Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6V1P6

Protein Details
Accession A0A5N6V1P6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-27SEDDGTTPRKKRKITPPKAVPYMLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-15KKRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MVSEDDGTTPRKKRKITPPKAVPYMLRPLFDQVPLTADDPNDDVHITCVEYWNDNLYIGTSAAEILHFVCLPPDPSDDTNEPSFILASRLPIPFSKNASVTNRRQGIQQIVLLPSVNKACILCNGTATFYLLPELSPAFRENTKVNNCCWIGGLDQNASMDEPERPVVMVATQNKMMLVRIGDDARLVRNIEFPGCLTASRRGIIACAADARSYSLLDVEHQQKIPLFPMSFFDEALASGQVEDMPPASLSPSSSAEGHTHSRSPSLNTLAGMLQSNARSASQDRSSSVTPELSSTSGTPTRSRSKERGGSISPRVSSEHPSRDSQSSPRENPKPLPPLPKQPSTQLKPHILSPTSSEFLLVRGTDTAEPGVGMFVNVDGDVVRGTITFHKYPESVVIDKGDENNLIGAPNDTREDLILAVIEADQDGKLRKFLEVQLWDVDPGNADNHKSWVEIPSLQGTQPSHVGLLHTLSPSQLEVSEMRGLLQMVRLRTPSLSPHIPATDPRTQASIEQLQKEKELFESQEAIDIEGTKKDTPDWEAERNTDEAKFARELGKTQSSLVLWSGNQIWRVVKNPLTTQLNDALQSARESQRDGHSALRRDAIMDIIKMVQEAEPKSEAEFLGLNYVKQKSSLLLFGDLVFMDPTVRDRATIDATEKALITGELDPRVALLLVPLLRQEVLQGPQGIWIHGGLAEVAEAYLKRLDSVKASKEPDVFDSGILNMIKRFLLAWQQKRGYGSITDDAYIFDSVDAALLHLLLEQDSNVPTEHRLSSRTRTELNRLVDNWKGNFDRAVALLENYKRLFLLSRLYQSQKMSRNVLKTWRRIIEGEEDAGGETTASGVEAQMRRYLVKIKDAQLVEEYGAWLAQRNPSLGIQVFADNTSRVKLDPVDVVRLLKERAPNAVQDYLEHLVFSKNYTQYADDLLSYYLDTVLSVLETSPAARSSLAESYSTYRALQPPKPTYMNFIHENTPSEPWWQSRLRLLQLLGGGGSSQFSSVPSPKLTYSIPAVLARIEPFQNELVSESIILDGLQGRHREALHLLTHGLGDYDSAVRYCLFGGPRSTSSTNTSAEFADRSHQSELFKYLLDEFLHIQDPSECIERTSDLLARFGSWFDVGEVLRLVPDNWSVDILSGFLAHVFRVLISETRETRIERALSASLNLRVGAEYIEGVEKVGGWLEDGEGLRCLKEANNPAVLPADDGDDFGDMVEPRGGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.78
3 0.81
4 0.84
5 0.85
6 0.87
7 0.88
8 0.82
9 0.75
10 0.7
11 0.7
12 0.62
13 0.52
14 0.44
15 0.42
16 0.41
17 0.38
18 0.34
19 0.24
20 0.23
21 0.24
22 0.23
23 0.2
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.12
35 0.16
36 0.17
37 0.18
38 0.19
39 0.21
40 0.21
41 0.2
42 0.19
43 0.16
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.13
59 0.15
60 0.17
61 0.2
62 0.22
63 0.29
64 0.3
65 0.33
66 0.33
67 0.31
68 0.28
69 0.24
70 0.23
71 0.16
72 0.17
73 0.13
74 0.14
75 0.18
76 0.19
77 0.21
78 0.22
79 0.27
80 0.29
81 0.34
82 0.36
83 0.34
84 0.4
85 0.47
86 0.53
87 0.56
88 0.6
89 0.59
90 0.55
91 0.56
92 0.55
93 0.53
94 0.48
95 0.45
96 0.38
97 0.35
98 0.35
99 0.32
100 0.27
101 0.23
102 0.2
103 0.17
104 0.14
105 0.13
106 0.14
107 0.19
108 0.22
109 0.19
110 0.21
111 0.22
112 0.22
113 0.23
114 0.24
115 0.18
116 0.15
117 0.16
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.1
123 0.12
124 0.13
125 0.15
126 0.17
127 0.2
128 0.21
129 0.3
130 0.38
131 0.39
132 0.39
133 0.45
134 0.44
135 0.41
136 0.39
137 0.31
138 0.24
139 0.25
140 0.27
141 0.19
142 0.19
143 0.19
144 0.18
145 0.17
146 0.15
147 0.13
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.17
157 0.19
158 0.21
159 0.22
160 0.22
161 0.22
162 0.22
163 0.21
164 0.16
165 0.14
166 0.12
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.17
172 0.16
173 0.18
174 0.17
175 0.15
176 0.18
177 0.19
178 0.19
179 0.18
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.18
184 0.17
185 0.22
186 0.23
187 0.23
188 0.23
189 0.2
190 0.2
191 0.21
192 0.19
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.17
206 0.2
207 0.23
208 0.23
209 0.25
210 0.25
211 0.26
212 0.27
213 0.26
214 0.22
215 0.19
216 0.22
217 0.25
218 0.24
219 0.23
220 0.21
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.13
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.16
243 0.16
244 0.2
245 0.23
246 0.23
247 0.23
248 0.22
249 0.25
250 0.25
251 0.27
252 0.28
253 0.28
254 0.27
255 0.25
256 0.26
257 0.23
258 0.22
259 0.19
260 0.15
261 0.13
262 0.12
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.19
269 0.21
270 0.23
271 0.24
272 0.27
273 0.28
274 0.28
275 0.28
276 0.24
277 0.19
278 0.19
279 0.19
280 0.15
281 0.15
282 0.14
283 0.16
284 0.18
285 0.19
286 0.2
287 0.25
288 0.33
289 0.38
290 0.44
291 0.46
292 0.52
293 0.58
294 0.6
295 0.61
296 0.57
297 0.58
298 0.58
299 0.57
300 0.48
301 0.42
302 0.4
303 0.35
304 0.36
305 0.37
306 0.38
307 0.36
308 0.38
309 0.41
310 0.41
311 0.42
312 0.42
313 0.44
314 0.45
315 0.48
316 0.54
317 0.56
318 0.57
319 0.59
320 0.61
321 0.6
322 0.57
323 0.6
324 0.55
325 0.61
326 0.62
327 0.64
328 0.58
329 0.58
330 0.63
331 0.58
332 0.61
333 0.57
334 0.57
335 0.52
336 0.54
337 0.52
338 0.43
339 0.39
340 0.36
341 0.34
342 0.28
343 0.27
344 0.23
345 0.17
346 0.17
347 0.18
348 0.13
349 0.09
350 0.08
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.1
374 0.14
375 0.15
376 0.16
377 0.18
378 0.18
379 0.19
380 0.23
381 0.23
382 0.2
383 0.2
384 0.2
385 0.19
386 0.2
387 0.2
388 0.16
389 0.12
390 0.11
391 0.1
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.08
404 0.07
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.07
415 0.07
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.13
420 0.15
421 0.22
422 0.22
423 0.24
424 0.24
425 0.24
426 0.24
427 0.22
428 0.19
429 0.12
430 0.1
431 0.1
432 0.09
433 0.1
434 0.1
435 0.11
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.13
440 0.14
441 0.13
442 0.14
443 0.16
444 0.16
445 0.15
446 0.17
447 0.15
448 0.15
449 0.15
450 0.14
451 0.11
452 0.1
453 0.11
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.09
467 0.11
468 0.1
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.1
473 0.13
474 0.13
475 0.12
476 0.13
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.15
481 0.15
482 0.17
483 0.18
484 0.18
485 0.19
486 0.2
487 0.2
488 0.21
489 0.24
490 0.25
491 0.25
492 0.24
493 0.24
494 0.23
495 0.23
496 0.25
497 0.26
498 0.23
499 0.26
500 0.28
501 0.27
502 0.28
503 0.28
504 0.23
505 0.18
506 0.17
507 0.14
508 0.13
509 0.14
510 0.13
511 0.17
512 0.17
513 0.15
514 0.13
515 0.13
516 0.12
517 0.11
518 0.13
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.12
524 0.17
525 0.2
526 0.23
527 0.25
528 0.25
529 0.27
530 0.26
531 0.25
532 0.19
533 0.16
534 0.12
535 0.13
536 0.12
537 0.12
538 0.14
539 0.14
540 0.15
541 0.19
542 0.22
543 0.2
544 0.2
545 0.21
546 0.17
547 0.17
548 0.16
549 0.13
550 0.09
551 0.09
552 0.11
553 0.11
554 0.11
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.15
559 0.16
560 0.17
561 0.18
562 0.18
563 0.23
564 0.25
565 0.24
566 0.24
567 0.25
568 0.22
569 0.21
570 0.2
571 0.15
572 0.12
573 0.13
574 0.13
575 0.12
576 0.12
577 0.13
578 0.14
579 0.17
580 0.19
581 0.19
582 0.23
583 0.25
584 0.28
585 0.28
586 0.27
587 0.24
588 0.23
589 0.21
590 0.17
591 0.13
592 0.1
593 0.09
594 0.08
595 0.08
596 0.07
597 0.07
598 0.06
599 0.08
600 0.09
601 0.1
602 0.11
603 0.11
604 0.11
605 0.12
606 0.11
607 0.09
608 0.09
609 0.07
610 0.12
611 0.12
612 0.11
613 0.13
614 0.14
615 0.13
616 0.13
617 0.13
618 0.09
619 0.1
620 0.12
621 0.11
622 0.11
623 0.11
624 0.11
625 0.11
626 0.1
627 0.09
628 0.06
629 0.05
630 0.04
631 0.04
632 0.05
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.08
637 0.1
638 0.12
639 0.13
640 0.13
641 0.13
642 0.13
643 0.14
644 0.13
645 0.11
646 0.09
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.09
651 0.09
652 0.09
653 0.08
654 0.08
655 0.09
656 0.07
657 0.05
658 0.03
659 0.05
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.07
667 0.08
668 0.09
669 0.11
670 0.12
671 0.11
672 0.15
673 0.15
674 0.14
675 0.12
676 0.1
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.04
681 0.04
682 0.03
683 0.03
684 0.03
685 0.03
686 0.03
687 0.04
688 0.05
689 0.05
690 0.06
691 0.07
692 0.08
693 0.12
694 0.17
695 0.2
696 0.25
697 0.28
698 0.3
699 0.31
700 0.31
701 0.29
702 0.28
703 0.24
704 0.18
705 0.17
706 0.14
707 0.15
708 0.14
709 0.12
710 0.08
711 0.09
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.06
716 0.15
717 0.23
718 0.29
719 0.36
720 0.37
721 0.39
722 0.4
723 0.4
724 0.32
725 0.26
726 0.23
727 0.19
728 0.18
729 0.17
730 0.16
731 0.16
732 0.15
733 0.14
734 0.1
735 0.06
736 0.06
737 0.05
738 0.06
739 0.05
740 0.04
741 0.04
742 0.03
743 0.04
744 0.04
745 0.04
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.05
750 0.05
751 0.06
752 0.06
753 0.06
754 0.07
755 0.1
756 0.12
757 0.12
758 0.15
759 0.18
760 0.25
761 0.3
762 0.32
763 0.34
764 0.36
765 0.41
766 0.45
767 0.45
768 0.42
769 0.38
770 0.38
771 0.37
772 0.37
773 0.31
774 0.29
775 0.26
776 0.23
777 0.22
778 0.2
779 0.17
780 0.14
781 0.16
782 0.11
783 0.11
784 0.15
785 0.15
786 0.18
787 0.17
788 0.16
789 0.14
790 0.14
791 0.15
792 0.12
793 0.17
794 0.17
795 0.21
796 0.25
797 0.28
798 0.31
799 0.33
800 0.38
801 0.4
802 0.4
803 0.42
804 0.43
805 0.44
806 0.44
807 0.51
808 0.52
809 0.5
810 0.54
811 0.5
812 0.49
813 0.45
814 0.44
815 0.41
816 0.35
817 0.3
818 0.23
819 0.2
820 0.17
821 0.17
822 0.14
823 0.07
824 0.04
825 0.04
826 0.03
827 0.03
828 0.03
829 0.03
830 0.08
831 0.1
832 0.11
833 0.14
834 0.15
835 0.15
836 0.16
837 0.24
838 0.21
839 0.27
840 0.31
841 0.32
842 0.39
843 0.38
844 0.38
845 0.32
846 0.31
847 0.24
848 0.19
849 0.16
850 0.09
851 0.09
852 0.07
853 0.07
854 0.08
855 0.11
856 0.12
857 0.12
858 0.14
859 0.14
860 0.17
861 0.16
862 0.15
863 0.13
864 0.13
865 0.13
866 0.12
867 0.12
868 0.1
869 0.1
870 0.11
871 0.1
872 0.09
873 0.11
874 0.11
875 0.12
876 0.17
877 0.19
878 0.22
879 0.22
880 0.23
881 0.22
882 0.23
883 0.22
884 0.19
885 0.22
886 0.19
887 0.23
888 0.24
889 0.25
890 0.27
891 0.29
892 0.26
893 0.23
894 0.26
895 0.23
896 0.21
897 0.19
898 0.15
899 0.13
900 0.13
901 0.15
902 0.16
903 0.16
904 0.17
905 0.19
906 0.19
907 0.19
908 0.21
909 0.2
910 0.14
911 0.14
912 0.13
913 0.12
914 0.11
915 0.1
916 0.07
917 0.06
918 0.06
919 0.05
920 0.05
921 0.04
922 0.04
923 0.04
924 0.05
925 0.05
926 0.06
927 0.07
928 0.07
929 0.08
930 0.08
931 0.09
932 0.11
933 0.14
934 0.15
935 0.15
936 0.16
937 0.19
938 0.21
939 0.21
940 0.19
941 0.19
942 0.24
943 0.3
944 0.34
945 0.39
946 0.42
947 0.47
948 0.5
949 0.47
950 0.48
951 0.47
952 0.47
953 0.42
954 0.4
955 0.38
956 0.36
957 0.39
958 0.35
959 0.32
960 0.27
961 0.26
962 0.26
963 0.24
964 0.29
965 0.28
966 0.28
967 0.33
968 0.37
969 0.38
970 0.39
971 0.37
972 0.34
973 0.32
974 0.29
975 0.22
976 0.16
977 0.12
978 0.09
979 0.09
980 0.06
981 0.05
982 0.05
983 0.06
984 0.1
985 0.13
986 0.16
987 0.18
988 0.2
989 0.2
990 0.23
991 0.23
992 0.22
993 0.23
994 0.23
995 0.24
996 0.22
997 0.22
998 0.2
999 0.21
1000 0.19
1001 0.18
1002 0.16
1003 0.14
1004 0.15
1005 0.16
1006 0.15
1007 0.14
1008 0.14
1009 0.12
1010 0.12
1011 0.12
1012 0.1
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.07
1016 0.07
1017 0.08
1018 0.1
1019 0.14
1020 0.15
1021 0.16
1022 0.2
1023 0.2
1024 0.21
1025 0.21
1026 0.24
1027 0.21
1028 0.22
1029 0.21
1030 0.18
1031 0.18
1032 0.16
1033 0.14
1034 0.09
1035 0.07
1036 0.07
1037 0.08
1038 0.08
1039 0.08
1040 0.09
1041 0.09
1042 0.09
1043 0.1
1044 0.12
1045 0.13
1046 0.16
1047 0.2
1048 0.24
1049 0.26
1050 0.32
1051 0.33
1052 0.32
1053 0.35
1054 0.36
1055 0.34
1056 0.31
1057 0.3
1058 0.24
1059 0.24
1060 0.23
1061 0.18
1062 0.2
1063 0.2
1064 0.22
1065 0.24
1066 0.25
1067 0.26
1068 0.27
1069 0.3
1070 0.26
1071 0.24
1072 0.22
1073 0.2
1074 0.22
1075 0.2
1076 0.19
1077 0.18
1078 0.19
1079 0.21
1080 0.2
1081 0.19
1082 0.16
1083 0.17
1084 0.18
1085 0.2
1086 0.18
1087 0.16
1088 0.18
1089 0.18
1090 0.19
1091 0.21
1092 0.23
1093 0.19
1094 0.22
1095 0.21
1096 0.21
1097 0.2
1098 0.18
1099 0.17
1100 0.13
1101 0.12
1102 0.11
1103 0.14
1104 0.13
1105 0.13
1106 0.13
1107 0.12
1108 0.12
1109 0.12
1110 0.12
1111 0.1
1112 0.13
1113 0.14
1114 0.14
1115 0.15
1116 0.14
1117 0.14
1118 0.14
1119 0.13
1120 0.1
1121 0.08
1122 0.07
1123 0.08
1124 0.08
1125 0.07
1126 0.08
1127 0.08
1128 0.07
1129 0.08
1130 0.1
1131 0.12
1132 0.15
1133 0.22
1134 0.23
1135 0.26
1136 0.3
1137 0.31
1138 0.32
1139 0.36
1140 0.34
1141 0.28
1142 0.3
1143 0.29
1144 0.27
1145 0.28
1146 0.29
1147 0.25
1148 0.24
1149 0.23
1150 0.2
1151 0.17
1152 0.17
1153 0.15
1154 0.12
1155 0.09
1156 0.09
1157 0.11
1158 0.1
1159 0.1
1160 0.1
1161 0.09
1162 0.08
1163 0.1
1164 0.08
1165 0.07
1166 0.08
1167 0.08
1168 0.12
1169 0.13
1170 0.14
1171 0.15
1172 0.15
1173 0.15
1174 0.14
1175 0.15
1176 0.13
1177 0.21
1178 0.28
1179 0.31
1180 0.36
1181 0.36
1182 0.37
1183 0.39
1184 0.36
1185 0.3
1186 0.22
1187 0.2
1188 0.14
1189 0.15
1190 0.14
1191 0.12
1192 0.11
1193 0.1
1194 0.13
1195 0.1
1196 0.11