Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6V8K3

Protein Details
Accession A0A5N6V8K3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-50VSAPEPPSKKALRKAKKKVVDAQPEATHydrophilic
262-286SDSENHKQPKKLKQRRVWVNQILGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-41SKKALRKAKKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14.333, cyto 10, mito_nucl 9.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MLAVGEANHKKRKLPEVSEIEIDVSAPEPPSKKALRKAKKKVVDAQPEATTTSEQKTEVAADHEENSKKRSDYGIWIGNLAFSISKDDLRKFFTSNCSFTDTTITRIHLPKSSEKNGKAQNKGFAYVDFSNQKATTEALGLSEQLLSGRRVLIKDAKSFVGRPPRSQQENQKTGAAGAASGNPPSKRIFVGNLGFDATKEIIEEHFGKCGSVAHVQVATFQDSGKCKGYAWVTFEDITAAEAAVKGFVMVNEDEEDEEVHGSDSENHKQPKKLKQRRVWVNQILGRRMRMEFAEDATTRYKKRFGKDGEGKKTQITDVSGSEPFDDQDATGRQPQRPRSAKTMQGKTDYSRYDKETVQKLSGAIVESQGKKTTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.64
3 0.65
4 0.68
5 0.65
6 0.58
7 0.49
8 0.39
9 0.32
10 0.22
11 0.14
12 0.11
13 0.1
14 0.13
15 0.14
16 0.16
17 0.23
18 0.3
19 0.37
20 0.46
21 0.56
22 0.63
23 0.72
24 0.81
25 0.85
26 0.87
27 0.87
28 0.87
29 0.86
30 0.86
31 0.8
32 0.74
33 0.66
34 0.58
35 0.52
36 0.43
37 0.34
38 0.26
39 0.23
40 0.2
41 0.18
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.17
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.19
50 0.25
51 0.28
52 0.28
53 0.29
54 0.3
55 0.28
56 0.29
57 0.31
58 0.28
59 0.31
60 0.37
61 0.42
62 0.38
63 0.38
64 0.36
65 0.31
66 0.28
67 0.21
68 0.13
69 0.07
70 0.11
71 0.11
72 0.15
73 0.18
74 0.21
75 0.23
76 0.28
77 0.3
78 0.28
79 0.31
80 0.37
81 0.39
82 0.38
83 0.38
84 0.38
85 0.36
86 0.35
87 0.38
88 0.3
89 0.29
90 0.29
91 0.28
92 0.27
93 0.3
94 0.31
95 0.28
96 0.31
97 0.35
98 0.4
99 0.47
100 0.5
101 0.5
102 0.56
103 0.6
104 0.65
105 0.64
106 0.59
107 0.58
108 0.52
109 0.52
110 0.44
111 0.36
112 0.34
113 0.27
114 0.28
115 0.23
116 0.21
117 0.22
118 0.21
119 0.21
120 0.16
121 0.16
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.13
139 0.19
140 0.21
141 0.24
142 0.25
143 0.26
144 0.25
145 0.26
146 0.29
147 0.33
148 0.3
149 0.31
150 0.36
151 0.41
152 0.46
153 0.5
154 0.55
155 0.54
156 0.58
157 0.56
158 0.51
159 0.43
160 0.38
161 0.33
162 0.23
163 0.12
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.1
169 0.09
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.16
177 0.19
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.16
182 0.15
183 0.14
184 0.09
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.08
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.11
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.15
214 0.19
215 0.22
216 0.21
217 0.23
218 0.22
219 0.22
220 0.22
221 0.22
222 0.18
223 0.15
224 0.12
225 0.09
226 0.07
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.1
250 0.14
251 0.19
252 0.26
253 0.31
254 0.35
255 0.41
256 0.48
257 0.54
258 0.62
259 0.67
260 0.71
261 0.75
262 0.82
263 0.87
264 0.88
265 0.88
266 0.83
267 0.8
268 0.74
269 0.71
270 0.66
271 0.58
272 0.51
273 0.43
274 0.37
275 0.31
276 0.26
277 0.25
278 0.2
279 0.2
280 0.24
281 0.21
282 0.23
283 0.27
284 0.3
285 0.28
286 0.29
287 0.35
288 0.35
289 0.41
290 0.48
291 0.49
292 0.57
293 0.65
294 0.73
295 0.75
296 0.75
297 0.7
298 0.63
299 0.58
300 0.48
301 0.41
302 0.33
303 0.26
304 0.22
305 0.25
306 0.24
307 0.23
308 0.23
309 0.2
310 0.17
311 0.16
312 0.14
313 0.1
314 0.14
315 0.16
316 0.18
317 0.25
318 0.3
319 0.34
320 0.41
321 0.49
322 0.54
323 0.6
324 0.62
325 0.63
326 0.67
327 0.71
328 0.74
329 0.76
330 0.71
331 0.7
332 0.67
333 0.63
334 0.64
335 0.6
336 0.55
337 0.51
338 0.5
339 0.48
340 0.49
341 0.53
342 0.53
343 0.52
344 0.49
345 0.46
346 0.41
347 0.39
348 0.37
349 0.3
350 0.22
351 0.21
352 0.26
353 0.27
354 0.3
355 0.33