Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5XIM0

Protein Details
Accession A0A5N5XIM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-58CDRCRAQKLRCVPSKEPRACVFSKRLRTGRQKKTADKGQSPRKTKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-47GRQKKTA
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MDNDNLMGLRTSCDRCRAQKLRCVPSKEPRACVFSKRLRTGRQKKTADKGQSPRKTKATFAQTLPGMSTFTLSTSVSRESSVVADTDTPGSSGTPRPRMQVQETETAASVGSTQDELVFASSLSSYPEELCTDMEMGLGAFLGVGNLLPTPPDTMNTDSLPEFTLVETADRPGGPLADLASMLPIMSRYERQLQEYGGELDNYPIGDALFLAQRFHAVLSGQCHCLPSTHPRVQMDMPTKLLTLSCYMILTRIYSFIFGYMHQYLGKLPHTHALHDHSGPTGLGLGHFMEGVHAYRGLRLGQLQQTCICVGCKAATRTKKAVSMLLDSLGSVEGALGLPPDVRVIDETSTEGCMTPNRNRRDRTLLLDEGLMAGLTHGRLHKTVREQVRELRATIEEVEDLLKYFMT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.43
3 0.54
4 0.61
5 0.63
6 0.67
7 0.73
8 0.77
9 0.78
10 0.8
11 0.77
12 0.78
13 0.82
14 0.79
15 0.76
16 0.7
17 0.68
18 0.63
19 0.62
20 0.62
21 0.6
22 0.64
23 0.66
24 0.69
25 0.72
26 0.8
27 0.84
28 0.85
29 0.86
30 0.85
31 0.84
32 0.87
33 0.86
34 0.84
35 0.83
36 0.83
37 0.83
38 0.84
39 0.82
40 0.8
41 0.79
42 0.72
43 0.66
44 0.65
45 0.63
46 0.6
47 0.55
48 0.55
49 0.47
50 0.45
51 0.42
52 0.34
53 0.25
54 0.18
55 0.17
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.13
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.12
74 0.11
75 0.1
76 0.09
77 0.1
78 0.11
79 0.17
80 0.23
81 0.29
82 0.3
83 0.34
84 0.38
85 0.43
86 0.46
87 0.48
88 0.45
89 0.44
90 0.44
91 0.41
92 0.36
93 0.31
94 0.26
95 0.17
96 0.13
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.03
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.06
138 0.07
139 0.08
140 0.11
141 0.14
142 0.16
143 0.16
144 0.18
145 0.15
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.1
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.07
175 0.09
176 0.16
177 0.17
178 0.2
179 0.21
180 0.2
181 0.2
182 0.2
183 0.2
184 0.14
185 0.13
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.04
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.05
205 0.07
206 0.1
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.19
215 0.26
216 0.3
217 0.33
218 0.33
219 0.36
220 0.36
221 0.4
222 0.38
223 0.31
224 0.28
225 0.25
226 0.24
227 0.21
228 0.2
229 0.14
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.15
253 0.18
254 0.15
255 0.15
256 0.21
257 0.22
258 0.22
259 0.24
260 0.26
261 0.26
262 0.26
263 0.25
264 0.19
265 0.19
266 0.18
267 0.15
268 0.11
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.16
288 0.21
289 0.22
290 0.23
291 0.23
292 0.24
293 0.23
294 0.22
295 0.18
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.18
300 0.21
301 0.29
302 0.35
303 0.41
304 0.46
305 0.49
306 0.51
307 0.47
308 0.47
309 0.42
310 0.39
311 0.34
312 0.3
313 0.26
314 0.21
315 0.2
316 0.15
317 0.11
318 0.07
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.08
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.13
339 0.12
340 0.15
341 0.2
342 0.28
343 0.36
344 0.44
345 0.52
346 0.55
347 0.61
348 0.66
349 0.66
350 0.64
351 0.63
352 0.57
353 0.5
354 0.47
355 0.4
356 0.32
357 0.26
358 0.18
359 0.09
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.09
364 0.11
365 0.13
366 0.15
367 0.19
368 0.26
369 0.33
370 0.42
371 0.49
372 0.54
373 0.57
374 0.63
375 0.7
376 0.65
377 0.58
378 0.52
379 0.44
380 0.39
381 0.36
382 0.29
383 0.19
384 0.17
385 0.17
386 0.14
387 0.14