
20 0.95
21 0.95
22 0.94
23 0.92
24 0.91
25 0.91
26 0.89
27 0.82
28 0.8
29 0.72
30 0.63
31 0.52
32 0.42
33 0.32
34 0.24
35 0.21
36 0.16
37 0.16
38 0.14
39 0.16
40 0.2
41 0.21
42 0.23
43 0.3
44 0.35
45 0.43
46 0.54
47 0.64
48 0.71
49 0.8
50 0.88
51 0.91
52 0.94
53 0.96
54 0.97
55 0.97
56 0.97
57 0.96
58 0.96
59 0.96
60 0.95
61 0.95
62 0.95
63 0.94
64 0.94
65 0.95
66 0.94
67 0.94
68 0.95
69 0.93
70 0.92
71 0.93
72 0.87
73 0.84
74 0.82
75 0.76
76 0.73
77 0.66
78 0.57
79 0.48
80 0.42
81 0.34
82 0.26
83 0.21
84 0.15
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.08
96 0.08
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.11
106 0.16
107 0.21
108 0.27
109 0.34
110 0.42
111 0.49
112 0.56
113 0.66
114 0.71
115 0.77
116 0.81
117 0.83
118 0.85
119 0.85
120 0.86
121 0.88
122 0.88
123 0.87
124 0.87
125 0.89
126 0.87
127 0.88
128 0.85
129 0.85
130 0.85
131 0.79
132 0.75
133 0.66
134 0.63
135 0.57
136 0.51
137 0.45
138 0.36
139 0.32
140 0.28
141 0.29
142 0.24
143 0.25
144 0.26
145 0.23
146 0.24
147 0.23
148 0.21
149 0.19
150 0.18
151 0.13
152 0.1
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.14
175 0.16
176 0.15
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.17
182 0.14
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.15
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.19
195 0.21
196 0.2
197 0.26
198 0.33
199 0.39
200 0.44
201 0.46
202 0.49
203 0.48
204 0.47
205 0.43
206 0.38
207 0.34
208 0.33
209 0.35
210 0.28
211 0.3
212 0.29
213 0.28
214 0.28
215 0.24
216 0.21
217 0.16
218 0.17
219 0.15
220 0.16
221 0.2
222 0.23
223 0.27
224 0.32
225 0.38
226 0.44
227 0.43
228 0.43
229 0.45
230 0.42
231 0.43
232 0.42
233 0.38
234 0.41
235 0.46
236 0.52
237 0.53
238 0.57
239 0.6
240 0.61
241 0.66
242 0.61
243 0.58
244 0.51
245 0.46
246 0.38
247 0.31
248 0.24
249 0.17
250 0.13
251 0.13
252 0.16
253 0.18
254 0.2
255 0.21
256 0.25
257 0.29
258 0.37
259 0.42
260 0.49
261 0.56
262 0.64
263 0.72
264 0.7
265 0.72
266 0.71
267 0.7
268 0.7
269 0.71
270 0.67
271 0.68
272 0.7
273 0.67
274 0.61
275 0.59
276 0.59
277 0.59
278 0.61
279 0.61
280 0.63
281 0.7
282 0.78
283 0.79
284 0.77
285 0.74
286 0.68
287 0.64
288 0.68
289 0.61
290 0.57
291 0.52
292 0.44
293 0.36
294 0.33
295 0.27
296 0.22
297 0.21
298 0.16
299 0.16
300 0.16
301 0.17