FuNGI

A0A5N6UFU0

Protein Details

Accession

A0A5N6UFU0

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-50	GSNGPPPMRIRRPKAADPLVRPKKKPTAKPAIPISG	Hydrophilic
132-153	DENQFTRPVRLQRRDPRARSHE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-45	PMRIRRPKAADPLVRPKKKPTAKPA
412-434	EKKEKEARRVLGKKVRKALQKRE
490-508	RPKHTDPLKKGTAAAPRKR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MATPTNDLNARTPTGSNGPPPMRIRRPKAADPLVRPKKKPTAKPAIPISGNGPALKAVSSRPATSNPPSMPHSERGKPSSSGADFSANGFSGPLLSETYTDYPLVTTKRALREGLKHHIARFASKKTVDPRDENQFTRPVRLQRRDPRARSHEMTSEKSQGMQKTTSESSHQIDETEREELEARKAAREKERAENLAQIAPSVGSAPKRANVPKQKTQQVSKTDMTPEEMAKTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLEATGKMRMIPVEKWYRFNAKNQFKTLTIEEAEKFMAKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELELFAKQRKVYAGKQGTPSGVEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEEAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKDYEQEELREKKEKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDDESSDDSEAERLKEEERKAEEEKNKKDVTTSKGNNTPSGRPKHTDPLKKGTAAAPRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKGKSKDPSSQPTPQPSSRNISPVASSQMPIGKKRVRNVPLSGAGSGSDADGGAGSGAEMSESGKTKKLKLNPPAVSHGGTPQGSRAGSPTPLAGRSFSGSRASSPESFRGQTRVSTPVHAGNQSFPTPAEIHAAIPPSGILSSDLLKIFRPRIGESKENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGTLKES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.33
3	0.33
4	0.38
5	0.38
6	0.43
7	0.48
8	0.54
9	0.58
10	0.65
11	0.68
12	0.7
13	0.75
14	0.76
15	0.81
16	0.81
17	0.79
18	0.78
19	0.81
20	0.82
21	0.82
22	0.77
23	0.75
24	0.76
25	0.77
26	0.78
27	0.77
28	0.78
29	0.77
30	0.83
31	0.82
32	0.8
33	0.71
34	0.63
35	0.57
36	0.52
37	0.47
38	0.38
39	0.3
40	0.22
41	0.22
42	0.21
43	0.18
44	0.13
45	0.19
46	0.22
47	0.24
48	0.26
49	0.3
50	0.35
51	0.4
52	0.46
53	0.39
54	0.41
55	0.42
56	0.45
57	0.45
58	0.47
59	0.49
60	0.48
61	0.53
62	0.52
63	0.54
64	0.5
65	0.48
66	0.49
67	0.43
68	0.38
69	0.33
70	0.32
71	0.28
72	0.28
73	0.27
74	0.19
75	0.17
76	0.15
77	0.13
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.08
82	0.08
83	0.09
84	0.13
85	0.15
86	0.16
87	0.15
88	0.14
89	0.14
90	0.17
91	0.19
92	0.17
93	0.2
94	0.25
95	0.31
96	0.34
97	0.36
98	0.38
99	0.44
100	0.5
101	0.55
102	0.57
103	0.53
104	0.51
105	0.54
106	0.5
107	0.49
108	0.48
109	0.44
110	0.43
111	0.42
112	0.47
113	0.49
114	0.58
115	0.56
116	0.56
117	0.56
118	0.59
119	0.63
120	0.59
121	0.54
122	0.52
123	0.47
124	0.48
125	0.48
126	0.47
127	0.52
128	0.58
129	0.64
130	0.66
131	0.76
132	0.8
133	0.8
134	0.81
135	0.78
136	0.78
137	0.72
138	0.67
139	0.63
140	0.59
141	0.59
142	0.53
143	0.51
144	0.43
145	0.42
146	0.42
147	0.37
148	0.36
149	0.32
150	0.28
151	0.29
152	0.31
153	0.29
154	0.28
155	0.28
156	0.27
157	0.27
158	0.27
159	0.22
160	0.21
161	0.22
162	0.21
163	0.19
164	0.16
165	0.14
166	0.16
167	0.17
168	0.18
169	0.2
170	0.19
171	0.22
172	0.26
173	0.31
174	0.37
175	0.43
176	0.44
177	0.49
178	0.55
179	0.52
180	0.5
181	0.49
182	0.42
183	0.38
184	0.33
185	0.24
186	0.18
187	0.15
188	0.13
189	0.1
190	0.1
191	0.08
192	0.11
193	0.12
194	0.14
195	0.2
196	0.24
197	0.33
198	0.42
199	0.49
200	0.56
201	0.63
202	0.69
203	0.7
204	0.72
205	0.7
206	0.66
207	0.64
208	0.57
209	0.52
210	0.47
211	0.41
212	0.37
213	0.31
214	0.26
215	0.22
216	0.22
217	0.22
218	0.22
219	0.23
220	0.22
221	0.22
222	0.23
223	0.21
224	0.22
225	0.26
226	0.27
227	0.29
228	0.28
229	0.26
230	0.25
231	0.24
232	0.22
233	0.17
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.16
242	0.13
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.09
267	0.1
268	0.17
269	0.26
270	0.28
271	0.31
272	0.33
273	0.4
274	0.4
275	0.46
276	0.5
277	0.49
278	0.53
279	0.54
280	0.53
281	0.46
282	0.48
283	0.41
284	0.34
285	0.26
286	0.22
287	0.19
288	0.18
289	0.17
290	0.15
291	0.14
292	0.13
293	0.17
294	0.14
295	0.21
296	0.29
297	0.38
298	0.44
299	0.49
300	0.5
301	0.54
302	0.56
303	0.52
304	0.53
305	0.46
306	0.41
307	0.43
308	0.46
309	0.41
310	0.41
311	0.43
312	0.34
313	0.32
314	0.32
315	0.26
316	0.2
317	0.21
318	0.26
319	0.27
320	0.31
321	0.3
322	0.3
323	0.32
324	0.35
325	0.33
326	0.36
327	0.36
328	0.35
329	0.38
330	0.38
331	0.35
332	0.31
333	0.29
334	0.2
335	0.14
336	0.1
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.07
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.11
371	0.14
372	0.17
373	0.24
374	0.31
375	0.32
376	0.4
377	0.46
378	0.51
379	0.52
380	0.5
381	0.44
382	0.4
383	0.38
384	0.32
385	0.26
386	0.19
387	0.17
388	0.18
389	0.17
390	0.16
391	0.17
392	0.17
393	0.17
394	0.17
395	0.21
396	0.23
397	0.25
398	0.31
399	0.3
400	0.36
401	0.42
402	0.47
403	0.49
404	0.55
405	0.58
406	0.6
407	0.65
408	0.65
409	0.67
410	0.67
411	0.65
412	0.63
413	0.65
414	0.63
415	0.66
416	0.69
417	0.71
418	0.74
419	0.73
420	0.76
421	0.73
422	0.69
423	0.63
424	0.59
425	0.51
426	0.43
427	0.4
428	0.32
429	0.28
430	0.26
431	0.23
432	0.17
433	0.15
434	0.13
435	0.13
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.13
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.11
444	0.12
445	0.13
446	0.12
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.17
451	0.19
452	0.23
453	0.26
454	0.3
455	0.33
456	0.4
457	0.46
458	0.49
459	0.54
460	0.55
461	0.52
462	0.47
463	0.48
464	0.46
465	0.44
466	0.45
467	0.44
468	0.42
469	0.48
470	0.49
471	0.5
472	0.48
473	0.49
474	0.47
475	0.51
476	0.49
477	0.46
478	0.49
479	0.54
480	0.59
481	0.61
482	0.58
483	0.59
484	0.59
485	0.56
486	0.54
487	0.49
488	0.49
489	0.5
490	0.51
491	0.5
492	0.49
493	0.51
494	0.52
495	0.51
496	0.47
497	0.46
498	0.42
499	0.41
500	0.4
501	0.37
502	0.35
503	0.3
504	0.3
505	0.24
506	0.21
507	0.2
508	0.21
509	0.24
510	0.31
511	0.34
512	0.34
513	0.41
514	0.51
515	0.56
516	0.62
517	0.69
518	0.73
519	0.78
520	0.79
521	0.79
522	0.74
523	0.72
524	0.7
525	0.65
526	0.6
527	0.56
528	0.57
529	0.5
530	0.49
531	0.42
532	0.37
533	0.33
534	0.3
535	0.31
536	0.25
537	0.22
538	0.2
539	0.24
540	0.25
541	0.26
542	0.31
543	0.33
544	0.37
545	0.43
546	0.51
547	0.51
548	0.55
549	0.57
550	0.56
551	0.55
552	0.53
553	0.47
554	0.37
555	0.32
556	0.27
557	0.22
558	0.15
559	0.08
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.04
564	0.04
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.04
572	0.07
573	0.1
574	0.12
575	0.18
576	0.2
577	0.26
578	0.34
579	0.42
580	0.49
581	0.56
582	0.65
583	0.66
584	0.68
585	0.69
586	0.64
587	0.57
588	0.48
589	0.42
590	0.37
591	0.31
592	0.26
593	0.22
594	0.23
595	0.21
596	0.2
597	0.2
598	0.17
599	0.18
600	0.18
601	0.2
602	0.19
603	0.21
604	0.22
605	0.21
606	0.2
607	0.22
608	0.22
609	0.21
610	0.24
611	0.22
612	0.23
613	0.26
614	0.29
615	0.31
616	0.33
617	0.36
618	0.36
619	0.38
620	0.38
621	0.38
622	0.35
623	0.34
624	0.34
625	0.35
626	0.31
627	0.33
628	0.33
629	0.35
630	0.37
631	0.37
632	0.35
633	0.33
634	0.35
635	0.33
636	0.31
637	0.25
638	0.24
639	0.22
640	0.22
641	0.23
642	0.19
643	0.19
644	0.21
645	0.23
646	0.19
647	0.18
648	0.17
649	0.13
650	0.12
651	0.11
652	0.1
653	0.09
654	0.11
655	0.15
656	0.16
657	0.16
658	0.19
659	0.23
660	0.25
661	0.26
662	0.28
663	0.28
664	0.36
665	0.43
666	0.48
667	0.48
668	0.56
669	0.65
670	0.64
671	0.63
672	0.55
673	0.49
674	0.44
675	0.48
676	0.45
677	0.38
678	0.37
679	0.35
680	0.35
681	0.34
682	0.33
683	0.25
684	0.19
685	0.18
686	0.19
687	0.21
688	0.22
689	0.23
690	0.29
691	0.31
692	0.3
693	0.34

A0A5N6UFU0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer