Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6V6D6

Protein Details
Accession A0A5N6V6D6    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-51AEESKARISKRRRTQTQDDESDQHydrophilic
58-78EDLKLSKSKGKAKKLQQQSEDHydrophilic
102-127EQETKTSKRKPLDKGKPPKKNKTGVVBasic
268-289LDGMQRKNEEKKKRKMEAGDAGBasic
296-315LKVRRTFKQNEVKKGRHTIKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-123SKRKPLDKGKPPKKNK
168-175PRRRSNKR
277-282EKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MTTRKRNEFLDLAPSDDEDNDRGYDSEAAEESKARISKRRRTQTQDDESDQSDNDSDEDLKLSKSKGKAKKLQQQSEDDDIIDDNDDEQQETSGAQYLDVTEQETKTSKRKPLDKGKPPKKNKTGVVYLSSLPPYLKPFALKSMLEARSFGPITKVFLSPAVKPASAPRRRSNKRKTYTDGWVEFASKKTAKLCAETLNASIVGGRKGGWYHDDVWNMKYLRGFKWGDLMEQVQRERQEREAKQRIEDSRARKEDKVFLQGVETGKVLDGMQRKNEEKKKRKMEAGDAGGQQTAELKVRRTFKQNEVKKGRHTIKDGEASLEDDTKRVLGKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.28
3 0.25
4 0.24
5 0.15
6 0.16
7 0.14
8 0.15
9 0.14
10 0.15
11 0.16
12 0.15
13 0.16
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.19
20 0.22
21 0.22
22 0.3
23 0.38
24 0.48
25 0.58
26 0.67
27 0.71
28 0.77
29 0.85
30 0.87
31 0.88
32 0.85
33 0.79
34 0.71
35 0.63
36 0.56
37 0.45
38 0.35
39 0.26
40 0.19
41 0.15
42 0.13
43 0.12
44 0.1
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.14
49 0.15
50 0.19
51 0.25
52 0.35
53 0.42
54 0.51
55 0.6
56 0.68
57 0.76
58 0.81
59 0.83
60 0.8
61 0.77
62 0.73
63 0.7
64 0.61
65 0.5
66 0.4
67 0.31
68 0.25
69 0.19
70 0.13
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.09
89 0.1
90 0.12
91 0.14
92 0.16
93 0.22
94 0.29
95 0.34
96 0.39
97 0.47
98 0.55
99 0.64
100 0.72
101 0.76
102 0.81
103 0.85
104 0.88
105 0.89
106 0.9
107 0.87
108 0.84
109 0.8
110 0.75
111 0.72
112 0.64
113 0.59
114 0.5
115 0.43
116 0.36
117 0.31
118 0.24
119 0.17
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.17
127 0.21
128 0.19
129 0.19
130 0.26
131 0.28
132 0.26
133 0.26
134 0.23
135 0.23
136 0.23
137 0.21
138 0.15
139 0.13
140 0.15
141 0.16
142 0.16
143 0.12
144 0.16
145 0.17
146 0.15
147 0.19
148 0.19
149 0.17
150 0.17
151 0.23
152 0.3
153 0.34
154 0.39
155 0.42
156 0.51
157 0.59
158 0.69
159 0.74
160 0.74
161 0.76
162 0.78
163 0.77
164 0.71
165 0.72
166 0.69
167 0.6
168 0.51
169 0.43
170 0.38
171 0.32
172 0.28
173 0.24
174 0.17
175 0.17
176 0.16
177 0.21
178 0.21
179 0.22
180 0.23
181 0.23
182 0.25
183 0.25
184 0.23
185 0.19
186 0.18
187 0.15
188 0.14
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.14
199 0.18
200 0.23
201 0.23
202 0.23
203 0.28
204 0.27
205 0.26
206 0.25
207 0.24
208 0.21
209 0.27
210 0.27
211 0.21
212 0.28
213 0.27
214 0.25
215 0.25
216 0.25
217 0.22
218 0.24
219 0.25
220 0.21
221 0.24
222 0.26
223 0.26
224 0.3
225 0.37
226 0.38
227 0.48
228 0.55
229 0.54
230 0.55
231 0.6
232 0.57
233 0.54
234 0.56
235 0.52
236 0.53
237 0.58
238 0.58
239 0.54
240 0.55
241 0.56
242 0.54
243 0.54
244 0.44
245 0.38
246 0.35
247 0.36
248 0.33
249 0.26
250 0.21
251 0.14
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.13
256 0.18
257 0.2
258 0.25
259 0.31
260 0.35
261 0.44
262 0.54
263 0.6
264 0.64
265 0.72
266 0.77
267 0.79
268 0.83
269 0.8
270 0.8
271 0.79
272 0.75
273 0.71
274 0.61
275 0.54
276 0.47
277 0.39
278 0.3
279 0.22
280 0.17
281 0.16
282 0.17
283 0.2
284 0.25
285 0.32
286 0.37
287 0.43
288 0.48
289 0.53
290 0.62
291 0.67
292 0.72
293 0.76
294 0.78
295 0.77
296 0.81
297 0.79
298 0.76
299 0.73
300 0.69
301 0.68
302 0.7
303 0.63
304 0.56
305 0.48
306 0.43
307 0.39
308 0.36
309 0.28
310 0.2
311 0.2
312 0.18
313 0.18