Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6EHB8

Protein Details
Accession A0A5N6EHB8    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-81LPAAVPSPEKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKHESSQLTDETAAHDIEKKKKSKKSKDKAKSKQAGTEGHydrophilic
384-416PEPETPSKTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-45EKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKH
61-75KKKKSKKSKDKAKSK
391-416KTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.166, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MAVDAMEIDSERLPAAVPSPEKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKHESSQLTDETAAHDIEKKKKSKKSKDKAKSKQAGTEGAVIPDSPYVLTTATLYLPLSPISISPTHAKASLLAEHLSPLLLTYYAPLQGIVLAYSDASISSTPPSPSTSSDPADPNPKPLTLAKTAGEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPSNWKWVPPGEEGSVSGDQQKTATASEDDESEPSASFDQEKEHFNPISLANPVSDTLNEEANAEDDESAAEGYFQSVSGHRVRGTVRFRVVDVDVIPGSERDRSFLSIEGTMLSPEEEARVLEDERNGILTTSATPRRGLSQEPRVSMSGALAAPSVAAIPEPETPSKTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.11
3 0.16
4 0.18
5 0.2
6 0.3
7 0.39
8 0.47
9 0.57
10 0.65
11 0.7
12 0.79
13 0.87
14 0.89
15 0.91
16 0.94
17 0.94
18 0.94
19 0.91
20 0.88
21 0.85
22 0.84
23 0.8
24 0.79
25 0.78
26 0.78
27 0.78
28 0.8
29 0.84
30 0.85
31 0.87
32 0.89
33 0.91
34 0.89
35 0.9
36 0.83
37 0.73
38 0.64
39 0.53
40 0.44
41 0.35
42 0.26
43 0.17
44 0.2
45 0.24
46 0.32
47 0.4
48 0.46
49 0.53
50 0.62
51 0.73
52 0.78
53 0.83
54 0.85
55 0.89
56 0.91
57 0.94
58 0.95
59 0.95
60 0.93
61 0.86
62 0.82
63 0.75
64 0.69
65 0.6
66 0.56
67 0.46
68 0.37
69 0.33
70 0.25
71 0.21
72 0.16
73 0.14
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.1
91 0.11
92 0.13
93 0.15
94 0.17
95 0.18
96 0.19
97 0.19
98 0.17
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.17
103 0.16
104 0.16
105 0.15
106 0.13
107 0.1
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.07
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.13
135 0.14
136 0.17
137 0.22
138 0.25
139 0.24
140 0.27
141 0.28
142 0.27
143 0.34
144 0.31
145 0.31
146 0.28
147 0.26
148 0.25
149 0.26
150 0.28
151 0.24
152 0.26
153 0.22
154 0.22
155 0.22
156 0.2
157 0.17
158 0.12
159 0.09
160 0.07
161 0.06
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.15
175 0.16
176 0.19
177 0.19
178 0.21
179 0.15
180 0.21
181 0.21
182 0.19
183 0.18
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.12
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.03
203 0.04
204 0.05
205 0.08
206 0.09
207 0.12
208 0.15
209 0.17
210 0.24
211 0.28
212 0.38
213 0.43
214 0.46
215 0.46
216 0.45
217 0.47
218 0.42
219 0.39
220 0.3
221 0.23
222 0.19
223 0.2
224 0.19
225 0.16
226 0.16
227 0.14
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.11
249 0.13
250 0.16
251 0.18
252 0.23
253 0.22
254 0.22
255 0.23
256 0.21
257 0.21
258 0.18
259 0.16
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.1
288 0.13
289 0.15
290 0.15
291 0.18
292 0.19
293 0.27
294 0.31
295 0.34
296 0.35
297 0.35
298 0.35
299 0.35
300 0.34
301 0.29
302 0.24
303 0.21
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.13
308 0.13
309 0.15
310 0.14
311 0.13
312 0.15
313 0.17
314 0.18
315 0.2
316 0.22
317 0.18
318 0.18
319 0.17
320 0.15
321 0.13
322 0.12
323 0.1
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.1
331 0.11
332 0.13
333 0.14
334 0.15
335 0.15
336 0.16
337 0.15
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.12
342 0.18
343 0.23
344 0.23
345 0.24
346 0.25
347 0.3
348 0.32
349 0.36
350 0.37
351 0.43
352 0.48
353 0.5
354 0.52
355 0.48
356 0.46
357 0.39
358 0.31
359 0.24
360 0.18
361 0.16
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.07
371 0.11
372 0.15
373 0.17
374 0.21
375 0.23
376 0.3
377 0.39
378 0.45
379 0.48
380 0.54
381 0.61
382 0.68
383 0.77
384 0.82
385 0.82
386 0.85
387 0.89
388 0.89
389 0.9
390 0.9
391 0.9
392 0.91
393 0.92
394 0.92
395 0.93
396 0.94