Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5XF59

Protein Details
Accession A0A5N5XF59    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-60ASKGEDGKPRKKKWTPAELQSLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-50KKIERIKKDASKGEDGKPRKKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037212  Med7/Med21-like  
IPR009244  Mediatior_Med7  
IPR044888  Mediatior_Med7_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF05983  Med7  
Amino Acid Sequences MADAGQQRALTAFAPPPPLWKHFTPDNLKKIERIKKDASKGEDGKPRKKKWTPAELQSLDLPPELRFLVPPEIPKTGHYSVFGEQQSLSTALPSLKDQGITQLYPSPTGDADQEQPSEPSQPLNHAYYLLKISKSLLLNFLEFVGILSVSPEQFESKVEDLRNLFINAHHLLNLYRPHQARESLILMMEEQLSRTREEIQQMDKLKEEITEALEQLKKDGIDVGSSIKSPEGDTKKSSLSDEKATQHAQTVWELLDENN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.27
4 0.31
5 0.35
6 0.37
7 0.36
8 0.39
9 0.4
10 0.5
11 0.54
12 0.59
13 0.63
14 0.64
15 0.63
16 0.62
17 0.65
18 0.66
19 0.63
20 0.61
21 0.63
22 0.65
23 0.72
24 0.74
25 0.7
26 0.7
27 0.67
28 0.67
29 0.67
30 0.66
31 0.68
32 0.7
33 0.71
34 0.72
35 0.74
36 0.77
37 0.77
38 0.81
39 0.79
40 0.77
41 0.81
42 0.72
43 0.66
44 0.59
45 0.5
46 0.4
47 0.32
48 0.25
49 0.15
50 0.15
51 0.13
52 0.11
53 0.1
54 0.12
55 0.17
56 0.17
57 0.21
58 0.22
59 0.24
60 0.25
61 0.25
62 0.29
63 0.27
64 0.27
65 0.25
66 0.24
67 0.23
68 0.29
69 0.28
70 0.21
71 0.19
72 0.18
73 0.18
74 0.16
75 0.14
76 0.08
77 0.09
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.11
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.14
86 0.16
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.17
91 0.17
92 0.18
93 0.14
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.09
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.12
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.14
115 0.17
116 0.15
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.14
121 0.15
122 0.14
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.05
132 0.04
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.1
143 0.11
144 0.15
145 0.15
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.2
150 0.18
151 0.16
152 0.13
153 0.17
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.12
158 0.12
159 0.15
160 0.19
161 0.16
162 0.21
163 0.21
164 0.24
165 0.26
166 0.27
167 0.25
168 0.26
169 0.26
170 0.2
171 0.2
172 0.17
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.09
177 0.08
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.16
183 0.18
184 0.23
185 0.26
186 0.26
187 0.32
188 0.35
189 0.36
190 0.33
191 0.31
192 0.27
193 0.23
194 0.21
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.19
200 0.21
201 0.21
202 0.2
203 0.21
204 0.17
205 0.16
206 0.19
207 0.15
208 0.13
209 0.14
210 0.17
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.23
218 0.26
219 0.28
220 0.32
221 0.35
222 0.37
223 0.39
224 0.41
225 0.39
226 0.38
227 0.41
228 0.44
229 0.44
230 0.46
231 0.46
232 0.43
233 0.39
234 0.37
235 0.32
236 0.27
237 0.25
238 0.2
239 0.19