FuNGI

A0A5N5WQR9

Protein Details

Accession

A0A5N5WQR9

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-51	VPPMRIRRPKAADPLVRPKRKPPVKPAIPISGT	Hydrophilic
133-155	ESQFTRPVRLQRRDPRARPHELT	Hydrophilic
521-543	GTDTSRKKGKSKHPSTQPTPQPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-44	RIRRPKAADPLVRPKRKPPVKP
411-434	REKKEKEARRVLGKKVRKALQKRE
528-530	KGK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MATPTNNPKLGTPTGANGVPPMRIRRPKAADPLVRPKRKPPVKPAIPISGTGPALTAATSRPVTSNQLSASQYERSKPTSSATDFSENGFSSSLLSETYADYPLVTTKRALREGLKHHIARFASKKTIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRARPHELTTDKNQGMQKAASDSSHQMDEAEREELEARKEAREKERAENLAQIAPSAGSAPKRANAPKQKTQQVSKTDMTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLESTGKMRMIPVEKWYRFNAKNQFKALTIEEAEKFMAKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTQSGVEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEDAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDERNYEEEELREKKEKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDAESSDDSEAERLKEEEQKPEDEKNKKDTTTSSSKGNSTPSSRPKHTDALKKGTTNAPRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKGKSKHPSTQPTPQPSSRNISPTAPSSIPLGKKRVRNAPPSGAGSGSDADRGVGSGGEMSESGKTKKLKLNPPLVVSQSGTPQGSRAGSPTPFAGRSFSGSRASSPESLRGQAGVSTPGPASNQSFPTPAEIHAAIPPTGILSSDLLKIFRPRIGESKENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGTLKES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.33
3	0.31
4	0.28
5	0.26
6	0.25
7	0.28
8	0.32
9	0.37
10	0.45
11	0.51
12	0.58
13	0.64
14	0.69
15	0.74
16	0.77
17	0.76
18	0.76
19	0.81
20	0.82
21	0.83
22	0.77
23	0.76
24	0.77
25	0.78
26	0.79
27	0.78
28	0.78
29	0.79
30	0.84
31	0.82
32	0.8
33	0.72
34	0.64
35	0.57
36	0.51
37	0.42
38	0.33
39	0.27
40	0.18
41	0.16
42	0.15
43	0.13
44	0.08
45	0.12
46	0.13
47	0.14
48	0.15
49	0.18
50	0.24
51	0.25
52	0.29
53	0.25
54	0.3
55	0.31
56	0.31
57	0.31
58	0.31
59	0.32
60	0.33
61	0.35
62	0.33
63	0.35
64	0.35
65	0.36
66	0.38
67	0.39
68	0.38
69	0.39
70	0.4
71	0.37
72	0.38
73	0.38
74	0.29
75	0.26
76	0.24
77	0.19
78	0.15
79	0.15
80	0.13
81	0.09
82	0.1
83	0.09
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.16
91	0.16
92	0.16
93	0.17
94	0.22
95	0.28
96	0.32
97	0.34
98	0.35
99	0.42
100	0.48
101	0.55
102	0.57
103	0.53
104	0.51
105	0.54
106	0.5
107	0.49
108	0.48
109	0.44
110	0.43
111	0.42
112	0.47
113	0.49
114	0.58
115	0.54
116	0.53
117	0.53
118	0.55
119	0.57
120	0.54
121	0.51
122	0.49
123	0.46
124	0.47
125	0.45
126	0.46
127	0.52
128	0.57
129	0.62
130	0.65
131	0.75
132	0.79
133	0.82
134	0.83
135	0.81
136	0.82
137	0.76
138	0.71
139	0.7
140	0.65
141	0.63
142	0.59
143	0.6
144	0.52
145	0.53
146	0.5
147	0.42
148	0.4
149	0.35
150	0.29
151	0.24
152	0.25
153	0.2
154	0.21
155	0.22
156	0.2
157	0.2
158	0.19
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.15
163	0.14
164	0.12
165	0.12
166	0.14
167	0.15
168	0.16
169	0.19
170	0.18
171	0.21
172	0.26
173	0.31
174	0.36
175	0.42
176	0.45
177	0.48
178	0.54
179	0.53
180	0.5
181	0.48
182	0.43
183	0.38
184	0.33
185	0.26
186	0.18
187	0.15
188	0.13
189	0.1
190	0.1
191	0.08
192	0.11
193	0.12
194	0.14
195	0.2
196	0.24
197	0.33
198	0.42
199	0.49
200	0.56
201	0.63
202	0.69
203	0.7
204	0.72
205	0.7
206	0.66
207	0.64
208	0.57
209	0.52
210	0.47
211	0.41
212	0.37
213	0.32
214	0.26
215	0.24
216	0.24
217	0.23
218	0.23
219	0.23
220	0.22
221	0.21
222	0.22
223	0.19
224	0.2
225	0.24
226	0.25
227	0.28
228	0.27
229	0.26
230	0.25
231	0.24
232	0.21
233	0.18
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.16
242	0.13
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.11
266	0.14
267	0.15
268	0.21
269	0.3
270	0.31
271	0.34
272	0.37
273	0.41
274	0.4
275	0.46
276	0.5
277	0.48
278	0.52
279	0.52
280	0.5
281	0.43
282	0.44
283	0.38
284	0.3
285	0.23
286	0.2
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.14
291	0.13
292	0.13
293	0.16
294	0.14
295	0.2
296	0.29
297	0.38
298	0.44
299	0.49
300	0.5
301	0.54
302	0.56
303	0.52
304	0.53
305	0.46
306	0.41
307	0.43
308	0.46
309	0.41
310	0.41
311	0.43
312	0.35
313	0.33
314	0.35
315	0.31
316	0.26
317	0.27
318	0.34
319	0.37
320	0.43
321	0.42
322	0.4
323	0.41
324	0.45
325	0.42
326	0.44
327	0.41
328	0.38
329	0.4
330	0.4
331	0.37
332	0.31
333	0.29
334	0.19
335	0.13
336	0.1
337	0.07
338	0.05
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.03
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.07
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.11
371	0.14
372	0.17
373	0.24
374	0.31
375	0.32
376	0.4
377	0.46
378	0.51
379	0.52
380	0.49
381	0.44
382	0.4
383	0.38
384	0.32
385	0.26
386	0.19
387	0.19
388	0.19
389	0.19
390	0.17
391	0.18
392	0.18
393	0.18
394	0.17
395	0.2
396	0.21
397	0.23
398	0.27
399	0.26
400	0.3
401	0.36
402	0.42
403	0.45
404	0.52
405	0.54
406	0.59
407	0.63
408	0.65
409	0.67
410	0.67
411	0.64
412	0.63
413	0.64
414	0.63
415	0.66
416	0.69
417	0.71
418	0.73
419	0.73
420	0.75
421	0.73
422	0.69
423	0.63
424	0.59
425	0.51
426	0.43
427	0.4
428	0.32
429	0.28
430	0.26
431	0.23
432	0.17
433	0.15
434	0.13
435	0.12
436	0.1
437	0.11
438	0.1
439	0.11
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.1
444	0.11
445	0.11
446	0.1
447	0.1
448	0.09
449	0.11
450	0.19
451	0.21
452	0.28
453	0.29
454	0.33
455	0.36
456	0.42
457	0.48
458	0.47
459	0.49
460	0.49
461	0.51
462	0.48
463	0.47
464	0.42
465	0.41
466	0.43
467	0.41
468	0.39
469	0.36
470	0.38
471	0.38
472	0.39
473	0.36
474	0.32
475	0.39
476	0.42
477	0.47
478	0.48
479	0.51
480	0.51
481	0.56
482	0.58
483	0.6
484	0.58
485	0.59
486	0.6
487	0.56
488	0.55
489	0.54
490	0.55
491	0.55
492	0.56
493	0.55
494	0.56
495	0.58
496	0.61
497	0.62
498	0.59
499	0.58
500	0.52
501	0.52
502	0.49
503	0.46
504	0.39
505	0.31
506	0.3
507	0.24
508	0.21
509	0.2
510	0.21
511	0.24
512	0.31
513	0.34
514	0.34
515	0.42
516	0.52
517	0.58
518	0.65
519	0.72
520	0.76
521	0.83
522	0.83
523	0.84
524	0.82
525	0.79
526	0.75
527	0.71
528	0.65
529	0.6
530	0.61
531	0.55
532	0.5
533	0.44
534	0.41
535	0.38
536	0.36
537	0.37
538	0.3
539	0.27
540	0.26
541	0.29
542	0.32
543	0.34
544	0.39
545	0.4
546	0.45
547	0.51
548	0.58
549	0.6
550	0.62
551	0.65
552	0.65
553	0.64
554	0.62
555	0.56
556	0.46
557	0.39
558	0.32
559	0.27
560	0.19
561	0.14
562	0.11
563	0.1
564	0.09
565	0.09
566	0.07
567	0.06
568	0.05
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.09
575	0.12
576	0.13
577	0.18
578	0.21
579	0.26
580	0.34
581	0.42
582	0.49
583	0.56
584	0.65
585	0.64
586	0.66
587	0.64
588	0.6
589	0.53
590	0.45
591	0.37
592	0.3
593	0.29
594	0.25
595	0.21
596	0.19
597	0.2
598	0.2
599	0.19
600	0.18
601	0.19
602	0.19
603	0.2
604	0.22
605	0.23
606	0.23
607	0.24
608	0.24
609	0.21
610	0.25
611	0.27
612	0.27
613	0.28
614	0.27
615	0.29
616	0.3
617	0.33
618	0.33
619	0.32
620	0.36
621	0.34
622	0.35
623	0.33
624	0.29
625	0.26
626	0.23
627	0.22
628	0.19
629	0.16
630	0.16
631	0.16
632	0.17
633	0.17
634	0.17
635	0.2
636	0.21
637	0.24
638	0.24
639	0.26
640	0.25
641	0.3
642	0.29
643	0.26
644	0.26
645	0.23
646	0.22
647	0.23
648	0.25
649	0.2
650	0.18
651	0.17
652	0.13
653	0.12
654	0.11
655	0.1
656	0.09
657	0.11
658	0.15
659	0.16
660	0.16
661	0.19
662	0.23
663	0.25
664	0.26
665	0.28
666	0.28
667	0.36
668	0.43
669	0.48
670	0.48
671	0.56
672	0.64
673	0.65
674	0.64
675	0.56
676	0.5
677	0.45
678	0.49
679	0.45
680	0.39
681	0.37
682	0.35
683	0.35
684	0.33
685	0.32
686	0.25
687	0.19
688	0.17
689	0.18
690	0.21
691	0.22
692	0.23
693	0.29
694	0.31
695	0.3
696	0.34

A0A5N5WQR9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer