Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6EII6

Protein Details
Accession A0A5N6EII6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
276-302NIDFRRNPTTPRKRRRRTIPNLKGGPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-293PRKRRRRT
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MKRYRDSQQTSPPHTQPTIEDNSVPKLSSLDAPVSPPRKRSTTKATHLNCTSSNLNCSEQETEAAFNKEHHNLAAIEAGQVEVTDHLSIFSLRLGQSVRPAVSQTPRLQIPDWVSLYQRNQSPEGRHFVIHQHDHPIAGPHYDLRLQFSDSSSVSWSIMYGLPGNPNSRRLNRNATETRVHCLWNHLIEAASPRTGSMIIWDTGEYEILPYQPEQTQPETDDSRSDISSDTSISNVDSKTDSEKLHQAFHNRKIRLRLHGTKLPQNYTIILRLDKNIDFRRNPTTPRKRRRRTIPNLKGGPSTSSSDSSPPPSKSDSTGTSAPGVSDQTPSASETPGREHSDEEDDIDEHIRANNAYPGADNSIGSVHQRRWFVTLDRVNSGFVAEAGSGPGRKRWVRKWDPGTGRLLGFEPFYVRGPEVESSVVTGRLGRDVLEDEGVEGFVPRRGWRAVLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.56
3 0.49
4 0.47
5 0.47
6 0.4
7 0.4
8 0.35
9 0.4
10 0.39
11 0.36
12 0.28
13 0.22
14 0.22
15 0.22
16 0.22
17 0.2
18 0.2
19 0.24
20 0.32
21 0.38
22 0.4
23 0.42
24 0.44
25 0.48
26 0.52
27 0.56
28 0.59
29 0.62
30 0.68
31 0.73
32 0.72
33 0.73
34 0.72
35 0.68
36 0.59
37 0.53
38 0.48
39 0.4
40 0.39
41 0.33
42 0.32
43 0.29
44 0.3
45 0.28
46 0.25
47 0.24
48 0.22
49 0.22
50 0.23
51 0.24
52 0.22
53 0.21
54 0.25
55 0.26
56 0.26
57 0.23
58 0.22
59 0.2
60 0.2
61 0.21
62 0.17
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.09
79 0.09
80 0.11
81 0.13
82 0.13
83 0.18
84 0.22
85 0.22
86 0.2
87 0.22
88 0.24
89 0.27
90 0.33
91 0.31
92 0.33
93 0.34
94 0.35
95 0.34
96 0.35
97 0.34
98 0.34
99 0.33
100 0.29
101 0.29
102 0.31
103 0.33
104 0.33
105 0.32
106 0.28
107 0.3
108 0.33
109 0.37
110 0.38
111 0.42
112 0.38
113 0.35
114 0.34
115 0.36
116 0.39
117 0.37
118 0.34
119 0.33
120 0.31
121 0.31
122 0.3
123 0.28
124 0.21
125 0.18
126 0.17
127 0.12
128 0.13
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.2
137 0.17
138 0.18
139 0.15
140 0.15
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.12
150 0.14
151 0.17
152 0.17
153 0.23
154 0.27
155 0.31
156 0.34
157 0.36
158 0.44
159 0.44
160 0.51
161 0.49
162 0.49
163 0.5
164 0.47
165 0.46
166 0.38
167 0.36
168 0.27
169 0.27
170 0.25
171 0.2
172 0.2
173 0.16
174 0.14
175 0.14
176 0.17
177 0.14
178 0.11
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.07
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.07
199 0.08
200 0.1
201 0.12
202 0.14
203 0.15
204 0.16
205 0.19
206 0.19
207 0.18
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.14
212 0.13
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.12
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.21
231 0.21
232 0.25
233 0.26
234 0.31
235 0.34
236 0.43
237 0.5
238 0.46
239 0.47
240 0.51
241 0.53
242 0.53
243 0.55
244 0.53
245 0.52
246 0.55
247 0.56
248 0.55
249 0.55
250 0.49
251 0.42
252 0.35
253 0.3
254 0.26
255 0.26
256 0.21
257 0.19
258 0.17
259 0.17
260 0.19
261 0.19
262 0.24
263 0.27
264 0.31
265 0.31
266 0.33
267 0.4
268 0.4
269 0.45
270 0.49
271 0.55
272 0.6
273 0.69
274 0.77
275 0.79
276 0.86
277 0.9
278 0.9
279 0.9
280 0.91
281 0.9
282 0.89
283 0.85
284 0.77
285 0.69
286 0.58
287 0.49
288 0.41
289 0.34
290 0.25
291 0.22
292 0.21
293 0.22
294 0.22
295 0.26
296 0.29
297 0.27
298 0.27
299 0.29
300 0.3
301 0.3
302 0.33
303 0.3
304 0.29
305 0.3
306 0.28
307 0.26
308 0.25
309 0.22
310 0.18
311 0.17
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.14
322 0.19
323 0.23
324 0.27
325 0.25
326 0.25
327 0.27
328 0.31
329 0.29
330 0.26
331 0.22
332 0.18
333 0.18
334 0.18
335 0.15
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.09
340 0.1
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.17
347 0.17
348 0.15
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.16
353 0.18
354 0.19
355 0.23
356 0.25
357 0.26
358 0.28
359 0.31
360 0.32
361 0.38
362 0.4
363 0.38
364 0.41
365 0.4
366 0.38
367 0.34
368 0.31
369 0.21
370 0.14
371 0.12
372 0.08
373 0.07
374 0.08
375 0.1
376 0.11
377 0.12
378 0.15
379 0.21
380 0.27
381 0.35
382 0.43
383 0.52
384 0.6
385 0.7
386 0.74
387 0.78
388 0.8
389 0.77
390 0.73
391 0.65
392 0.56
393 0.47
394 0.4
395 0.31
396 0.24
397 0.2
398 0.17
399 0.15
400 0.16
401 0.17
402 0.16
403 0.16
404 0.19
405 0.19
406 0.18
407 0.18
408 0.16
409 0.16
410 0.17
411 0.17
412 0.14
413 0.15
414 0.14
415 0.16
416 0.16
417 0.14
418 0.14
419 0.16
420 0.18
421 0.18
422 0.17
423 0.15
424 0.15
425 0.14
426 0.12
427 0.1
428 0.09
429 0.11
430 0.13
431 0.14
432 0.18
433 0.19