Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6UX98

Protein Details
Accession A0A5N6UX98    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-152DNLKLIGRHKRKRTEDGERSTRKREGRREKKSRRMRDLEEAGDDGEGKAKKRERKRREPTPEDDETBasic
167-186MDEALKKPTKRRFRKADGIDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-144GRHKRKRTEDGERSTRKREGRREKKSRRMRDLEEAGDDGEGKAKKRERKRRE
159-163RRRAL
165-165R
169-181EALKKPTKRRFRK
411-426RKMRARQIAASKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEIKPVEEDPVQAPTPGAGDDEPQGVEETPAADVDADEDAEEEKDNGSDDESILSEVDEAQFEDFDPENVDVEDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRKRTEDGERSTRKREGRREKKSRRMRDLEEAGDDGEGKAKKRERKRREPTPEDDETLDPATRRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRKADGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAISRREGKPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTSLAKLPINKEALVASGIGKVIVFYTRSKRPEAGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAEFDPRKVQRTTQSAQATAAEARARELLPPRLANRARAEITHTSYTVVPRPTMVQESKFARPLGASGEDRFRKMRARQIAASKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.26
4 0.25
5 0.18
6 0.17
7 0.15
8 0.15
9 0.1
10 0.11
11 0.13
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.15
16 0.13
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.11
55 0.11
56 0.1
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.1
63 0.12
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.14
78 0.19
79 0.27
80 0.34
81 0.43
82 0.51
83 0.61
84 0.69
85 0.77
86 0.79
87 0.81
88 0.8
89 0.81
90 0.82
91 0.81
92 0.79
93 0.75
94 0.73
95 0.7
96 0.69
97 0.7
98 0.71
99 0.73
100 0.79
101 0.85
102 0.89
103 0.92
104 0.94
105 0.93
106 0.92
107 0.89
108 0.83
109 0.82
110 0.77
111 0.69
112 0.6
113 0.5
114 0.39
115 0.31
116 0.26
117 0.16
118 0.15
119 0.14
120 0.13
121 0.19
122 0.24
123 0.33
124 0.43
125 0.55
126 0.6
127 0.7
128 0.8
129 0.84
130 0.89
131 0.89
132 0.85
133 0.82
134 0.75
135 0.66
136 0.58
137 0.47
138 0.38
139 0.31
140 0.25
141 0.17
142 0.18
143 0.23
144 0.25
145 0.26
146 0.28
147 0.33
148 0.39
149 0.47
150 0.52
151 0.48
152 0.48
153 0.48
154 0.46
155 0.4
156 0.37
157 0.35
158 0.3
159 0.28
160 0.31
161 0.38
162 0.48
163 0.57
164 0.63
165 0.67
166 0.71
167 0.8
168 0.78
169 0.78
170 0.71
171 0.66
172 0.57
173 0.47
174 0.39
175 0.29
176 0.24
177 0.14
178 0.09
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.11
189 0.12
190 0.17
191 0.18
192 0.2
193 0.21
194 0.21
195 0.23
196 0.21
197 0.2
198 0.16
199 0.16
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.14
204 0.21
205 0.31
206 0.37
207 0.37
208 0.38
209 0.37
210 0.43
211 0.45
212 0.36
213 0.26
214 0.21
215 0.21
216 0.2
217 0.19
218 0.14
219 0.11
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.12
254 0.11
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.19
270 0.21
271 0.2
272 0.19
273 0.16
274 0.16
275 0.15
276 0.14
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.1
287 0.17
288 0.24
289 0.27
290 0.3
291 0.31
292 0.33
293 0.42
294 0.46
295 0.5
296 0.5
297 0.5
298 0.51
299 0.52
300 0.49
301 0.4
302 0.33
303 0.25
304 0.26
305 0.23
306 0.2
307 0.19
308 0.2
309 0.23
310 0.24
311 0.24
312 0.19
313 0.21
314 0.25
315 0.3
316 0.38
317 0.37
318 0.39
319 0.41
320 0.43
321 0.42
322 0.4
323 0.35
324 0.28
325 0.32
326 0.34
327 0.39
328 0.37
329 0.36
330 0.4
331 0.42
332 0.46
333 0.4
334 0.39
335 0.38
336 0.44
337 0.45
338 0.49
339 0.48
340 0.45
341 0.44
342 0.4
343 0.34
344 0.27
345 0.27
346 0.19
347 0.15
348 0.16
349 0.17
350 0.16
351 0.18
352 0.23
353 0.27
354 0.31
355 0.36
356 0.36
357 0.44
358 0.46
359 0.48
360 0.48
361 0.49
362 0.45
363 0.41
364 0.46
365 0.42
366 0.45
367 0.42
368 0.37
369 0.31
370 0.32
371 0.35
372 0.34
373 0.3
374 0.25
375 0.23
376 0.26
377 0.28
378 0.33
379 0.34
380 0.31
381 0.36
382 0.41
383 0.45
384 0.46
385 0.43
386 0.36
387 0.32
388 0.3
389 0.29
390 0.3
391 0.27
392 0.26
393 0.36
394 0.38
395 0.4
396 0.41
397 0.39
398 0.41
399 0.45
400 0.52
401 0.52
402 0.57
403 0.61
404 0.69
405 0.75
406 0.73