Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5X4D7

Protein Details
Accession A0A5N5X4D7    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-40MAPDKKDKKRKAAAATAAADSPAKKTKKVETKPTKSTNADHydrophilic
94-114TKVEAEKKSSNKKTKKADGTAHydrophilic
123-142NKPKNDTKAKGNTKVKKPEIHydrophilic
199-225IPKIPDSKKAKRKILKKQKENKQEADEBasic
313-340WKGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTREBasic
404-435APKEEKKADDTPKKSKKDKKKGAQSPAQETPKBasic
448-467SPAAKAGAKAKKAKKTKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-75KKDKKRKAAAATAAADSPAKKTKKVETKPTKSTNADPKPAPKKTKEDGAEKSAAKLKINGEPARQVKPRKR
100-139KKSSNKKTKKADGTAAPAPTEKTNKPKNDTKAKGNTKVKK
203-218PDSKKAKRKILKKQKE
316-353ANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTREQWSERIEREQKKR
406-426KEEKKADDTPKKSKKDKKKGA
451-467AKAGAKAKKAKKTKAKA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDKKRKAAAATAAADSPAKKTKKVETKPTKSTNADPKPAPKKTKEDGAEKSAAKLKINGEPARQVKPRKRAADFLSDNEENEAEDAIETKVEAEKKSSNKKTKKADGTAAPAPTEKTNKPKNDTKAKGNTKVKKPEIVAEESDDDEMEDKESASSDASASEDEDDRTVALIRGFESSGDEDESGDEGLNPDGPIPKIPDSKKAKRKILKKQKENKQEADEPGTVYVGRIPHGFYEHQMRAYFSQFGEISRLRLSRNRITGASKHYAFIEFKSTSVAKVVAGTMDNYLMYGHILKCKYVPQEQLHPDIWKGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTREQWSERIEREQKKRLAKVEQLKALGYEIELPQLKSVDEVPVQQEEDKVIEAPETAPEEPPKVIEAPKEEKKADDTPKKSKKDKKKGAQSPAQETPKEQLKEEASVATTSPAAKAGAKAKKAKKTKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.74
3 0.66
4 0.56
5 0.47
6 0.39
7 0.3
8 0.27
9 0.27
10 0.26
11 0.28
12 0.33
13 0.43
14 0.52
15 0.61
16 0.68
17 0.7
18 0.78
19 0.84
20 0.87
21 0.85
22 0.79
23 0.79
24 0.78
25 0.76
26 0.73
27 0.68
28 0.69
29 0.71
30 0.75
31 0.75
32 0.71
33 0.71
34 0.69
35 0.74
36 0.71
37 0.7
38 0.67
39 0.66
40 0.66
41 0.58
42 0.56
43 0.54
44 0.49
45 0.41
46 0.39
47 0.36
48 0.35
49 0.43
50 0.43
51 0.39
52 0.46
53 0.48
54 0.52
55 0.55
56 0.58
57 0.59
58 0.65
59 0.71
60 0.71
61 0.71
62 0.71
63 0.7
64 0.71
65 0.65
66 0.6
67 0.58
68 0.5
69 0.46
70 0.39
71 0.34
72 0.23
73 0.19
74 0.16
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.1
83 0.13
84 0.13
85 0.16
86 0.22
87 0.31
88 0.42
89 0.51
90 0.58
91 0.64
92 0.73
93 0.79
94 0.83
95 0.84
96 0.79
97 0.77
98 0.72
99 0.7
100 0.66
101 0.57
102 0.48
103 0.39
104 0.34
105 0.31
106 0.3
107 0.27
108 0.32
109 0.39
110 0.45
111 0.51
112 0.58
113 0.64
114 0.69
115 0.71
116 0.71
117 0.73
118 0.74
119 0.78
120 0.8
121 0.8
122 0.78
123 0.82
124 0.76
125 0.71
126 0.65
127 0.61
128 0.56
129 0.51
130 0.43
131 0.35
132 0.33
133 0.28
134 0.26
135 0.19
136 0.15
137 0.11
138 0.1
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.09
186 0.11
187 0.15
188 0.21
189 0.22
190 0.31
191 0.38
192 0.48
193 0.56
194 0.62
195 0.68
196 0.69
197 0.77
198 0.79
199 0.82
200 0.82
201 0.84
202 0.86
203 0.86
204 0.89
205 0.87
206 0.8
207 0.75
208 0.7
209 0.61
210 0.57
211 0.47
212 0.37
213 0.3
214 0.25
215 0.18
216 0.13
217 0.12
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.1
224 0.11
225 0.1
226 0.17
227 0.17
228 0.19
229 0.19
230 0.2
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.13
235 0.15
236 0.13
237 0.13
238 0.17
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.15
244 0.2
245 0.25
246 0.27
247 0.31
248 0.32
249 0.31
250 0.34
251 0.36
252 0.38
253 0.38
254 0.32
255 0.29
256 0.27
257 0.28
258 0.25
259 0.22
260 0.22
261 0.16
262 0.16
263 0.19
264 0.18
265 0.16
266 0.16
267 0.16
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.07
282 0.07
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.19
288 0.22
289 0.25
290 0.32
291 0.31
292 0.4
293 0.43
294 0.47
295 0.45
296 0.41
297 0.36
298 0.34
299 0.31
300 0.27
301 0.28
302 0.3
303 0.38
304 0.4
305 0.49
306 0.5
307 0.55
308 0.61
309 0.67
310 0.71
311 0.71
312 0.79
313 0.8
314 0.85
315 0.89
316 0.87
317 0.87
318 0.85
319 0.85
320 0.81
321 0.8
322 0.79
323 0.79
324 0.78
325 0.74
326 0.74
327 0.68
328 0.7
329 0.66
330 0.67
331 0.58
332 0.59
333 0.62
334 0.62
335 0.67
336 0.68
337 0.69
338 0.69
339 0.73
340 0.69
341 0.68
342 0.68
343 0.7
344 0.69
345 0.67
346 0.6
347 0.54
348 0.48
349 0.4
350 0.31
351 0.22
352 0.16
353 0.11
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.17
359 0.16
360 0.14
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.15
365 0.17
366 0.19
367 0.2
368 0.2
369 0.19
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.13
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.12
379 0.14
380 0.14
381 0.16
382 0.18
383 0.2
384 0.2
385 0.2
386 0.19
387 0.18
388 0.2
389 0.21
390 0.27
391 0.33
392 0.41
393 0.46
394 0.45
395 0.44
396 0.47
397 0.52
398 0.55
399 0.57
400 0.57
401 0.62
402 0.71
403 0.78
404 0.83
405 0.84
406 0.85
407 0.86
408 0.9
409 0.9
410 0.91
411 0.92
412 0.93
413 0.91
414 0.88
415 0.85
416 0.84
417 0.79
418 0.69
419 0.61
420 0.57
421 0.57
422 0.51
423 0.43
424 0.41
425 0.37
426 0.4
427 0.4
428 0.36
429 0.28
430 0.27
431 0.26
432 0.2
433 0.18
434 0.15
435 0.14
436 0.13
437 0.13
438 0.13
439 0.18
440 0.26
441 0.33
442 0.4
443 0.49
444 0.56
445 0.65
446 0.74
447 0.79