Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179UJM2

Protein Details
Accession A0A179UJM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-259HVVARRRKAEREREREKERERRRGEBasic
280-308EKLARRCREKSALVRRDGKRRKRVRQVDVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-304RRRKAEREREREKERERRRGEGEERDRLRIEKRYEREEVVREKLARRCREKSALVRRDGKRRKRVR
Subcellular Location(s) cyto 16, cyto_nucl 11.833, cyto_mito 9.833, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR018856  Stn1_N  
KEGG bgh:BDBG_03306  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10451  Stn1  
Amino Acid Sequences MADHSHHGPLPLTYYPAFCHKISPTFFAWVKIAAIDMHHLKLRPGFEGQNIYFYLNHPIQFICAAGIIVARDEQERRSILVLDDSSGACLEVVCSKNVQVPNTNAITTTNNSNSSNNYNNNNTSPTQPTHLASATNRPLNITPLLPGARAKLKGTISCFRGMLQLHLERYEILRDTNAEVRFWDERTRFRLQVLSVPWVVARGEVERLRVEAEGVAVAAAAGRKDGDGYLNADGHVVARRRKAEREREREKERERRRGEGEERDRLRIEKRYEREEVVREKLARRCREKSALVRRDGKRRKRVRQVDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.27
4 0.3
5 0.26
6 0.3
7 0.3
8 0.37
9 0.39
10 0.41
11 0.37
12 0.4
13 0.41
14 0.39
15 0.36
16 0.29
17 0.26
18 0.21
19 0.2
20 0.13
21 0.13
22 0.15
23 0.16
24 0.17
25 0.19
26 0.2
27 0.21
28 0.24
29 0.25
30 0.23
31 0.24
32 0.24
33 0.26
34 0.33
35 0.32
36 0.31
37 0.31
38 0.29
39 0.26
40 0.25
41 0.28
42 0.22
43 0.22
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.18
48 0.17
49 0.1
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.08
59 0.1
60 0.11
61 0.14
62 0.15
63 0.16
64 0.17
65 0.17
66 0.16
67 0.2
68 0.19
69 0.15
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.12
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.18
84 0.2
85 0.22
86 0.21
87 0.22
88 0.26
89 0.27
90 0.27
91 0.22
92 0.21
93 0.22
94 0.19
95 0.2
96 0.18
97 0.19
98 0.21
99 0.21
100 0.22
101 0.25
102 0.29
103 0.28
104 0.3
105 0.3
106 0.31
107 0.32
108 0.32
109 0.28
110 0.26
111 0.26
112 0.23
113 0.23
114 0.23
115 0.22
116 0.21
117 0.2
118 0.19
119 0.16
120 0.22
121 0.23
122 0.23
123 0.22
124 0.21
125 0.21
126 0.22
127 0.22
128 0.15
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.15
137 0.14
138 0.16
139 0.17
140 0.19
141 0.24
142 0.27
143 0.25
144 0.26
145 0.25
146 0.21
147 0.23
148 0.21
149 0.18
150 0.17
151 0.18
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.1
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.14
167 0.17
168 0.18
169 0.18
170 0.23
171 0.19
172 0.23
173 0.29
174 0.34
175 0.31
176 0.31
177 0.33
178 0.28
179 0.31
180 0.29
181 0.27
182 0.22
183 0.21
184 0.2
185 0.18
186 0.17
187 0.11
188 0.1
189 0.07
190 0.12
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.08
215 0.1
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.15
223 0.17
224 0.19
225 0.24
226 0.3
227 0.34
228 0.43
229 0.51
230 0.57
231 0.65
232 0.71
233 0.75
234 0.79
235 0.83
236 0.83
237 0.83
238 0.83
239 0.82
240 0.83
241 0.78
242 0.76
243 0.75
244 0.75
245 0.73
246 0.73
247 0.71
248 0.7
249 0.68
250 0.65
251 0.6
252 0.53
253 0.52
254 0.49
255 0.49
256 0.49
257 0.52
258 0.55
259 0.57
260 0.6
261 0.6
262 0.6
263 0.58
264 0.54
265 0.55
266 0.52
267 0.54
268 0.56
269 0.59
270 0.61
271 0.63
272 0.62
273 0.64
274 0.69
275 0.72
276 0.75
277 0.77
278 0.76
279 0.76
280 0.8
281 0.79
282 0.82
283 0.83
284 0.83
285 0.83
286 0.85
287 0.87
288 0.89