Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6UHN4

Protein Details
Accession A0A5N6UHN4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-302SEFPKLSRSEKKQMKREAKEAKKQEKRVGFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-298RSEKKQMKREAKEAKKQEKR
Subcellular Location(s) plas 18, E.R. 3, pero 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MGLTPKCDLTNENAQYPYCASPPAAIIFSVLFGVTFVGHFALAILYRKKFCWVIIVGSGWECLGLIMRAYSTLDQTKSSTLAAAQLLVLLAPLWINAFVYMIFGRMVYYYTPNKKIKGIKAESMAKIFIWLDITAFIIQGTGGILDSDGFGEKLNRTGMNIYTAGIAIQEFFILCFCALLIVFHKRMLSGYRNIERGNGWKLMVYGMYVTLLCLTTRIVYRLIEFANPNQAGKTVLSTKEAPFYILECVPIFIGMMLWNVLHPGRMMPGPDSEFPKLSRSEKKQMKREAKEAKKQEKRVGFSQKYTAVNDSEYTLTRPSHEEHEAGYGGGRWPLNEVESGRGGGYGGREYGYVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.38
4 0.34
5 0.24
6 0.22
7 0.18
8 0.18
9 0.2
10 0.21
11 0.19
12 0.16
13 0.16
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.1
18 0.07
19 0.06
20 0.06
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.05
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.08
30 0.13
31 0.17
32 0.2
33 0.22
34 0.23
35 0.27
36 0.28
37 0.26
38 0.29
39 0.27
40 0.27
41 0.29
42 0.3
43 0.26
44 0.25
45 0.25
46 0.17
47 0.14
48 0.1
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.08
57 0.09
58 0.11
59 0.15
60 0.16
61 0.17
62 0.19
63 0.2
64 0.19
65 0.19
66 0.16
67 0.12
68 0.14
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.04
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.12
96 0.18
97 0.24
98 0.33
99 0.35
100 0.37
101 0.43
102 0.48
103 0.51
104 0.54
105 0.52
106 0.49
107 0.53
108 0.57
109 0.52
110 0.47
111 0.4
112 0.3
113 0.27
114 0.22
115 0.15
116 0.11
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.09
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.07
153 0.07
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.06
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.15
175 0.16
176 0.18
177 0.24
178 0.27
179 0.29
180 0.29
181 0.3
182 0.27
183 0.27
184 0.25
185 0.2
186 0.17
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.1
192 0.07
193 0.05
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.21
214 0.21
215 0.21
216 0.18
217 0.18
218 0.17
219 0.16
220 0.18
221 0.14
222 0.15
223 0.18
224 0.2
225 0.2
226 0.23
227 0.23
228 0.21
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.15
233 0.16
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.08
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.15
256 0.18
257 0.21
258 0.25
259 0.25
260 0.26
261 0.26
262 0.29
263 0.29
264 0.32
265 0.39
266 0.42
267 0.5
268 0.58
269 0.66
270 0.72
271 0.79
272 0.83
273 0.8
274 0.82
275 0.83
276 0.83
277 0.84
278 0.85
279 0.85
280 0.84
281 0.84
282 0.83
283 0.81
284 0.77
285 0.76
286 0.76
287 0.7
288 0.65
289 0.65
290 0.62
291 0.57
292 0.54
293 0.48
294 0.38
295 0.35
296 0.31
297 0.27
298 0.23
299 0.2
300 0.2
301 0.2
302 0.19
303 0.19
304 0.21
305 0.22
306 0.26
307 0.27
308 0.26
309 0.24
310 0.28
311 0.27
312 0.24
313 0.22
314 0.17
315 0.15
316 0.18
317 0.17
318 0.13
319 0.15
320 0.17
321 0.17
322 0.19
323 0.2
324 0.2
325 0.22
326 0.22
327 0.2
328 0.18
329 0.17
330 0.15
331 0.16
332 0.14
333 0.13
334 0.12