Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5X209

Protein Details
Accession A0A5N5X209    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-302DKNIDFRKPTTSRKRRRRAVLTPKRGPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
281-298KPTTSRKRRRRAVLTPKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MKRHRDAQQTSPPTAHPSVEHRDIPKLSTLDTPVSPPRKRSSTKLSHLSNKSPAVAPSKQQMKTSLDPEHTTLAAIEAGQVEVTDHLSIVSSRLSQSARPAISHVPRLQIADWVSLYQRNQHLEGRHFVIHQHDHPIAGPHYDLRLQFSDSSSVSWSIMYGLPGDPNSRRLNRNATETRVHCLWNHLIETASQRTGSMIIWDTGEYEILPYRIEQPLPETDDSRSDISSDTSVSAVDEKSDSEKLRQSFQNRKIRLRLHGTRLPPNYTIILRLDKNIDFRKPTTSRKRRRRAVLTPKRGPSTSSDSSPPPSKSDSTGTPAALLSDQTQSAPEALTGEHSDSENNIDEQIRISNAYPGAMNSIGSIHQRRWFVTLDRVNSGFVAEPGSGPGRKRWVRKWDSETGRLLGFGPFYVQGPEVERSVVTGRLGRDVLEDEAVEDFVPRRGWRAVLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.41
3 0.33
4 0.34
5 0.39
6 0.43
7 0.46
8 0.42
9 0.48
10 0.47
11 0.46
12 0.46
13 0.39
14 0.34
15 0.34
16 0.34
17 0.31
18 0.3
19 0.33
20 0.35
21 0.43
22 0.45
23 0.46
24 0.51
25 0.56
26 0.59
27 0.63
28 0.64
29 0.66
30 0.72
31 0.76
32 0.75
33 0.76
34 0.78
35 0.76
36 0.73
37 0.65
38 0.58
39 0.51
40 0.47
41 0.44
42 0.41
43 0.38
44 0.39
45 0.45
46 0.45
47 0.45
48 0.47
49 0.47
50 0.49
51 0.52
52 0.5
53 0.46
54 0.45
55 0.45
56 0.41
57 0.34
58 0.29
59 0.23
60 0.17
61 0.13
62 0.11
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.12
81 0.14
82 0.14
83 0.2
84 0.26
85 0.26
86 0.26
87 0.28
88 0.32
89 0.35
90 0.41
91 0.37
92 0.34
93 0.34
94 0.35
95 0.33
96 0.3
97 0.27
98 0.22
99 0.2
100 0.18
101 0.18
102 0.19
103 0.19
104 0.2
105 0.23
106 0.24
107 0.26
108 0.29
109 0.33
110 0.34
111 0.37
112 0.36
113 0.33
114 0.3
115 0.29
116 0.31
117 0.3
118 0.28
119 0.29
120 0.25
121 0.24
122 0.24
123 0.27
124 0.21
125 0.18
126 0.17
127 0.12
128 0.13
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.2
137 0.17
138 0.18
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.12
152 0.12
153 0.16
154 0.21
155 0.25
156 0.27
157 0.3
158 0.38
159 0.38
160 0.46
161 0.45
162 0.44
163 0.46
164 0.45
165 0.45
166 0.38
167 0.36
168 0.27
169 0.27
170 0.25
171 0.21
172 0.21
173 0.17
174 0.16
175 0.16
176 0.19
177 0.17
178 0.15
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.06
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.11
203 0.14
204 0.18
205 0.18
206 0.16
207 0.16
208 0.18
209 0.2
210 0.18
211 0.14
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.09
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.18
231 0.19
232 0.24
233 0.28
234 0.33
235 0.4
236 0.49
237 0.56
238 0.56
239 0.6
240 0.61
241 0.61
242 0.6
243 0.59
244 0.56
245 0.54
246 0.56
247 0.55
248 0.56
249 0.55
250 0.51
251 0.43
252 0.38
253 0.33
254 0.27
255 0.25
256 0.2
257 0.21
258 0.18
259 0.19
260 0.2
261 0.19
262 0.25
263 0.27
264 0.28
265 0.27
266 0.28
267 0.36
268 0.38
269 0.46
270 0.52
271 0.59
272 0.66
273 0.74
274 0.84
275 0.84
276 0.88
277 0.88
278 0.88
279 0.88
280 0.89
281 0.88
282 0.86
283 0.82
284 0.75
285 0.66
286 0.56
287 0.5
288 0.48
289 0.4
290 0.35
291 0.32
292 0.31
293 0.35
294 0.39
295 0.35
296 0.29
297 0.29
298 0.28
299 0.28
300 0.3
301 0.29
302 0.29
303 0.3
304 0.27
305 0.25
306 0.23
307 0.21
308 0.17
309 0.15
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.1
328 0.13
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.13
335 0.14
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.13
343 0.12
344 0.15
345 0.13
346 0.13
347 0.09
348 0.1
349 0.11
350 0.15
351 0.18
352 0.18
353 0.23
354 0.25
355 0.26
356 0.28
357 0.3
358 0.29
359 0.36
360 0.4
361 0.38
362 0.41
363 0.4
364 0.38
365 0.34
366 0.32
367 0.22
368 0.16
369 0.14
370 0.1
371 0.1
372 0.12
373 0.15
374 0.17
375 0.18
376 0.22
377 0.3
378 0.36
379 0.44
380 0.51
381 0.59
382 0.64
383 0.73
384 0.76
385 0.76
386 0.77
387 0.76
388 0.71
389 0.62
390 0.54
391 0.45
392 0.38
393 0.29
394 0.22
395 0.15
396 0.13
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.13
402 0.16
403 0.18
404 0.17
405 0.17
406 0.16
407 0.17
408 0.18
409 0.19
410 0.17
411 0.19
412 0.19
413 0.23
414 0.24
415 0.22
416 0.22
417 0.22
418 0.22
419 0.2
420 0.18
421 0.15
422 0.15
423 0.15
424 0.12
425 0.11
426 0.1
427 0.12
428 0.16
429 0.15
430 0.19
431 0.21