Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6V4C1

Protein Details
Accession A0A5N6V4C1    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-81RVPTAVPSPEKERKRKHKNKDVSCSSPSKKKRKHESSQFTDETAAHDSEKKKKSKKSKDKTKIKQAGTEEHydrophilic
390-418SKTKEPTAEKGKKSKSSKSKKEKKEKKEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-34KERKRKHKNKDVS
36-44SSPSKKKRK
61-75KKKKSKKSKDKTKIK
394-418EPTAEKGKKSKSSKSKKEKKEKKEK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MVVDAMEIDSDRVPTAVPSPEKERKRKHKNKDVSCSSPSKKKRKHESSQFTDETAAHDSEKKKKSKKSKDKTKIKQAGTEETAIPDSPYVLTTATLYLPLSPISISPTHAKASLLAEHLSPLLLTYYAPLQGVVLAYSDASISSTPPSSSTSSNPADPNPKPLTLAKTAGEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPSNWKWVPPGEEGSVSGDQQKTTTASEDDESEPSASFDQEKEHFNPVSLANPVSDTLNEEVNADDDESAAEGYFQSVSGHRVRGTVRFRVVDVDVIPGSERDRSFLSIEGTMLPPEEEARVLEDERNGILTTSATPRRGLSQEPRVSMSGALAAPSVAAIPEPETPSKTKEPTAEKGKKSKSSKSKKEKKEKKEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.2
4 0.22
5 0.26
6 0.35
7 0.44
8 0.54
9 0.63
10 0.7
11 0.73
12 0.82
13 0.88
14 0.9
15 0.92
16 0.94
17 0.94
18 0.94
19 0.92
20 0.88
21 0.84
22 0.83
23 0.78
24 0.77
25 0.77
26 0.77
27 0.77
28 0.8
29 0.84
30 0.85
31 0.9
32 0.91
33 0.92
34 0.9
35 0.9
36 0.81
37 0.71
38 0.63
39 0.52
40 0.43
41 0.36
42 0.28
43 0.2
44 0.23
45 0.27
46 0.35
47 0.43
48 0.49
49 0.54
50 0.63
51 0.73
52 0.79
53 0.85
54 0.87
55 0.9
56 0.92
57 0.95
58 0.96
59 0.96
60 0.94
61 0.86
62 0.82
63 0.75
64 0.73
65 0.65
66 0.57
67 0.46
68 0.38
69 0.35
70 0.28
71 0.23
72 0.15
73 0.12
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.1
91 0.11
92 0.13
93 0.15
94 0.17
95 0.18
96 0.19
97 0.19
98 0.18
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.17
103 0.16
104 0.16
105 0.15
106 0.13
107 0.1
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.12
135 0.13
136 0.15
137 0.17
138 0.22
139 0.23
140 0.26
141 0.26
142 0.26
143 0.31
144 0.3
145 0.35
146 0.31
147 0.3
148 0.29
149 0.3
150 0.32
151 0.28
152 0.3
153 0.23
154 0.22
155 0.22
156 0.2
157 0.17
158 0.12
159 0.09
160 0.07
161 0.06
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.15
175 0.16
176 0.19
177 0.19
178 0.21
179 0.16
180 0.21
181 0.21
182 0.19
183 0.18
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.12
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.03
203 0.04
204 0.05
205 0.08
206 0.09
207 0.12
208 0.15
209 0.17
210 0.23
211 0.28
212 0.38
213 0.42
214 0.46
215 0.46
216 0.45
217 0.47
218 0.42
219 0.39
220 0.3
221 0.23
222 0.19
223 0.2
224 0.19
225 0.16
226 0.16
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.11
249 0.13
250 0.16
251 0.18
252 0.22
253 0.22
254 0.22
255 0.23
256 0.2
257 0.2
258 0.18
259 0.16
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.1
288 0.13
289 0.15
290 0.15
291 0.18
292 0.19
293 0.27
294 0.31
295 0.33
296 0.35
297 0.34
298 0.34
299 0.35
300 0.34
301 0.28
302 0.24
303 0.21
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.13
308 0.13
309 0.15
310 0.14
311 0.13
312 0.15
313 0.17
314 0.18
315 0.2
316 0.22
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.17
321 0.15
322 0.14
323 0.11
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.1
330 0.12
331 0.13
332 0.15
333 0.16
334 0.16
335 0.16
336 0.17
337 0.14
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.12
342 0.18
343 0.23
344 0.23
345 0.24
346 0.25
347 0.3
348 0.31
349 0.36
350 0.37
351 0.43
352 0.48
353 0.5
354 0.52
355 0.47
356 0.46
357 0.39
358 0.31
359 0.24
360 0.18
361 0.16
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.07
371 0.11
372 0.15
373 0.17
374 0.21
375 0.23
376 0.3
377 0.36
378 0.38
379 0.39
380 0.43
381 0.49
382 0.55
383 0.64
384 0.67
385 0.68
386 0.74
387 0.78
388 0.8
389 0.8
390 0.81
391 0.81
392 0.83
393 0.86
394 0.87
395 0.89
396 0.91
397 0.95
398 0.95