Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6DQY0

Protein Details
Accession A0A5N6DQY0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-381LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-372KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAGKKSSPAKLAQDKKAKSAPSLPPQLIASIEAFLTESGFTSTGKAFAKEQASKSVSKSPSDSKNAPSLLEIFQNWADNEKATDKSSDSSSSESSSSSSSSEESSSSSDESSDSSDSDAEMNDAPKAQSKKQSKSSSSSSSSSSSSSSGSDSDADDESEEETAAPAPAKPQGTKRKAESDSSSSESETDSDKAPQNKKTKIAAKKESSSSDSDSSDSSSSESSSSASDSSDSSSDSNSDSDSSDSDSSESSSSSSDSDEEDGKDNKTSSSSQSSSGSETVQNSDSGVQKTTNISTPVTGSSSASPAPGNGPAQKKHTGARPTPLALLSEQPTDHLLSNDYVPYAYAERAFKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.71
3 0.71
4 0.64
5 0.58
6 0.58
7 0.58
8 0.58
9 0.64
10 0.57
11 0.53
12 0.52
13 0.48
14 0.39
15 0.31
16 0.22
17 0.15
18 0.14
19 0.11
20 0.11
21 0.09
22 0.09
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.11
29 0.11
30 0.15
31 0.17
32 0.18
33 0.18
34 0.24
35 0.31
36 0.35
37 0.37
38 0.41
39 0.43
40 0.43
41 0.45
42 0.48
43 0.43
44 0.4
45 0.43
46 0.41
47 0.47
48 0.52
49 0.52
50 0.47
51 0.52
52 0.5
53 0.45
54 0.39
55 0.34
56 0.28
57 0.27
58 0.24
59 0.19
60 0.19
61 0.21
62 0.2
63 0.19
64 0.18
65 0.15
66 0.17
67 0.18
68 0.18
69 0.17
70 0.19
71 0.18
72 0.2
73 0.22
74 0.23
75 0.21
76 0.22
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.19
81 0.18
82 0.15
83 0.14
84 0.12
85 0.12
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.15
113 0.18
114 0.21
115 0.29
116 0.36
117 0.44
118 0.53
119 0.61
120 0.59
121 0.62
122 0.64
123 0.62
124 0.58
125 0.52
126 0.45
127 0.39
128 0.35
129 0.3
130 0.25
131 0.19
132 0.15
133 0.14
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.09
155 0.11
156 0.12
157 0.21
158 0.31
159 0.36
160 0.41
161 0.43
162 0.49
163 0.5
164 0.52
165 0.47
166 0.41
167 0.4
168 0.39
169 0.36
170 0.27
171 0.25
172 0.21
173 0.18
174 0.15
175 0.12
176 0.09
177 0.12
178 0.15
179 0.22
180 0.26
181 0.32
182 0.38
183 0.4
184 0.44
185 0.48
186 0.53
187 0.55
188 0.6
189 0.61
190 0.59
191 0.6
192 0.59
193 0.55
194 0.49
195 0.43
196 0.37
197 0.3
198 0.26
199 0.22
200 0.19
201 0.18
202 0.16
203 0.13
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.15
248 0.16
249 0.17
250 0.18
251 0.17
252 0.16
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.24
257 0.24
258 0.25
259 0.27
260 0.28
261 0.28
262 0.27
263 0.24
264 0.19
265 0.19
266 0.19
267 0.18
268 0.16
269 0.14
270 0.16
271 0.19
272 0.18
273 0.18
274 0.16
275 0.16
276 0.19
277 0.2
278 0.22
279 0.2
280 0.19
281 0.18
282 0.19
283 0.19
284 0.18
285 0.17
286 0.14
287 0.13
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.12
292 0.11
293 0.12
294 0.14
295 0.16
296 0.2
297 0.26
298 0.28
299 0.33
300 0.38
301 0.38
302 0.4
303 0.45
304 0.48
305 0.46
306 0.51
307 0.51
308 0.47
309 0.48
310 0.44
311 0.37
312 0.3
313 0.3
314 0.24
315 0.22
316 0.19
317 0.18
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.16
325 0.16
326 0.15
327 0.13
328 0.12
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.16
333 0.17
334 0.18
335 0.21
336 0.21
337 0.19
338 0.23
339 0.25
340 0.26
341 0.33
342 0.33
343 0.32
344 0.38
345 0.39
346 0.41
347 0.45
348 0.5
349 0.53
350 0.62
351 0.7
352 0.76
353 0.85
354 0.86
355 0.9
356 0.91
357 0.9
358 0.9
359 0.89
360 0.88
361 0.88
362 0.82
363 0.72
364 0.62
365 0.57
366 0.48
367 0.42
368 0.34
369 0.26
370 0.23