Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5WYP8

Protein Details
Accession A0A5N5WYP8    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-110GAKSEVGEKKKRKRAPPDPNAPKRALBasic
225-303KEPTPPRAGKRRRSEAKTAKEAVSPVENKKASPEKKRTRTPAAKEKKAQEETPASTRKTPAAEGKRTRKKRKSEVNNDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-107VGEKKKRKRAPPDPNAPK
228-296TPPRAGKRRRSEAKTAKEAVSPVENKKASPEKKRTRTPAAKEKKAQEETPASTRKTPAAEGKRTRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSRKDDTVTVNVDEFTRTRDSVIISLAQLQSAVSELSKAYINHANTVLNRGPTTDFGHIASITSSLYESGLLGGLVAGARATSPGAKSEVGEKKKRKRAPPDPNAPKRALTPFFLFMQHNRSKIAEELGSTAKPKDVSDEGTRRWADMAEPEKEHWKNMYADNLAVYKEKMKAYKAGLPFTDDAKAASQLQQEADRAKATVAVESDEEEEEEEEEEEEESPEPVKEPTPPRAGKRRRSEAKTAKEAVSPVENKKASPEKKRTRTPAAKEKKAQEETPASTRKTPAAEGKRTRKKRKSEVNNDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.21
4 0.19
5 0.19
6 0.2
7 0.22
8 0.22
9 0.24
10 0.21
11 0.18
12 0.23
13 0.22
14 0.19
15 0.17
16 0.15
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.08
24 0.12
25 0.11
26 0.15
27 0.21
28 0.22
29 0.24
30 0.26
31 0.28
32 0.25
33 0.31
34 0.3
35 0.26
36 0.25
37 0.23
38 0.24
39 0.23
40 0.27
41 0.23
42 0.22
43 0.2
44 0.22
45 0.2
46 0.19
47 0.16
48 0.12
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.06
58 0.05
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.03
64 0.03
65 0.03
66 0.03
67 0.03
68 0.04
69 0.05
70 0.06
71 0.08
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.2
76 0.28
77 0.34
78 0.43
79 0.5
80 0.58
81 0.67
82 0.75
83 0.75
84 0.77
85 0.81
86 0.84
87 0.85
88 0.87
89 0.88
90 0.89
91 0.85
92 0.76
93 0.66
94 0.58
95 0.54
96 0.44
97 0.37
98 0.31
99 0.28
100 0.27
101 0.29
102 0.26
103 0.21
104 0.28
105 0.28
106 0.26
107 0.25
108 0.24
109 0.23
110 0.23
111 0.23
112 0.15
113 0.12
114 0.14
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.12
124 0.16
125 0.22
126 0.26
127 0.26
128 0.32
129 0.32
130 0.28
131 0.27
132 0.23
133 0.17
134 0.18
135 0.21
136 0.17
137 0.18
138 0.19
139 0.25
140 0.25
141 0.25
142 0.2
143 0.19
144 0.19
145 0.2
146 0.24
147 0.18
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.1
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.2
160 0.22
161 0.28
162 0.29
163 0.28
164 0.27
165 0.28
166 0.28
167 0.25
168 0.23
169 0.17
170 0.15
171 0.13
172 0.14
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.13
183 0.12
184 0.11
185 0.13
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.1
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.15
213 0.2
214 0.26
215 0.35
216 0.39
217 0.46
218 0.56
219 0.64
220 0.68
221 0.73
222 0.77
223 0.78
224 0.8
225 0.84
226 0.83
227 0.83
228 0.82
229 0.76
230 0.66
231 0.59
232 0.53
233 0.45
234 0.42
235 0.37
236 0.32
237 0.37
238 0.36
239 0.33
240 0.4
241 0.48
242 0.48
243 0.54
244 0.62
245 0.64
246 0.73
247 0.83
248 0.84
249 0.85
250 0.87
251 0.86
252 0.86
253 0.86
254 0.86
255 0.84
256 0.84
257 0.83
258 0.79
259 0.71
260 0.68
261 0.65
262 0.6
263 0.61
264 0.59
265 0.52
266 0.5
267 0.5
268 0.46
269 0.42
270 0.42
271 0.43
272 0.47
273 0.54
274 0.61
275 0.69
276 0.76
277 0.84
278 0.9
279 0.89
280 0.9
281 0.91
282 0.92
283 0.92