Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5WME2

Protein Details
Accession A0A5N5WME2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
410-443RRRRQVEERKLANEKRRKEEAQAREERNKKRRRS
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSNKYPKIISSVIEETPYEVNGEQIPVDTTRPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPANEQEMMLEIFAYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAKEADEKKEEFRKSFLKKGGSKEDQAIHEEVIQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRAAPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQESKARTCHLCGQAGHKAEECRGQAKVKNGEFDEKGKGSSLKPFIWLNVSILREYLAVELYVPHQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPVMGGYLTKDGHVDFQKAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQVEERKLANEKRRKEEAQAREERNKKRRRSSPSYETYNESPTSNRTRGGGGGGDAAAPPPGLELITPGRGNLSREARELTHNMVVNRGAVYKANMANKSAAAILKSKLMKGSQDDDEPEETNSTPDMDETPDTTVEQTSPSVLGKRKANEPEGETETPGDDTDSVPKPAKNDEMPPDTVRLWDEGYADRYYEQKFHVDPQDKEFRHKVARAYAEGLAWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIGDMELSFDKGIPFKPFEQLMGVLPASSNHAIPEVFHDLMRNPDSEIIDFYPEDFAVDLNGKKFAWQGVILLPFIDEKRLLAAMEKKYPLLSEDERLRNTVGRDVLMLSDGHPLYQDLVSNFYSKKQGDPKYKLNMHISEGLAGKVERNETYIPHSSLVSSLEEYGMPTLEDDRSLMVNYEIPKSSHIHKSMLLRGVKFNPPALDNADIQATKSKAQHSGRSFGGAPFRNGGGRGGRISYASDRPNDRPNDRPNPFAAHLDPSFMPPGNSGAQMMSSGWVPPVPGSGSYSRGPPPPPRGGMSHPHHRNHYASGQGQQQGHQQTNYGRGDYYGRGQQGHQHQGSYGNQSDQYNGRPSSYGGGQDYRGGGYQRGGYHQGQGRDYSSRNPGGYGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.47
3 0.49
4 0.47
5 0.41
6 0.38
7 0.37
8 0.34
9 0.31
10 0.3
11 0.27
12 0.25
13 0.24
14 0.19
15 0.14
16 0.15
17 0.14
18 0.15
19 0.12
20 0.12
21 0.14
22 0.13
23 0.16
24 0.17
25 0.19
26 0.28
27 0.3
28 0.32
29 0.32
30 0.36
31 0.38
32 0.37
33 0.38
34 0.32
35 0.32
36 0.3
37 0.28
38 0.23
39 0.19
40 0.17
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.28
53 0.36
54 0.44
55 0.5
56 0.5
57 0.54
58 0.57
59 0.6
60 0.52
61 0.46
62 0.39
63 0.34
64 0.31
65 0.22
66 0.16
67 0.12
68 0.11
69 0.09
70 0.08
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.1
75 0.11
76 0.16
77 0.25
78 0.33
79 0.36
80 0.37
81 0.39
82 0.4
83 0.41
84 0.39
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.37
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.79
104 0.81
105 0.77
106 0.73
107 0.75
108 0.74
109 0.68
110 0.68
111 0.61
112 0.56
113 0.61
114 0.56
115 0.47
116 0.45
117 0.42
118 0.39
119 0.46
120 0.48
121 0.41
122 0.45
123 0.52
124 0.51
125 0.59
126 0.58
127 0.59
128 0.61
129 0.67
130 0.71
131 0.68
132 0.64
133 0.62
134 0.6
135 0.54
136 0.51
137 0.45
138 0.35
139 0.32
140 0.35
141 0.29
142 0.25
143 0.23
144 0.19
145 0.18
146 0.18
147 0.19
148 0.16
149 0.17
150 0.2
151 0.22
152 0.22
153 0.21
154 0.22
155 0.19
156 0.17
157 0.15
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.16
173 0.2
174 0.27
175 0.27
176 0.3
177 0.3
178 0.32
179 0.36
180 0.33
181 0.3
182 0.26
183 0.32
184 0.29
185 0.29
186 0.26
187 0.21
188 0.24
189 0.24
190 0.21
191 0.16
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.13
200 0.15
201 0.16
202 0.18
203 0.21
204 0.27
205 0.28
206 0.28
207 0.3
208 0.33
209 0.37
210 0.38
211 0.43
212 0.41
213 0.46
214 0.47
215 0.45
216 0.47
217 0.42
218 0.38
219 0.29
220 0.26
221 0.2
222 0.21
223 0.19
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.06
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.18
242 0.2
243 0.24
244 0.25
245 0.26
246 0.25
247 0.28
248 0.27
249 0.24
250 0.28
251 0.24
252 0.24
253 0.25
254 0.24
255 0.21
256 0.24
257 0.32
258 0.3
259 0.34
260 0.33
261 0.37
262 0.42
263 0.43
264 0.41
265 0.36
266 0.32
267 0.29
268 0.33
269 0.28
270 0.24
271 0.24
272 0.27
273 0.28
274 0.35
275 0.42
276 0.38
277 0.42
278 0.41
279 0.44
280 0.41
281 0.41
282 0.39
283 0.3
284 0.29
285 0.26
286 0.26
287 0.22
288 0.27
289 0.29
290 0.24
291 0.26
292 0.26
293 0.25
294 0.27
295 0.26
296 0.21
297 0.21
298 0.22
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.14
303 0.14
304 0.12
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.08
310 0.13
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.18
317 0.19
318 0.15
319 0.16
320 0.16
321 0.17
322 0.18
323 0.19
324 0.13
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.12
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.15
352 0.1
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.12
375 0.13
376 0.15
377 0.14
378 0.17
379 0.2
380 0.2
381 0.2
382 0.17
383 0.16
384 0.14
385 0.16
386 0.15
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.11
391 0.11
392 0.14
393 0.14
394 0.21
395 0.26
396 0.28
397 0.37
398 0.39
399 0.43
400 0.48
401 0.57
402 0.59
403 0.63
404 0.66
405 0.63
406 0.68
407 0.69
408 0.69
409 0.66
410 0.62
411 0.59
412 0.61
413 0.57
414 0.57
415 0.61
416 0.6
417 0.62
418 0.65
419 0.63
420 0.65
421 0.71
422 0.73
423 0.73
424 0.74
425 0.72
426 0.73
427 0.76
428 0.77
429 0.79
430 0.79
431 0.79
432 0.78
433 0.76
434 0.68
435 0.63
436 0.55
437 0.49
438 0.41
439 0.31
440 0.24
441 0.22
442 0.26
443 0.24
444 0.23
445 0.2
446 0.2
447 0.2
448 0.21
449 0.16
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.05
464 0.06
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.11
469 0.12
470 0.13
471 0.17
472 0.2
473 0.19
474 0.2
475 0.22
476 0.22
477 0.23
478 0.23
479 0.2
480 0.19
481 0.2
482 0.19
483 0.18
484 0.18
485 0.15
486 0.14
487 0.12
488 0.09
489 0.07
490 0.08
491 0.11
492 0.14
493 0.18
494 0.18
495 0.18
496 0.19
497 0.18
498 0.18
499 0.15
500 0.12
501 0.09
502 0.1
503 0.09
504 0.14
505 0.14
506 0.14
507 0.14
508 0.15
509 0.15
510 0.16
511 0.2
512 0.17
513 0.18
514 0.18
515 0.19
516 0.19
517 0.18
518 0.16
519 0.13
520 0.11
521 0.1
522 0.09
523 0.08
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.08
532 0.08
533 0.09
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.1
542 0.12
543 0.17
544 0.2
545 0.22
546 0.28
547 0.31
548 0.34
549 0.32
550 0.32
551 0.33
552 0.35
553 0.33
554 0.27
555 0.23
556 0.21
557 0.18
558 0.16
559 0.11
560 0.06
561 0.06
562 0.11
563 0.12
564 0.14
565 0.15
566 0.16
567 0.17
568 0.19
569 0.22
570 0.19
571 0.22
572 0.26
573 0.28
574 0.3
575 0.3
576 0.3
577 0.26
578 0.25
579 0.2
580 0.16
581 0.12
582 0.11
583 0.11
584 0.11
585 0.13
586 0.13
587 0.13
588 0.12
589 0.14
590 0.14
591 0.15
592 0.14
593 0.14
594 0.15
595 0.19
596 0.27
597 0.31
598 0.31
599 0.35
600 0.44
601 0.42
602 0.46
603 0.44
604 0.4
605 0.38
606 0.4
607 0.37
608 0.34
609 0.36
610 0.33
611 0.33
612 0.3
613 0.25
614 0.22
615 0.19
616 0.12
617 0.09
618 0.07
619 0.04
620 0.03
621 0.03
622 0.04
623 0.05
624 0.05
625 0.06
626 0.07
627 0.07
628 0.12
629 0.16
630 0.15
631 0.19
632 0.2
633 0.25
634 0.28
635 0.3
636 0.27
637 0.24
638 0.24
639 0.2
640 0.2
641 0.15
642 0.12
643 0.09
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.06
648 0.05
649 0.05
650 0.04
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.04
655 0.05
656 0.05
657 0.06
658 0.08
659 0.11
660 0.13
661 0.14
662 0.18
663 0.18
664 0.18
665 0.18
666 0.18
667 0.16
668 0.15
669 0.14
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.11
674 0.11
675 0.1
676 0.08
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.13
681 0.15
682 0.15
683 0.15
684 0.15
685 0.15
686 0.2
687 0.21
688 0.17
689 0.13
690 0.15
691 0.16
692 0.16
693 0.18
694 0.14
695 0.14
696 0.14
697 0.14
698 0.11
699 0.1
700 0.1
701 0.08
702 0.07
703 0.06
704 0.09
705 0.1
706 0.09
707 0.11
708 0.11
709 0.11
710 0.12
711 0.12
712 0.12
713 0.11
714 0.12
715 0.14
716 0.16
717 0.15
718 0.14
719 0.13
720 0.12
721 0.12
722 0.12
723 0.08
724 0.07
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.12
729 0.19
730 0.22
731 0.27
732 0.28
733 0.27
734 0.26
735 0.26
736 0.24
737 0.23
738 0.21
739 0.22
740 0.29
741 0.34
742 0.35
743 0.36
744 0.35
745 0.32
746 0.31
747 0.3
748 0.23
749 0.18
750 0.18
751 0.17
752 0.16
753 0.14
754 0.13
755 0.09
756 0.14
757 0.13
758 0.12
759 0.12
760 0.12
761 0.13
762 0.13
763 0.14
764 0.09
765 0.13
766 0.14
767 0.16
768 0.16
769 0.17
770 0.22
771 0.21
772 0.27
773 0.32
774 0.4
775 0.48
776 0.55
777 0.61
778 0.65
779 0.69
780 0.68
781 0.66
782 0.59
783 0.53
784 0.51
785 0.43
786 0.36
787 0.32
788 0.26
789 0.21
790 0.18
791 0.16
792 0.13
793 0.15
794 0.12
795 0.14
796 0.15
797 0.15
798 0.22
799 0.25
800 0.25
801 0.24
802 0.24
803 0.21
804 0.21
805 0.22
806 0.17
807 0.13
808 0.11
809 0.11
810 0.11
811 0.11
812 0.1
813 0.09
814 0.07
815 0.07
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.08
820 0.09
821 0.1
822 0.1
823 0.1
824 0.09
825 0.12
826 0.14
827 0.17
828 0.17
829 0.17
830 0.19
831 0.21
832 0.26
833 0.31
834 0.32
835 0.31
836 0.33
837 0.39
838 0.44
839 0.48
840 0.47
841 0.4
842 0.42
843 0.45
844 0.47
845 0.42
846 0.39
847 0.33
848 0.31
849 0.31
850 0.3
851 0.27
852 0.22
853 0.21
854 0.22
855 0.2
856 0.19
857 0.22
858 0.2
859 0.21
860 0.24
861 0.26
862 0.31
863 0.36
864 0.44
865 0.43
866 0.47
867 0.44
868 0.45
869 0.43
870 0.37
871 0.41
872 0.35
873 0.32
874 0.29
875 0.3
876 0.27
877 0.26
878 0.27
879 0.22
880 0.22
881 0.22
882 0.21
883 0.21
884 0.2
885 0.23
886 0.24
887 0.27
888 0.28
889 0.31
890 0.35
891 0.39
892 0.47
893 0.51
894 0.5
895 0.53
896 0.59
897 0.64
898 0.62
899 0.61
900 0.56
901 0.56
902 0.54
903 0.49
904 0.42
905 0.37
906 0.34
907 0.34
908 0.31
909 0.26
910 0.27
911 0.24
912 0.22
913 0.16
914 0.2
915 0.18
916 0.18
917 0.16
918 0.13
919 0.13
920 0.13
921 0.13
922 0.1
923 0.09
924 0.09
925 0.08
926 0.08
927 0.08
928 0.08
929 0.1
930 0.11
931 0.11
932 0.15
933 0.17
934 0.21
935 0.22
936 0.26
937 0.26
938 0.3
939 0.33
940 0.38
941 0.44
942 0.48
943 0.51
944 0.5
945 0.51
946 0.53
947 0.58
948 0.57
949 0.59
950 0.6
951 0.62
952 0.64
953 0.63
954 0.61
955 0.57
956 0.55
957 0.52
958 0.46
959 0.46
960 0.46
961 0.48
962 0.45
963 0.41
964 0.43
965 0.41
966 0.42
967 0.37
968 0.35
969 0.33
970 0.41
971 0.41
972 0.35
973 0.29
974 0.27
975 0.31
976 0.3
977 0.31
978 0.29
979 0.28
980 0.29
981 0.3
982 0.36
983 0.42
984 0.49
985 0.45
986 0.4
987 0.38
988 0.43
989 0.45
990 0.44
991 0.38
992 0.31
993 0.33
994 0.33
995 0.36
996 0.33
997 0.35
998 0.35
999 0.33
1000 0.32
1001 0.29
1002 0.3
1003 0.31
1004 0.31
1005 0.31
1006 0.27
1007 0.29
1008 0.28
1009 0.3
1010 0.3
1011 0.27
1012 0.26
1013 0.23
1014 0.21
1015 0.21
1016 0.25
1017 0.24
1018 0.27
1019 0.31
1020 0.3
1021 0.36
1022 0.4
1023 0.43
1024 0.4
1025 0.41
1026 0.39
1027 0.4
1028 0.41
1029 0.39
1030 0.42
1031 0.42
1032 0.4
1033 0.39