FuNGI

A0A179V3S5

Protein Details

Accession

A0A179V3S5

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-53	GPPMRIRRPKVDPLVRPKQKRTPRPQGQGQPGAG	Hydrophilic
527-546	GTDTSRKKPKSKHADAEPGS	Hydrophilic
690-712	ASAIQGKHRKSRRLIQGNGKGNA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-78	GRAPPGQPGPPMRIRRPKVDPLVRPKQKRTPRPQGQGQPGAGPVTNGRVGSPKPRPPQAAPRPAPAK
472-479	AKKEKGKE
496-519	GRSKHTDPLNKKAASRAARKRPGS
531-574	SRKKPKSKHADAEPGSRPMSPGPSGHRKPGVPADQAGKKRSRNG
689-716	RASAIQGKHRKSRRLIQGNGKGNAPEKR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSSTPPNPPAPGRAPPGQPGPPMRIRRPKVDPLVRPKQKRTPRPQGQGQPGAGPVTNGRVGSPKPRPPQAAPRPAPAKPAIPSADDLTVNGFSGPLLSETYVDYPLITTKRAWREGLKHHVAKFASKKNIDPRDESSFTRPVRLQRRDPRASNTGPAVERDDQHPRRHGELNEAEREELEAKKAAREKERAENLAQIAPSASVTQKKTNAPKPRTQQVFKSEMTPAEIAKARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSGTYAMFVLQNDGKMRMVPLDRWYKFTTKTPFKTLTIEEAEKFMAKKAKDPRWVMEKEQDRAQKKALEDYARQSRLFTGRREGFSGVSEGFEGDDLDFEEDRFADDEEHVGILDDDEDAKVAEKRIKEDQLKANIFDLKDEHMYDQEENQEKKEKEALKNFGKHVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDESSDDSETERLKEEQQKLEEERAKKEKGKESDKNSGISTKGTNTPSGRSKHTDPLNKKAASRAARKRPGSPNLSDASGTDTSRKKPKSKHADAEPGSRPMSPGPSGHRKPGVPADQAGKKRSRNGPAGSGSGSDGERGIGSAAEMSDSTAAGAKKRKPNQPGVMSRTGTPRGSRAGSPAGLVPPRTGPGSGVNSPAPPTRTSTPGLSSPANLAFPTASEFTPPSRLRASQRRATKDLSARASAIQGKHRKSRRLIQGNGKGNAPEKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.51
3	0.55
4	0.52
5	0.53
6	0.51
7	0.52
8	0.54
9	0.59
10	0.64
11	0.67
12	0.67
13	0.7
14	0.74
15	0.76
16	0.77
17	0.79
18	0.79
19	0.78
20	0.85
21	0.85
22	0.86
23	0.85
24	0.84
25	0.85
26	0.87
27	0.87
28	0.87
29	0.88
30	0.89
31	0.91
32	0.9
33	0.89
34	0.87
35	0.77
36	0.68
37	0.59
38	0.51
39	0.41
40	0.32
41	0.23
42	0.2
43	0.2
44	0.18
45	0.17
46	0.2
47	0.22
48	0.31
49	0.39
50	0.44
51	0.49
52	0.57
53	0.62
54	0.65
55	0.74
56	0.75
57	0.77
58	0.71
59	0.73
60	0.71
61	0.66
62	0.64
63	0.56
64	0.51
65	0.42
66	0.46
67	0.38
68	0.35
69	0.36
70	0.33
71	0.33
72	0.28
73	0.26
74	0.21
75	0.19
76	0.17
77	0.15
78	0.12
79	0.08
80	0.08
81	0.09
82	0.07
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.1
87	0.12
88	0.13
89	0.12
90	0.11
91	0.1
92	0.15
93	0.16
94	0.16
95	0.17
96	0.24
97	0.33
98	0.37
99	0.4
100	0.42
101	0.48
102	0.56
103	0.64
104	0.65
105	0.62
106	0.6
107	0.63
108	0.57
109	0.57
110	0.56
111	0.54
112	0.54
113	0.51
114	0.56
115	0.6
116	0.68
117	0.64
118	0.6
119	0.57
120	0.56
121	0.57
122	0.54
123	0.49
124	0.48
125	0.44
126	0.45
127	0.43
128	0.43
129	0.5
130	0.55
131	0.6
132	0.62
133	0.72
134	0.75
135	0.76
136	0.74
137	0.71
138	0.66
139	0.6
140	0.53
141	0.48
142	0.4
143	0.38
144	0.36
145	0.31
146	0.29
147	0.29
148	0.37
149	0.37
150	0.42
151	0.47
152	0.45
153	0.47
154	0.53
155	0.49
156	0.48
157	0.51
158	0.51
159	0.5
160	0.48
161	0.43
162	0.36
163	0.37
164	0.3
165	0.22
166	0.18
167	0.15
168	0.15
169	0.2
170	0.25
171	0.29
172	0.34
173	0.39
174	0.42
175	0.48
176	0.54
177	0.52
178	0.49
179	0.48
180	0.43
181	0.39
182	0.34
183	0.24
184	0.18
185	0.15
186	0.14
187	0.11
188	0.11
189	0.13
190	0.17
191	0.22
192	0.26
193	0.33
194	0.41
195	0.49
196	0.58
197	0.58
198	0.64
199	0.67
200	0.71
201	0.73
202	0.68
203	0.67
204	0.63
205	0.63
206	0.55
207	0.51
208	0.43
209	0.36
210	0.35
211	0.29
212	0.21
213	0.19
214	0.21
215	0.19
216	0.22
217	0.23
218	0.21
219	0.21
220	0.23
221	0.2
222	0.21
223	0.24
224	0.23
225	0.24
226	0.24
227	0.24
228	0.23
229	0.22
230	0.19
231	0.15
232	0.16
233	0.14
234	0.14
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.14
240	0.11
241	0.1
242	0.09
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.08
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.07
256	0.07
257	0.09
258	0.1
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.12
264	0.13
265	0.13
266	0.19
267	0.28
268	0.28
269	0.33
270	0.35
271	0.35
272	0.36
273	0.41
274	0.44
275	0.43
276	0.46
277	0.48
278	0.49
279	0.47
280	0.49
281	0.42
282	0.39
283	0.34
284	0.32
285	0.26
286	0.23
287	0.22
288	0.19
289	0.18
290	0.16
291	0.16
292	0.14
293	0.21
294	0.29
295	0.37
296	0.44
297	0.47
298	0.48
299	0.52
300	0.55
301	0.51
302	0.49
303	0.47
304	0.41
305	0.45
306	0.47
307	0.41
308	0.4
309	0.4
310	0.36
311	0.31
312	0.34
313	0.32
314	0.29
315	0.29
316	0.33
317	0.38
318	0.37
319	0.36
320	0.31
321	0.3
322	0.33
323	0.35
324	0.3
325	0.3
326	0.32
327	0.33
328	0.35
329	0.33
330	0.26
331	0.23
332	0.23
333	0.15
334	0.11
335	0.1
336	0.08
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.04
367	0.05
368	0.07
369	0.1
370	0.1
371	0.14
372	0.19
373	0.25
374	0.28
375	0.33
376	0.38
377	0.44
378	0.45
379	0.43
380	0.4
381	0.36
382	0.33
383	0.27
384	0.21
385	0.14
386	0.14
387	0.14
388	0.13
389	0.11
390	0.13
391	0.12
392	0.13
393	0.17
394	0.21
395	0.21
396	0.23
397	0.29
398	0.28
399	0.29
400	0.35
401	0.35
402	0.36
403	0.43
404	0.49
405	0.49
406	0.54
407	0.55
408	0.57
409	0.55
410	0.5
411	0.49
412	0.49
413	0.5
414	0.54
415	0.62
416	0.64
417	0.67
418	0.72
419	0.73
420	0.69
421	0.66
422	0.58
423	0.51
424	0.46
425	0.39
426	0.36
427	0.3
428	0.27
429	0.23
430	0.21
431	0.19
432	0.14
433	0.13
434	0.12
435	0.1
436	0.11
437	0.11
438	0.14
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.13
447	0.18
448	0.26
449	0.3
450	0.34
451	0.35
452	0.39
453	0.4
454	0.47
455	0.48
456	0.42
457	0.44
458	0.45
459	0.47
460	0.47
461	0.52
462	0.53
463	0.55
464	0.62
465	0.63
466	0.64
467	0.7
468	0.67
469	0.61
470	0.54
471	0.48
472	0.39
473	0.33
474	0.27
475	0.2
476	0.24
477	0.23
478	0.26
479	0.25
480	0.3
481	0.35
482	0.36
483	0.38
484	0.37
485	0.4
486	0.44
487	0.5
488	0.55
489	0.53
490	0.59
491	0.63
492	0.6
493	0.56
494	0.53
495	0.53
496	0.51
497	0.56
498	0.57
499	0.59
500	0.66
501	0.68
502	0.71
503	0.72
504	0.73
505	0.69
506	0.62
507	0.57
508	0.5
509	0.48
510	0.4
511	0.31
512	0.28
513	0.24
514	0.22
515	0.22
516	0.24
517	0.27
518	0.36
519	0.42
520	0.44
521	0.5
522	0.61
523	0.66
524	0.73
525	0.77
526	0.77
527	0.82
528	0.78
529	0.77
530	0.7
531	0.63
532	0.54
533	0.45
534	0.36
535	0.27
536	0.28
537	0.22
538	0.21
539	0.25
540	0.35
541	0.37
542	0.42
543	0.46
544	0.42
545	0.44
546	0.5
547	0.49
548	0.41
549	0.42
550	0.43
551	0.45
552	0.5
553	0.51
554	0.49
555	0.46
556	0.52
557	0.57
558	0.58
559	0.59
560	0.58
561	0.6
562	0.57
563	0.56
564	0.48
565	0.41
566	0.34
567	0.28
568	0.23
569	0.16
570	0.12
571	0.1
572	0.09
573	0.08
574	0.08
575	0.05
576	0.05
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.1
586	0.1
587	0.14
588	0.21
589	0.29
590	0.38
591	0.47
592	0.55
593	0.59
594	0.69
595	0.75
596	0.78
597	0.8
598	0.78
599	0.78
600	0.71
601	0.65
602	0.61
603	0.56
604	0.48
605	0.4
606	0.36
607	0.33
608	0.35
609	0.33
610	0.32
611	0.33
612	0.3
613	0.29
614	0.29
615	0.29
616	0.28
617	0.28
618	0.25
619	0.21
620	0.23
621	0.23
622	0.21
623	0.17
624	0.22
625	0.27
626	0.28
627	0.29
628	0.29
629	0.29
630	0.31
631	0.34
632	0.29
633	0.24
634	0.28
635	0.28
636	0.3
637	0.33
638	0.34
639	0.33
640	0.35
641	0.38
642	0.34
643	0.31
644	0.31
645	0.3
646	0.28
647	0.23
648	0.2
649	0.16
650	0.15
651	0.18
652	0.16
653	0.14
654	0.15
655	0.17
656	0.18
657	0.28
658	0.29
659	0.29
660	0.32
661	0.37
662	0.44
663	0.53
664	0.59
665	0.58
666	0.67
667	0.71
668	0.7
669	0.7
670	0.7
671	0.68
672	0.68
673	0.65
674	0.58
675	0.51
676	0.47
677	0.48
678	0.44
679	0.4
680	0.41
681	0.44
682	0.48
683	0.57
684	0.64
685	0.68
686	0.7
687	0.76
688	0.78
689	0.79
690	0.82
691	0.83
692	0.85
693	0.85
694	0.79
695	0.71
696	0.62

A0A179V3S5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer