Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TRA3

Protein Details
Accession A7TRA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-334SSINDTSKSRSNKKRLCEYCRNKMKNPTSKKMKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG vpo:Kpol_401p4  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MNVLQERRVSLPSIKTLLSAIDNDNAPSITTHDSTSADSTPNINSQIFNQNINSPSSSTTSVGALQHSQNNQLYAASVLQHIHNNSSSKTNPNQIFQSPNQSSYNNFPPRDEINSSYTTVGFNAQNIPHSPTINESSSSTALAMSPASLNSNSQSSPNLGISLESSGSESNLAEEVKQTSHSTKCRCRNYTEDGRHIPRPRNAFILFRQYMHNHLFSKDKGLLISHGSFKTNSLVSREIGQRWRSLSEDEKNYWHGLAKKEKELHKLKYPNYKYIPRKLDATNSGSTTAGVKIEGSDLLQSSSINDTSKSRSNKKRLCEYCRNKMKNPTSKKMK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.3
4 0.29
5 0.25
6 0.22
7 0.19
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.21
12 0.18
13 0.17
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.19
22 0.22
23 0.21
24 0.18
25 0.18
26 0.19
27 0.2
28 0.21
29 0.22
30 0.19
31 0.18
32 0.21
33 0.29
34 0.29
35 0.29
36 0.27
37 0.3
38 0.31
39 0.33
40 0.3
41 0.22
42 0.22
43 0.23
44 0.24
45 0.2
46 0.19
47 0.18
48 0.19
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.19
53 0.23
54 0.23
55 0.27
56 0.26
57 0.26
58 0.24
59 0.21
60 0.19
61 0.15
62 0.15
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.14
68 0.15
69 0.16
70 0.19
71 0.2
72 0.2
73 0.24
74 0.25
75 0.27
76 0.3
77 0.37
78 0.36
79 0.37
80 0.4
81 0.37
82 0.41
83 0.37
84 0.44
85 0.36
86 0.37
87 0.36
88 0.33
89 0.32
90 0.32
91 0.41
92 0.38
93 0.37
94 0.34
95 0.35
96 0.37
97 0.4
98 0.38
99 0.31
100 0.28
101 0.29
102 0.3
103 0.27
104 0.24
105 0.19
106 0.16
107 0.16
108 0.12
109 0.11
110 0.13
111 0.12
112 0.14
113 0.15
114 0.18
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.17
119 0.2
120 0.19
121 0.19
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.14
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.11
167 0.17
168 0.22
169 0.29
170 0.37
171 0.46
172 0.53
173 0.55
174 0.57
175 0.57
176 0.6
177 0.64
178 0.61
179 0.59
180 0.56
181 0.57
182 0.59
183 0.58
184 0.56
185 0.5
186 0.49
187 0.44
188 0.44
189 0.41
190 0.38
191 0.36
192 0.4
193 0.36
194 0.31
195 0.33
196 0.28
197 0.31
198 0.3
199 0.31
200 0.23
201 0.24
202 0.26
203 0.23
204 0.27
205 0.24
206 0.22
207 0.19
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.2
212 0.2
213 0.19
214 0.19
215 0.19
216 0.19
217 0.2
218 0.19
219 0.18
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.23
224 0.25
225 0.27
226 0.31
227 0.32
228 0.31
229 0.31
230 0.33
231 0.29
232 0.3
233 0.32
234 0.33
235 0.37
236 0.37
237 0.38
238 0.38
239 0.37
240 0.34
241 0.31
242 0.28
243 0.29
244 0.37
245 0.39
246 0.44
247 0.5
248 0.55
249 0.6
250 0.64
251 0.63
252 0.63
253 0.67
254 0.66
255 0.7
256 0.7
257 0.7
258 0.69
259 0.73
260 0.71
261 0.72
262 0.73
263 0.64
264 0.65
265 0.58
266 0.59
267 0.56
268 0.53
269 0.47
270 0.41
271 0.4
272 0.35
273 0.32
274 0.25
275 0.2
276 0.15
277 0.11
278 0.1
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.15
293 0.17
294 0.23
295 0.31
296 0.38
297 0.45
298 0.54
299 0.64
300 0.7
301 0.76
302 0.81
303 0.83
304 0.84
305 0.85
306 0.84
307 0.84
308 0.89
309 0.87
310 0.83
311 0.84
312 0.85
313 0.84
314 0.85