Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6UG48

Protein Details
Accession A0A5N6UG48    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-67SEEEKPAKKQKEEPKKESKKVKESKKAKESSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-63KPAKKQKEEPKKESKKVKESKKAK
114-117APKK
395-438GGGGGRGRGGFGGRGGGGPRGGGRGGRGGFGGRGGGPPNKARGG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MRRWSLPAPAARVKVRMRSLPRRSDEEMEDASSSESEEEKPAKKQKEEPKKESKKVKESKKAKESSESSDSSESESESESEDEKPAKKEVKKAAESSDSSESDSSDEEEAPKKAPKKAAKEASDSDSSESESESDSEEAPEKAKKESSESSDSDSDSDSSESESEDSEESAKDSKKRKAEEDVSTTPKKTKTEEPAAGASANLFVGNLSWNVDEAWLQSEFEEFGELSGVRIMTERDTGRSRGFGYVEYTNAVDAAKAFEAKKDTEIDGRKINLDYATGRPANRDQGGFQDRAQARARSFGDQASPESDTLFVGNIPFSANEDSLHEVFGQKGSVMGIRLPTDPESGRPKGFGYVQFSSVEEARAAFNELNGAEIDGRPVRLDFSTPRANNGGGGGGGGRGRGGFGGRGGGGPRGGGRGGRGGFGGRGGGPPNKARGGIPEYKGTKVTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.56
3 0.58
4 0.6
5 0.66
6 0.72
7 0.75
8 0.76
9 0.74
10 0.73
11 0.7
12 0.64
13 0.6
14 0.52
15 0.44
16 0.39
17 0.32
18 0.28
19 0.22
20 0.18
21 0.13
22 0.12
23 0.11
24 0.16
25 0.2
26 0.23
27 0.32
28 0.4
29 0.47
30 0.51
31 0.59
32 0.65
33 0.71
34 0.78
35 0.79
36 0.82
37 0.85
38 0.89
39 0.9
40 0.89
41 0.89
42 0.88
43 0.9
44 0.89
45 0.88
46 0.9
47 0.9
48 0.86
49 0.79
50 0.79
51 0.72
52 0.69
53 0.66
54 0.57
55 0.5
56 0.46
57 0.42
58 0.35
59 0.31
60 0.24
61 0.18
62 0.17
63 0.14
64 0.14
65 0.15
66 0.13
67 0.14
68 0.16
69 0.19
70 0.21
71 0.23
72 0.27
73 0.34
74 0.37
75 0.44
76 0.51
77 0.57
78 0.59
79 0.6
80 0.6
81 0.59
82 0.56
83 0.53
84 0.49
85 0.4
86 0.36
87 0.33
88 0.27
89 0.21
90 0.2
91 0.17
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.16
96 0.16
97 0.18
98 0.23
99 0.25
100 0.29
101 0.37
102 0.43
103 0.49
104 0.58
105 0.65
106 0.64
107 0.66
108 0.64
109 0.61
110 0.56
111 0.48
112 0.4
113 0.31
114 0.27
115 0.21
116 0.17
117 0.13
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.1
124 0.12
125 0.11
126 0.13
127 0.15
128 0.14
129 0.16
130 0.18
131 0.18
132 0.22
133 0.27
134 0.31
135 0.34
136 0.35
137 0.37
138 0.36
139 0.35
140 0.3
141 0.26
142 0.2
143 0.15
144 0.14
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.12
158 0.14
159 0.19
160 0.26
161 0.32
162 0.38
163 0.41
164 0.44
165 0.49
166 0.54
167 0.55
168 0.56
169 0.55
170 0.55
171 0.54
172 0.5
173 0.45
174 0.41
175 0.36
176 0.32
177 0.33
178 0.35
179 0.42
180 0.44
181 0.43
182 0.41
183 0.4
184 0.36
185 0.29
186 0.2
187 0.12
188 0.09
189 0.06
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.09
222 0.1
223 0.12
224 0.15
225 0.16
226 0.17
227 0.18
228 0.18
229 0.17
230 0.17
231 0.15
232 0.16
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.13
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.05
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.12
248 0.12
249 0.14
250 0.15
251 0.16
252 0.21
253 0.24
254 0.25
255 0.26
256 0.27
257 0.26
258 0.24
259 0.24
260 0.18
261 0.16
262 0.15
263 0.13
264 0.18
265 0.18
266 0.18
267 0.2
268 0.22
269 0.25
270 0.25
271 0.24
272 0.19
273 0.26
274 0.3
275 0.28
276 0.26
277 0.31
278 0.29
279 0.33
280 0.36
281 0.3
282 0.27
283 0.33
284 0.34
285 0.28
286 0.29
287 0.25
288 0.25
289 0.23
290 0.24
291 0.19
292 0.19
293 0.16
294 0.15
295 0.14
296 0.11
297 0.1
298 0.09
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.12
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.11
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.15
328 0.16
329 0.17
330 0.17
331 0.22
332 0.27
333 0.28
334 0.28
335 0.28
336 0.27
337 0.27
338 0.31
339 0.31
340 0.31
341 0.3
342 0.31
343 0.31
344 0.3
345 0.29
346 0.25
347 0.21
348 0.14
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.13
353 0.11
354 0.1
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.17
370 0.17
371 0.22
372 0.32
373 0.32
374 0.36
375 0.36
376 0.36
377 0.33
378 0.3
379 0.25
380 0.14
381 0.14
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.11
394 0.12
395 0.13
396 0.14
397 0.15
398 0.14
399 0.14
400 0.14
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.15
405 0.2
406 0.21
407 0.21
408 0.2
409 0.2
410 0.19
411 0.19
412 0.19
413 0.13
414 0.15
415 0.18
416 0.21
417 0.24
418 0.28
419 0.33
420 0.33
421 0.34
422 0.32
423 0.36
424 0.4
425 0.44
426 0.43
427 0.47
428 0.47
429 0.48