Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A179V4I7

Protein Details
Accession A0A179V4I7    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-303QHPHPHPHPHQQHPHQHHRPPPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.5, cyto 8, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034158  SF3B4_RRM1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG bgh:BDBG_09421  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12334  RRM1_SF3B4  
Amino Acid Sequences MAGVRHWEQDKEATVYIGNLDERVTDSLVWELMLQAGRIVNVHLPKDRVTQTHQGYGFVEFISEEDAEYAARIMNQVRLYGKPIRVNKASADKQKTVEVGAELFVGNLDPMVTEQVLYDTFSRFGSLISAPKIARDDANLSKGYGFVSFSNFEASDDAIANMNGQYLMNKEISVQYAYKKDGKGERHGDQAERMLAAQARKHNVQPQAQPLPPQLVGGGAGAHQGAQPPLVDGEGPGAVGAGRGMNPIAAAGGPPDFGGGRGLPIVNGAGGFHHNQHMPPAQHPHPHPHPHQQHPHQHHRPPPHVHHPPPALSAPPPGLPARPPPSQAGYGGPPPQGFVPPPRFGQQPPPAGFGPPPSAAGPPGAAPPPLPPGFQQPGYGRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.23
4 0.2
5 0.16
6 0.12
7 0.12
8 0.11
9 0.13
10 0.15
11 0.15
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.1
18 0.09
19 0.1
20 0.11
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.12
27 0.14
28 0.17
29 0.21
30 0.24
31 0.25
32 0.28
33 0.34
34 0.37
35 0.36
36 0.38
37 0.44
38 0.45
39 0.5
40 0.48
41 0.43
42 0.4
43 0.38
44 0.32
45 0.23
46 0.19
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.1
51 0.08
52 0.07
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.08
61 0.13
62 0.14
63 0.16
64 0.18
65 0.19
66 0.24
67 0.29
68 0.33
69 0.36
70 0.41
71 0.46
72 0.47
73 0.48
74 0.48
75 0.51
76 0.54
77 0.56
78 0.57
79 0.53
80 0.52
81 0.53
82 0.48
83 0.39
84 0.32
85 0.24
86 0.17
87 0.14
88 0.13
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.06
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.03
97 0.03
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.13
115 0.14
116 0.17
117 0.16
118 0.18
119 0.19
120 0.18
121 0.16
122 0.15
123 0.19
124 0.19
125 0.23
126 0.22
127 0.21
128 0.2
129 0.2
130 0.18
131 0.13
132 0.11
133 0.08
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.12
161 0.11
162 0.12
163 0.15
164 0.17
165 0.21
166 0.2
167 0.23
168 0.27
169 0.3
170 0.35
171 0.38
172 0.38
173 0.4
174 0.41
175 0.38
176 0.33
177 0.3
178 0.23
179 0.17
180 0.15
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.13
185 0.14
186 0.17
187 0.18
188 0.2
189 0.25
190 0.29
191 0.33
192 0.34
193 0.37
194 0.4
195 0.39
196 0.39
197 0.34
198 0.32
199 0.27
200 0.23
201 0.16
202 0.1
203 0.1
204 0.08
205 0.07
206 0.04
207 0.05
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.17
264 0.22
265 0.22
266 0.25
267 0.31
268 0.33
269 0.39
270 0.41
271 0.46
272 0.49
273 0.55
274 0.56
275 0.59
276 0.64
277 0.67
278 0.75
279 0.75
280 0.77
281 0.78
282 0.84
283 0.83
284 0.81
285 0.79
286 0.78
287 0.77
288 0.76
289 0.75
290 0.75
291 0.75
292 0.73
293 0.74
294 0.7
295 0.63
296 0.58
297 0.52
298 0.43
299 0.35
300 0.34
301 0.27
302 0.23
303 0.24
304 0.21
305 0.21
306 0.21
307 0.29
308 0.31
309 0.32
310 0.34
311 0.35
312 0.38
313 0.39
314 0.38
315 0.33
316 0.31
317 0.33
318 0.34
319 0.32
320 0.27
321 0.26
322 0.26
323 0.25
324 0.23
325 0.27
326 0.31
327 0.33
328 0.36
329 0.38
330 0.4
331 0.4
332 0.48
333 0.48
334 0.5
335 0.49
336 0.51
337 0.48
338 0.47
339 0.45
340 0.39
341 0.36
342 0.27
343 0.27
344 0.23
345 0.24
346 0.22
347 0.23
348 0.19
349 0.15
350 0.18
351 0.17
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.24
356 0.25
357 0.25
358 0.23
359 0.3
360 0.36
361 0.37
362 0.41
363 0.35