Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6D9F9

Protein Details
Accession A0A5N6D9F9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-33NSSQSSKKRKGGGNWHKHQNGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-21RK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.333, cyto 4, cyto_mito 2.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MAGTGKRSMPDNSSQSSKKRKGGGNWHKHQNGKAGIESGDWGVFVTCEIGKEGKCISEVLDLFSQSIETPDTGVQNDDSGSEDEDDIEAQIRKEVEGLKPSSAKPRQFQAIRLDIPCVSFIRFDKSIDPEKLVHQICVDAHANPDRKRSRYIQRMTPVKSIRKTLSVDLEAFAREILKPHFHSGGGPKKFAIRPAMRSNQKFDRDNLIKTIASVVGPEHSVDLKNYDLIILVDIIKNVIGMSVAGSDYEKLKRYNLAELYKPAPSSQEVEPKPSTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.53
3 0.61
4 0.64
5 0.62
6 0.65
7 0.68
8 0.7
9 0.76
10 0.79
11 0.79
12 0.8
13 0.84
14 0.82
15 0.79
16 0.73
17 0.7
18 0.65
19 0.57
20 0.5
21 0.42
22 0.37
23 0.33
24 0.3
25 0.23
26 0.16
27 0.12
28 0.1
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.06
34 0.07
35 0.09
36 0.11
37 0.11
38 0.14
39 0.15
40 0.14
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.18
45 0.18
46 0.2
47 0.2
48 0.19
49 0.19
50 0.18
51 0.17
52 0.1
53 0.11
54 0.08
55 0.07
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.11
81 0.13
82 0.14
83 0.19
84 0.2
85 0.21
86 0.23
87 0.24
88 0.32
89 0.36
90 0.38
91 0.35
92 0.37
93 0.43
94 0.42
95 0.46
96 0.43
97 0.43
98 0.41
99 0.39
100 0.36
101 0.29
102 0.28
103 0.24
104 0.18
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.15
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.21
113 0.27
114 0.26
115 0.27
116 0.23
117 0.23
118 0.3
119 0.28
120 0.24
121 0.17
122 0.18
123 0.15
124 0.18
125 0.17
126 0.1
127 0.11
128 0.16
129 0.21
130 0.21
131 0.3
132 0.31
133 0.32
134 0.36
135 0.41
136 0.46
137 0.51
138 0.55
139 0.54
140 0.58
141 0.64
142 0.63
143 0.64
144 0.6
145 0.57
146 0.54
147 0.51
148 0.44
149 0.41
150 0.4
151 0.35
152 0.34
153 0.29
154 0.27
155 0.23
156 0.22
157 0.18
158 0.16
159 0.13
160 0.08
161 0.06
162 0.08
163 0.09
164 0.13
165 0.15
166 0.18
167 0.19
168 0.19
169 0.21
170 0.28
171 0.35
172 0.33
173 0.32
174 0.3
175 0.34
176 0.35
177 0.37
178 0.37
179 0.32
180 0.36
181 0.44
182 0.54
183 0.56
184 0.58
185 0.61
186 0.6
187 0.62
188 0.58
189 0.52
190 0.53
191 0.49
192 0.49
193 0.45
194 0.4
195 0.33
196 0.31
197 0.3
198 0.2
199 0.16
200 0.14
201 0.12
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.04
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.11
235 0.15
236 0.18
237 0.19
238 0.21
239 0.27
240 0.29
241 0.37
242 0.41
243 0.43
244 0.45
245 0.48
246 0.49
247 0.46
248 0.44
249 0.36
250 0.31
251 0.28
252 0.27
253 0.28
254 0.35
255 0.34
256 0.4