FuNGI

A0A5N6F3E7

Protein Details

Accession

A0A5N6F3E7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
405-429	AEAEYKRKLKQKRQERKEARDGPAK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
410-437	KRKLKQKRQERKEARDGPAKAKKGPPGP
484-511	RGGFRGGRGRGRGFDRGRGGRGRGGGPR

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MSDQQPPVQPQHSLEDANEGPPVKRTCMNDTPPIALTPADDGSDFYNTPWVARTPAEPSENPGVAIHGQTNEPATTSHPSTLIPGLNLVNDSLKDLQPAQSDPSPSLNPAPQEGAHTDTQNGMDIEEAEPKKQEPAVESIGNVEGKQNSEPRNQTEVTSQAQADDNMANGDASGTGTVPPPDAMEHDQAEQDAEEHPEWEIDSSPYESSSDDSSSDSSDDSDEDDEDYPILSPEEQARILMQAELGSDDEGEGKGKSGGHIRTANEILEEAPPIPDVTVTPEMKIVHLGNVEAIVENTVLIAANTSGEYQVLESGSLLCLEDRSVTGVVAETLGRVENPLYTIRFPTAAAVEERGLSKGKDVYYVEQHSTFVFTQPLKGMKGSDASNFHDEEIAEDEVEFSDDEAEAEYKRKLKQKRQERKEARDGPAKAKKGPPGPSKLSQTELNYDDNAGEDGYTPLARPKNFHEMMGRQEAPVENDGPTGRGGFRGGRGRGRGFDRGRGGRGRGGGPRETQRQPYQQQGSDAQPQSSNYSQHAYQQTQPNAYGMPQQYPAYPSFPQQQQQQQQQPQPQQQFGQAAAPPGFNFQMPFQQAYPQQNPYQFPPNMQINPLFLAALQQQQQQQQQQQQQYQQQQAPGQQPGQAATMNFDQVKAQLDLLRQLSNNNQGPPRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.33
3	0.31
4	0.29
5	0.29
6	0.25
7	0.22
8	0.27
9	0.3
10	0.26
11	0.31
12	0.34
13	0.4
14	0.48
15	0.54
16	0.55
17	0.55
18	0.55
19	0.51
20	0.47
21	0.39
22	0.29
23	0.24
24	0.19
25	0.17
26	0.14
27	0.13
28	0.13
29	0.14
30	0.17
31	0.17
32	0.13
33	0.18
34	0.17
35	0.18
36	0.2
37	0.19
38	0.19
39	0.2
40	0.22
41	0.22
42	0.28
43	0.33
44	0.3
45	0.35
46	0.39
47	0.38
48	0.36
49	0.31
50	0.27
51	0.23
52	0.24
53	0.2
54	0.15
55	0.15
56	0.15
57	0.17
58	0.15
59	0.14
60	0.13
61	0.15
62	0.18
63	0.2
64	0.21
65	0.2
66	0.2
67	0.22
68	0.25
69	0.24
70	0.19
71	0.19
72	0.18
73	0.18
74	0.18
75	0.16
76	0.14
77	0.12
78	0.15
79	0.15
80	0.15
81	0.16
82	0.17
83	0.2
84	0.21
85	0.23
86	0.25
87	0.25
88	0.27
89	0.27
90	0.3
91	0.28
92	0.27
93	0.29
94	0.27
95	0.25
96	0.25
97	0.26
98	0.21
99	0.24
100	0.24
101	0.24
102	0.23
103	0.23
104	0.21
105	0.2
106	0.2
107	0.19
108	0.18
109	0.13
110	0.11
111	0.12
112	0.12
113	0.19
114	0.19
115	0.17
116	0.18
117	0.19
118	0.21
119	0.21
120	0.22
121	0.16
122	0.21
123	0.26
124	0.25
125	0.25
126	0.24
127	0.25
128	0.24
129	0.21
130	0.18
131	0.14
132	0.15
133	0.18
134	0.22
135	0.24
136	0.31
137	0.35
138	0.38
139	0.42
140	0.41
141	0.39
142	0.37
143	0.37
144	0.32
145	0.31
146	0.25
147	0.21
148	0.22
149	0.2
150	0.18
151	0.15
152	0.12
153	0.1
154	0.1
155	0.08
156	0.07
157	0.07
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.07
164	0.07
165	0.08
166	0.07
167	0.08
168	0.08
169	0.11
170	0.14
171	0.16
172	0.17
173	0.17
174	0.18
175	0.17
176	0.17
177	0.14
178	0.11
179	0.09
180	0.1
181	0.09
182	0.09
183	0.1
184	0.09
185	0.09
186	0.09
187	0.09
188	0.07
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.11
194	0.1
195	0.11
196	0.12
197	0.11
198	0.1
199	0.11
200	0.11
201	0.12
202	0.12
203	0.1
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.1
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.05
219	0.06
220	0.08
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.11
226	0.11
227	0.1
228	0.08
229	0.06
230	0.06
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.05
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.14
245	0.15
246	0.19
247	0.23
248	0.24
249	0.26
250	0.27
251	0.26
252	0.2
253	0.19
254	0.15
255	0.12
256	0.11
257	0.07
258	0.06
259	0.07
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.09
265	0.15
266	0.15
267	0.15
268	0.18
269	0.18
270	0.18
271	0.2
272	0.15
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.06
280	0.06
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.05
298	0.05
299	0.04
300	0.04
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.05
326	0.07
327	0.08
328	0.09
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.08
344	0.09
345	0.11
346	0.11
347	0.14
348	0.15
349	0.16
350	0.21
351	0.24
352	0.24
353	0.21
354	0.21
355	0.18
356	0.19
357	0.17
358	0.12
359	0.13
360	0.12
361	0.12
362	0.14
363	0.16
364	0.14
365	0.15
366	0.14
367	0.12
368	0.15
369	0.15
370	0.17
371	0.18
372	0.2
373	0.22
374	0.21
375	0.2
376	0.19
377	0.17
378	0.15
379	0.15
380	0.12
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.09
386	0.07
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.05
392	0.06
393	0.06
394	0.07
395	0.09
396	0.13
397	0.17
398	0.25
399	0.33
400	0.43
401	0.52
402	0.62
403	0.71
404	0.77
405	0.84
406	0.86
407	0.86
408	0.87
409	0.86
410	0.8
411	0.77
412	0.71
413	0.69
414	0.67
415	0.61
416	0.54
417	0.5
418	0.5
419	0.48
420	0.55
421	0.52
422	0.52
423	0.55
424	0.57
425	0.58
426	0.54
427	0.5
428	0.46
429	0.41
430	0.38
431	0.34
432	0.31
433	0.25
434	0.23
435	0.2
436	0.16
437	0.14
438	0.09
439	0.07
440	0.06
441	0.06
442	0.07
443	0.07
444	0.06
445	0.11
446	0.15
447	0.16
448	0.18
449	0.22
450	0.32
451	0.32
452	0.34
453	0.35
454	0.34
455	0.38
456	0.44
457	0.39
458	0.29
459	0.3
460	0.29
461	0.25
462	0.24
463	0.2
464	0.13
465	0.14
466	0.14
467	0.13
468	0.13
469	0.12
470	0.1
471	0.1
472	0.11
473	0.11
474	0.17
475	0.24
476	0.26
477	0.3
478	0.35
479	0.36
480	0.39
481	0.42
482	0.46
483	0.4
484	0.44
485	0.47
486	0.46
487	0.49
488	0.48
489	0.46
490	0.4
491	0.41
492	0.38
493	0.35
494	0.35
495	0.34
496	0.35
497	0.4
498	0.43
499	0.44
500	0.47
501	0.48
502	0.53
503	0.53
504	0.58
505	0.58
506	0.53
507	0.54
508	0.51
509	0.49
510	0.49
511	0.47
512	0.38
513	0.33
514	0.32
515	0.33
516	0.33
517	0.3
518	0.23
519	0.25
520	0.24
521	0.3
522	0.35
523	0.33
524	0.36
525	0.43
526	0.45
527	0.44
528	0.44
529	0.38
530	0.32
531	0.3
532	0.3
533	0.23
534	0.22
535	0.22
536	0.22
537	0.23
538	0.25
539	0.26
540	0.23
541	0.23
542	0.24
543	0.29
544	0.33
545	0.36
546	0.41
547	0.49
548	0.53
549	0.62
550	0.68
551	0.68
552	0.71
553	0.75
554	0.76
555	0.75
556	0.72
557	0.66
558	0.58
559	0.55
560	0.5
561	0.42
562	0.39
563	0.31
564	0.29
565	0.26
566	0.25
567	0.21
568	0.21
569	0.2
570	0.16
571	0.16
572	0.14
573	0.2
574	0.22
575	0.25
576	0.22
577	0.28
578	0.33
579	0.4
580	0.44
581	0.42
582	0.44
583	0.46
584	0.49
585	0.48
586	0.52
587	0.44
588	0.42
589	0.44
590	0.47
591	0.44
592	0.43
593	0.4
594	0.33
595	0.34
596	0.32
597	0.24
598	0.16
599	0.17
600	0.17
601	0.2
602	0.2
603	0.22
604	0.26
605	0.32
606	0.38
607	0.42
608	0.48
609	0.51
610	0.58
611	0.62
612	0.65
613	0.67
614	0.7
615	0.71
616	0.72
617	0.67
618	0.63
619	0.59
620	0.59
621	0.57
622	0.53
623	0.46
624	0.41
625	0.39
626	0.35
627	0.33
628	0.28
629	0.22
630	0.21
631	0.22
632	0.23
633	0.22
634	0.2
635	0.19
636	0.19
637	0.23
638	0.2
639	0.2
640	0.19
641	0.21
642	0.27
643	0.28
644	0.3
645	0.27
646	0.29
647	0.33
648	0.39
649	0.43
650	0.43

A0A5N6F3E7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer