Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6V5P6

Protein Details
Accession A0A5N6V5P6    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-76AGFPAHRRRVKQSAFKQRREASSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-65PPKPAAAGFPAHRRRVKQ
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 3, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013929  RNA_pol_II_AP1_C  
IPR013930  RNA_pol_II_AP1_N  
IPR039913  RPAP1/Rba50  
Gene Ontology GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08620  RPAP1_C  
PF08621  RPAP1_N  
Amino Acid Sequences MAFRGERFVVDLDSDDDQSSSAPTASSISLPGLIGEIRERSPAAAPAPPKPAAAGFPAHRRRVKQSAFKQRREASSNSASAIAGQNDEKRMIDDENRRQLASMSHDQIQQEREELMASIDPSLLERFLRRARIDSEESKTDTRSNPSVSIKHQVDPAEAAAPPLESISESKTSTSRDEQTHRDDLPPAQMPDDLRPVSESPLPSSVHFPTPPSQLNPMPNLDPSSTSFLSDLQAHYFPNITHDPSALSWLQPPSADSDAPDATSAYHPASNAEAVHPAALRFSFLGTLLSPTTSLALPTNLGLHHHGKDPHAAGYTIPELAILSRSSFPAQRCIVWQVLGRILFRLGKGQFGERGSTLVEGLWSVIEREGVVTGMLAEADGTSTGPTRSDKENATEKQGQDLARSKGGIGHHASATAWAVEGVWLWQMGGAGDRGVLKEGAVRSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.15
4 0.14
5 0.13
6 0.13
7 0.11
8 0.09
9 0.08
10 0.08
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.11
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.1
21 0.1
22 0.11
23 0.13
24 0.13
25 0.15
26 0.15
27 0.16
28 0.18
29 0.21
30 0.21
31 0.23
32 0.25
33 0.29
34 0.34
35 0.34
36 0.32
37 0.29
38 0.28
39 0.25
40 0.26
41 0.26
42 0.24
43 0.34
44 0.42
45 0.49
46 0.52
47 0.54
48 0.59
49 0.64
50 0.68
51 0.68
52 0.71
53 0.75
54 0.8
55 0.83
56 0.85
57 0.81
58 0.79
59 0.74
60 0.67
61 0.64
62 0.61
63 0.55
64 0.46
65 0.41
66 0.33
67 0.29
68 0.28
69 0.21
70 0.15
71 0.16
72 0.18
73 0.19
74 0.2
75 0.18
76 0.17
77 0.18
78 0.2
79 0.26
80 0.32
81 0.4
82 0.49
83 0.5
84 0.48
85 0.46
86 0.44
87 0.4
88 0.38
89 0.36
90 0.29
91 0.31
92 0.33
93 0.34
94 0.36
95 0.34
96 0.27
97 0.21
98 0.18
99 0.15
100 0.13
101 0.13
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.14
114 0.18
115 0.24
116 0.24
117 0.27
118 0.3
119 0.35
120 0.4
121 0.4
122 0.41
123 0.38
124 0.41
125 0.38
126 0.36
127 0.34
128 0.31
129 0.3
130 0.29
131 0.28
132 0.3
133 0.33
134 0.35
135 0.34
136 0.4
137 0.37
138 0.35
139 0.36
140 0.31
141 0.28
142 0.26
143 0.24
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.04
153 0.05
154 0.08
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.14
159 0.16
160 0.19
161 0.22
162 0.24
163 0.27
164 0.31
165 0.35
166 0.39
167 0.42
168 0.39
169 0.36
170 0.33
171 0.29
172 0.3
173 0.28
174 0.23
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.23
180 0.18
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.18
186 0.16
187 0.13
188 0.17
189 0.17
190 0.16
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.19
196 0.18
197 0.22
198 0.23
199 0.21
200 0.23
201 0.24
202 0.26
203 0.26
204 0.25
205 0.22
206 0.21
207 0.21
208 0.17
209 0.15
210 0.14
211 0.18
212 0.16
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.15
217 0.15
218 0.13
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.12
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.12
232 0.16
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.13
243 0.11
244 0.14
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.1
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.1
289 0.12
290 0.15
291 0.16
292 0.2
293 0.22
294 0.22
295 0.26
296 0.26
297 0.25
298 0.23
299 0.21
300 0.17
301 0.18
302 0.18
303 0.14
304 0.12
305 0.1
306 0.08
307 0.08
308 0.1
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.11
313 0.13
314 0.17
315 0.17
316 0.23
317 0.25
318 0.24
319 0.26
320 0.28
321 0.28
322 0.26
323 0.27
324 0.22
325 0.25
326 0.26
327 0.23
328 0.2
329 0.21
330 0.2
331 0.18
332 0.22
333 0.18
334 0.21
335 0.22
336 0.24
337 0.26
338 0.26
339 0.28
340 0.22
341 0.22
342 0.19
343 0.18
344 0.15
345 0.11
346 0.1
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.03
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.09
373 0.11
374 0.14
375 0.19
376 0.24
377 0.26
378 0.32
379 0.41
380 0.42
381 0.48
382 0.51
383 0.47
384 0.48
385 0.5
386 0.44
387 0.41
388 0.45
389 0.41
390 0.38
391 0.38
392 0.32
393 0.32
394 0.32
395 0.32
396 0.29
397 0.29
398 0.26
399 0.26
400 0.26
401 0.23
402 0.23
403 0.16
404 0.12
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.12
423 0.12
424 0.11
425 0.16