Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6EFR3

Protein Details
Accession A0A5N6EFR3    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAPDKKDKKRKAAAATAAADHydrophilic
36-55STNASPKPILKKNKGNDAEKHydrophilic
93-114KTKVETEKKLSNKKTKKADGTAHydrophilic
195-221VPKIPDSKKAKRKILKKQKENKQEAEEBasic
309-336WKGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKAKTREBasic
406-433KKVADDTPKKAKKDKKKGAQSNDQGTPKBasic
445-465ASPATKAGAKAKKAKKTKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-75KKDKKRKAAAATAAADSPAKKTKKVEAKPTESTNASPKPILKKNKGNDAEKPAAKLKVNGEPTRQVKPRKR
100-128KKLSNKKTKKADGTAAPAPKEKTTKAKAS
200-214DSKKAKRKILKKQKE
311-355GANRRFKRTPWNRIEKKRLDKAKTREQWSERIDREQKRRLAKAEK
413-465PKKAKKDKKKGAQSNDQGTPKEQPKKEIPAATASPATKAGAKAKKAKKTKAKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDKKRKAAAATAAADSPAKKTKKVEAKPTESTNASPKPILKKNKGNDAEKPAAKLKVNGEPTRQVKPRKRAADFLSDNDDSESENAPKTKVETEKKLSNKKTKKADGTAAPAPKEKTTKAKASTEAKKPEPVAEESDDGEMDDEESVASGASASEDEEEDDRTAALIRGFESSGDEDESGDEGFNPDQPVPKIPDSKKAKRKILKKQKENKQEAEEPGTVYVGRIPHGFYEHQMKAYFSQFGEISRLRLSRNRITGRSKHYAFIEFTSTSVAKVVAGTMDNYLMYGHILKCKYVPQEQLHPELWKGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKAKTREQWSERIDREQKRRLAKAEKLKALGYELELPQLKSVDEVPIQQEESKTIEASETVFDEPVKAIEEPKEEEKKVADDTPKKAKKDKKKGAQSNDQGTPKEQPKKEIPAATASPATKAGAKAKKAKKTKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.74
3 0.66
4 0.56
5 0.47
6 0.39
7 0.3
8 0.27
9 0.27
10 0.26
11 0.28
12 0.32
13 0.42
14 0.51
15 0.59
16 0.65
17 0.67
18 0.73
19 0.76
20 0.77
21 0.73
22 0.65
23 0.59
24 0.57
25 0.51
26 0.46
27 0.42
28 0.42
29 0.46
30 0.53
31 0.6
32 0.61
33 0.65
34 0.7
35 0.78
36 0.81
37 0.77
38 0.76
39 0.75
40 0.74
41 0.66
42 0.63
43 0.57
44 0.54
45 0.5
46 0.47
47 0.42
48 0.42
49 0.49
50 0.48
51 0.48
52 0.52
53 0.54
54 0.58
55 0.61
56 0.62
57 0.64
58 0.69
59 0.74
60 0.75
61 0.76
62 0.75
63 0.73
64 0.73
65 0.67
66 0.61
67 0.59
68 0.49
69 0.45
70 0.38
71 0.32
72 0.22
73 0.21
74 0.2
75 0.14
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.19
81 0.24
82 0.3
83 0.36
84 0.42
85 0.48
86 0.56
87 0.64
88 0.71
89 0.74
90 0.76
91 0.78
92 0.78
93 0.81
94 0.82
95 0.81
96 0.77
97 0.75
98 0.7
99 0.67
100 0.66
101 0.6
102 0.52
103 0.48
104 0.43
105 0.39
106 0.37
107 0.33
108 0.36
109 0.38
110 0.44
111 0.46
112 0.49
113 0.53
114 0.58
115 0.64
116 0.64
117 0.65
118 0.59
119 0.58
120 0.54
121 0.51
122 0.46
123 0.4
124 0.35
125 0.3
126 0.29
127 0.25
128 0.25
129 0.21
130 0.17
131 0.14
132 0.1
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.11
180 0.11
181 0.14
182 0.18
183 0.21
184 0.28
185 0.28
186 0.38
187 0.44
188 0.53
189 0.6
190 0.64
191 0.7
192 0.69
193 0.78
194 0.79
195 0.82
196 0.83
197 0.84
198 0.86
199 0.86
200 0.9
201 0.87
202 0.81
203 0.75
204 0.7
205 0.62
206 0.57
207 0.47
208 0.37
209 0.3
210 0.25
211 0.18
212 0.13
213 0.12
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.17
223 0.17
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.18
228 0.2
229 0.2
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.2
241 0.25
242 0.27
243 0.35
244 0.38
245 0.41
246 0.47
247 0.52
248 0.55
249 0.57
250 0.52
251 0.47
252 0.44
253 0.42
254 0.36
255 0.31
256 0.28
257 0.2
258 0.19
259 0.19
260 0.17
261 0.14
262 0.13
263 0.11
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.07
278 0.07
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.18
284 0.22
285 0.25
286 0.32
287 0.31
288 0.4
289 0.43
290 0.47
291 0.44
292 0.41
293 0.36
294 0.33
295 0.31
296 0.26
297 0.28
298 0.3
299 0.38
300 0.4
301 0.49
302 0.5
303 0.54
304 0.61
305 0.67
306 0.7
307 0.71
308 0.79
309 0.8
310 0.85
311 0.89
312 0.87
313 0.87
314 0.85
315 0.84
316 0.8
317 0.8
318 0.79
319 0.79
320 0.78
321 0.74
322 0.74
323 0.68
324 0.69
325 0.66
326 0.66
327 0.58
328 0.59
329 0.62
330 0.61
331 0.67
332 0.67
333 0.68
334 0.67
335 0.7
336 0.68
337 0.68
338 0.68
339 0.7
340 0.71
341 0.69
342 0.63
343 0.59
344 0.52
345 0.45
346 0.37
347 0.29
348 0.24
349 0.19
350 0.22
351 0.23
352 0.22
353 0.21
354 0.2
355 0.18
356 0.14
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.15
361 0.17
362 0.18
363 0.2
364 0.21
365 0.2
366 0.18
367 0.2
368 0.19
369 0.17
370 0.15
371 0.14
372 0.13
373 0.14
374 0.13
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.11
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.13
383 0.11
384 0.13
385 0.16
386 0.2
387 0.23
388 0.31
389 0.38
390 0.36
391 0.37
392 0.37
393 0.36
394 0.37
395 0.39
396 0.4
397 0.4
398 0.46
399 0.56
400 0.61
401 0.62
402 0.67
403 0.71
404 0.73
405 0.77
406 0.81
407 0.81
408 0.85
409 0.91
410 0.92
411 0.92
412 0.9
413 0.87
414 0.85
415 0.79
416 0.69
417 0.62
418 0.61
419 0.59
420 0.6
421 0.54
422 0.53
423 0.56
424 0.63
425 0.68
426 0.65
427 0.58
428 0.56
429 0.56
430 0.53
431 0.5
432 0.41
433 0.35
434 0.31
435 0.3
436 0.25
437 0.26
438 0.32
439 0.35
440 0.41
441 0.5
442 0.58
443 0.67
444 0.73
445 0.8