Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5X9I4

Protein Details
Accession A0A5N5X9I4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-110EKAKRTKSTTAEKKTKKPTKKPTNSSAPKPRGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-136KGEKAKRTKSTTAEKKTKKPTKKPTNSSAPKPRGRKPLTEKQKEAKKARESKEHIKGLKRA
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MRLMNLAQRGVGVFRSLHLSDAFARPIRIAVTQSHIRRICLASRSQSLRLISRTLPSPGIVSQYLVKSYATAGDSKGEKAKRTKSTTAEKKTKKPTKKPTNSSAPKPRGRKPLTEKQKEAKKARESKEHIKGLKRAALQEPARLPDRFWNLAVMSKLPEAQKAHEKQVDAFKAAAELAKSLSAEEEESLNNLSKSNKEANAAQYDQWLRRHTPLEIKEANAARTRLSKLTKKRYPLIRDDRLVKRPLTAYVIFYKERLEQGDFKHMAITDISARVTQEWKGMTESEKEKYRELQLADQKRYHDQYQEVYGEEPPSSPKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.18
3 0.17
4 0.18
5 0.17
6 0.19
7 0.2
8 0.24
9 0.27
10 0.23
11 0.23
12 0.22
13 0.23
14 0.22
15 0.21
16 0.19
17 0.18
18 0.23
19 0.31
20 0.33
21 0.41
22 0.41
23 0.4
24 0.42
25 0.42
26 0.41
27 0.38
28 0.41
29 0.38
30 0.44
31 0.48
32 0.46
33 0.48
34 0.45
35 0.45
36 0.42
37 0.39
38 0.33
39 0.32
40 0.32
41 0.3
42 0.28
43 0.24
44 0.23
45 0.2
46 0.22
47 0.19
48 0.17
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.17
54 0.13
55 0.13
56 0.16
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.16
61 0.17
62 0.19
63 0.25
64 0.24
65 0.28
66 0.35
67 0.43
68 0.48
69 0.54
70 0.58
71 0.59
72 0.67
73 0.73
74 0.76
75 0.77
76 0.75
77 0.77
78 0.82
79 0.84
80 0.83
81 0.84
82 0.85
83 0.86
84 0.9
85 0.88
86 0.86
87 0.88
88 0.85
89 0.84
90 0.83
91 0.81
92 0.78
93 0.77
94 0.75
95 0.75
96 0.71
97 0.71
98 0.69
99 0.71
100 0.74
101 0.76
102 0.74
103 0.71
104 0.76
105 0.76
106 0.73
107 0.71
108 0.7
109 0.71
110 0.71
111 0.73
112 0.71
113 0.71
114 0.74
115 0.72
116 0.67
117 0.62
118 0.61
119 0.55
120 0.53
121 0.45
122 0.38
123 0.34
124 0.38
125 0.33
126 0.33
127 0.31
128 0.28
129 0.3
130 0.27
131 0.25
132 0.23
133 0.28
134 0.25
135 0.23
136 0.22
137 0.2
138 0.22
139 0.22
140 0.16
141 0.12
142 0.11
143 0.13
144 0.12
145 0.15
146 0.13
147 0.15
148 0.23
149 0.24
150 0.29
151 0.28
152 0.29
153 0.27
154 0.33
155 0.32
156 0.25
157 0.23
158 0.18
159 0.16
160 0.16
161 0.14
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.13
182 0.17
183 0.18
184 0.19
185 0.22
186 0.24
187 0.29
188 0.29
189 0.26
190 0.26
191 0.27
192 0.29
193 0.3
194 0.29
195 0.26
196 0.29
197 0.31
198 0.28
199 0.34
200 0.34
201 0.38
202 0.36
203 0.35
204 0.37
205 0.37
206 0.37
207 0.33
208 0.3
209 0.24
210 0.26
211 0.28
212 0.27
213 0.32
214 0.38
215 0.44
216 0.54
217 0.59
218 0.61
219 0.67
220 0.7
221 0.71
222 0.73
223 0.73
224 0.71
225 0.7
226 0.72
227 0.71
228 0.68
229 0.65
230 0.55
231 0.48
232 0.42
233 0.39
234 0.37
235 0.3
236 0.27
237 0.29
238 0.33
239 0.3
240 0.28
241 0.28
242 0.25
243 0.26
244 0.26
245 0.25
246 0.25
247 0.28
248 0.38
249 0.37
250 0.34
251 0.34
252 0.31
253 0.28
254 0.23
255 0.22
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.17
263 0.16
264 0.17
265 0.17
266 0.18
267 0.19
268 0.21
269 0.22
270 0.27
271 0.3
272 0.32
273 0.39
274 0.39
275 0.4
276 0.43
277 0.46
278 0.45
279 0.45
280 0.47
281 0.5
282 0.57
283 0.6
284 0.59
285 0.57
286 0.58
287 0.6
288 0.54
289 0.5
290 0.45
291 0.44
292 0.48
293 0.46
294 0.4
295 0.36
296 0.35
297 0.31
298 0.27
299 0.22