Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5X4X0

Protein Details
Accession A0A5N5X4X0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-172FSLAKYMLRKRRKYMKRFTVLPHydrophilic
367-390AMKSNKRGAYHRKRNRWARVQSVVHydrophilic
534-557IQAAGNPSRKKRKVVEQQTPTTAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 12, cyto 5.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSYVRPHQFVLLRLPSEFTKIQKIEPDSIIFLGKFGSFPANQIIGRPFYLTFEILDDADEKDGSCLRVIPAAELHAETLIAEGEGDGDEPDVNEDGTPMRTNREIVDDVSTQKLTWQEIEELKKEAGGAGREIISKLLESHQALDQKTTFSLAKYMLRKRRKYMKRFTVLPMDVSMLTNHLMESGDAARIMELRDENIGLLGCWGNVHHGGNASLDEAIAAKPNGRYLVVDDTGGLVVAAMAERMGILYPHDGEDYEEQGSSDEPEKAGTENAEHNEHKPTEYFARRPARPGHMTASGNSITYLHPNKQPNLSLLKYFGYNQDNPDESHPLHTHLKTVSWLQLMDPNADPIYANEPEVLPDSELYAMKSNKRGAYHRKRNRWARVQSVVNEARAGEFDGLIVATLMDATSILKYAVPLLAGSAHVSVYSPSIEPLTELMDLYSTPRKTAFINRRQQLKEQNDTEEGLQASELKGLLDEFQVDPTLLLAPTLQNSRVRPWQVLPGRSHPMMSMRGGAEGYIFHAVRVIPTQQTIQAAGNPSRKKRKVVEQQTPTTAVDSGSGVDVEMQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.35
4 0.37
5 0.36
6 0.31
7 0.33
8 0.33
9 0.36
10 0.41
11 0.45
12 0.45
13 0.46
14 0.45
15 0.37
16 0.37
17 0.36
18 0.28
19 0.23
20 0.19
21 0.16
22 0.13
23 0.12
24 0.16
25 0.13
26 0.15
27 0.2
28 0.23
29 0.22
30 0.26
31 0.28
32 0.26
33 0.26
34 0.26
35 0.22
36 0.2
37 0.23
38 0.2
39 0.17
40 0.16
41 0.17
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.12
46 0.13
47 0.12
48 0.1
49 0.11
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.16
62 0.16
63 0.12
64 0.11
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.1
85 0.13
86 0.12
87 0.15
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.23
92 0.22
93 0.21
94 0.25
95 0.24
96 0.24
97 0.27
98 0.26
99 0.2
100 0.21
101 0.21
102 0.18
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.26
107 0.31
108 0.3
109 0.31
110 0.29
111 0.27
112 0.25
113 0.21
114 0.19
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.15
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.14
127 0.14
128 0.16
129 0.2
130 0.24
131 0.24
132 0.26
133 0.24
134 0.21
135 0.21
136 0.21
137 0.18
138 0.14
139 0.16
140 0.16
141 0.22
142 0.28
143 0.37
144 0.44
145 0.53
146 0.58
147 0.64
148 0.72
149 0.76
150 0.79
151 0.81
152 0.82
153 0.8
154 0.79
155 0.76
156 0.75
157 0.65
158 0.56
159 0.46
160 0.37
161 0.29
162 0.25
163 0.2
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.06
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.08
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.15
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.09
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.03
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.1
260 0.12
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.2
265 0.2
266 0.19
267 0.16
268 0.17
269 0.2
270 0.24
271 0.24
272 0.29
273 0.36
274 0.36
275 0.39
276 0.42
277 0.42
278 0.4
279 0.41
280 0.36
281 0.35
282 0.35
283 0.31
284 0.3
285 0.24
286 0.21
287 0.19
288 0.16
289 0.1
290 0.14
291 0.16
292 0.15
293 0.21
294 0.24
295 0.26
296 0.28
297 0.29
298 0.27
299 0.3
300 0.29
301 0.24
302 0.22
303 0.21
304 0.19
305 0.19
306 0.21
307 0.19
308 0.2
309 0.2
310 0.22
311 0.22
312 0.23
313 0.24
314 0.22
315 0.18
316 0.22
317 0.2
318 0.21
319 0.25
320 0.24
321 0.24
322 0.22
323 0.22
324 0.19
325 0.2
326 0.19
327 0.15
328 0.15
329 0.13
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.16
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.09
339 0.13
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.13
346 0.13
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.11
353 0.14
354 0.15
355 0.17
356 0.22
357 0.25
358 0.27
359 0.3
360 0.36
361 0.43
362 0.52
363 0.61
364 0.67
365 0.73
366 0.8
367 0.86
368 0.89
369 0.88
370 0.84
371 0.8
372 0.78
373 0.72
374 0.65
375 0.64
376 0.56
377 0.46
378 0.4
379 0.32
380 0.24
381 0.2
382 0.19
383 0.1
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.02
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.11
430 0.17
431 0.15
432 0.16
433 0.17
434 0.18
435 0.21
436 0.31
437 0.39
438 0.42
439 0.52
440 0.57
441 0.66
442 0.68
443 0.72
444 0.72
445 0.69
446 0.68
447 0.61
448 0.6
449 0.53
450 0.51
451 0.45
452 0.38
453 0.3
454 0.21
455 0.17
456 0.13
457 0.12
458 0.12
459 0.11
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.1
466 0.09
467 0.1
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.11
478 0.14
479 0.17
480 0.2
481 0.22
482 0.28
483 0.35
484 0.38
485 0.38
486 0.38
487 0.45
488 0.48
489 0.53
490 0.53
491 0.52
492 0.55
493 0.52
494 0.5
495 0.41
496 0.39
497 0.35
498 0.32
499 0.29
500 0.23
501 0.24
502 0.23
503 0.21
504 0.17
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.14
509 0.12
510 0.15
511 0.15
512 0.16
513 0.19
514 0.2
515 0.16
516 0.18
517 0.2
518 0.21
519 0.23
520 0.24
521 0.22
522 0.23
523 0.27
524 0.32
525 0.38
526 0.43
527 0.5
528 0.59
529 0.63
530 0.67
531 0.69
532 0.73
533 0.76
534 0.8
535 0.82
536 0.81
537 0.83
538 0.81
539 0.76
540 0.66
541 0.56
542 0.45
543 0.35
544 0.26
545 0.19
546 0.15
547 0.12
548 0.11
549 0.09