Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6DBY1

Protein Details
Accession A0A5N6DBY1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1039-1058ETSQPQPQPQPQPQPRPSTMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, cyto 13.5, nucl 13, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MSRTTGPNLTAQPHETDIFPVSRSLDSALKKNTAFIKRLRTGVNASAQQTFLADIRTLSLHKYLSEIISACYEGLCKLKSPGEIATGVEITSALHQRFGPAEFTRQIGWLLGRGLSTPDKGQLKALSQEVREREEKERLSRHRVLLRVATELWLVGVLRTLDDIERPEDLGAKGKDGVVGIGGKASENPVKVKVPSAVRDSDKEAEPFPLEVLKDLLGHDRDHTNLPLAVLFVKSFSWDILGAKTVEEGRKTVEADGATTPAEATNGDEGAGDVTTAENDPPLIPEKTQARFKSILNRYLEDVKAHVVRDQRALAAQSRRNAEAYVKSGEIFEDRQANFEKQSKSLEKLVANTQVLCEALGVEMPALAEQESADPASSGGIGLVKTSEYLRGQGDGAGIWEDEEERRFYENLVDLKGKVPAVLLEDGKKKKTDSDEAGKKKDGEDSEKSDSAQGQPSEEKAAADADDQSMAIASKTVGAQVDALLAKLPDLQTKDHVDQLALDFCFLNSKASRNRLIKAVSDVPKGRIDLLPLYSRLVATLGQYLPDIPQGLITYLDEEFRSLQRRKSKEFLGQVRMSNVRYLAELTKFGVVPEHIIFHCFKVSLDDFSRMNIEIIGYLLENCGRYLLRNPETSPRMASFLETLGRKKTVQHLGQQERMIIENAVYYVDPPPRPAIQQKERTPMESYIRRLIYLDMNKRNYTRILKSIRKLHWEEQEVVDIIERVFSKPVKVKYGNIHLLAILVSALYRYHQEFVIGIVDNVLEQITLGLEQNDFKFNQKRVAEVKYLGELYNYKMIDSPVIFDTLYRIVTFGHEGGTPIPGKLNPLDLPDDFFRVRLVCTLLDTCGHCFDRGSAKKKLDFFLTFFQYYMTTKDPLPMDIDFLVQDTFSLTRPQWKLITDLEEATRIFGEAVAQNYKTQDAERPTEPDDDEAESSSSDEGFEDDVMPEVDEDGESSDEAEASGPNPEQNGDSDSEDEQIFVTRQEEERDPEAEAEFDREFEKMMAESMDSRKFERKGVFDIPLPMKRAPRDAAGESAPETSQPQPQPQPQPQPRPSTMAFSLMTKKGNKQQTRTIDLPSDSSFAVAMRSQQQADREEQQRIKNLVLNYEMSNEAETAEALEKRSPRDSRVDRSGGNRTAFRSRKLQLSDVNW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.27
3 0.26
4 0.26
5 0.24
6 0.22
7 0.21
8 0.2
9 0.19
10 0.2
11 0.2
12 0.23
13 0.25
14 0.32
15 0.36
16 0.39
17 0.38
18 0.42
19 0.48
20 0.49
21 0.5
22 0.5
23 0.55
24 0.54
25 0.6
26 0.58
27 0.53
28 0.51
29 0.53
30 0.54
31 0.49
32 0.46
33 0.43
34 0.4
35 0.36
36 0.31
37 0.26
38 0.18
39 0.15
40 0.13
41 0.11
42 0.13
43 0.15
44 0.15
45 0.16
46 0.19
47 0.18
48 0.17
49 0.2
50 0.21
51 0.2
52 0.22
53 0.21
54 0.18
55 0.19
56 0.19
57 0.16
58 0.14
59 0.14
60 0.12
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.19
65 0.23
66 0.25
67 0.27
68 0.28
69 0.27
70 0.27
71 0.26
72 0.25
73 0.21
74 0.19
75 0.16
76 0.13
77 0.1
78 0.13
79 0.18
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.19
84 0.22
85 0.23
86 0.24
87 0.21
88 0.27
89 0.26
90 0.28
91 0.27
92 0.26
93 0.25
94 0.21
95 0.2
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.17
102 0.18
103 0.19
104 0.18
105 0.24
106 0.26
107 0.27
108 0.3
109 0.3
110 0.31
111 0.34
112 0.38
113 0.36
114 0.35
115 0.41
116 0.41
117 0.42
118 0.42
119 0.42
120 0.41
121 0.45
122 0.48
123 0.5
124 0.56
125 0.58
126 0.64
127 0.67
128 0.69
129 0.67
130 0.65
131 0.61
132 0.58
133 0.52
134 0.47
135 0.41
136 0.34
137 0.27
138 0.24
139 0.19
140 0.13
141 0.11
142 0.07
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.11
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.16
156 0.16
157 0.23
158 0.21
159 0.21
160 0.21
161 0.2
162 0.21
163 0.18
164 0.18
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.12
173 0.13
174 0.15
175 0.17
176 0.2
177 0.23
178 0.24
179 0.26
180 0.29
181 0.31
182 0.35
183 0.37
184 0.39
185 0.4
186 0.42
187 0.44
188 0.42
189 0.39
190 0.36
191 0.32
192 0.29
193 0.27
194 0.25
195 0.2
196 0.19
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.13
201 0.12
202 0.13
203 0.18
204 0.16
205 0.17
206 0.19
207 0.19
208 0.21
209 0.23
210 0.23
211 0.2
212 0.19
213 0.19
214 0.16
215 0.15
216 0.14
217 0.12
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.13
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.16
236 0.17
237 0.2
238 0.21
239 0.2
240 0.2
241 0.17
242 0.18
243 0.18
244 0.16
245 0.14
246 0.12
247 0.12
248 0.09
249 0.09
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.06
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.17
273 0.23
274 0.29
275 0.37
276 0.36
277 0.38
278 0.39
279 0.41
280 0.47
281 0.47
282 0.49
283 0.45
284 0.45
285 0.42
286 0.44
287 0.43
288 0.34
289 0.28
290 0.25
291 0.23
292 0.22
293 0.22
294 0.22
295 0.23
296 0.26
297 0.25
298 0.22
299 0.22
300 0.23
301 0.26
302 0.29
303 0.31
304 0.32
305 0.35
306 0.35
307 0.34
308 0.33
309 0.3
310 0.27
311 0.27
312 0.24
313 0.22
314 0.21
315 0.2
316 0.2
317 0.18
318 0.15
319 0.14
320 0.18
321 0.18
322 0.21
323 0.24
324 0.25
325 0.26
326 0.31
327 0.31
328 0.26
329 0.33
330 0.34
331 0.34
332 0.37
333 0.38
334 0.33
335 0.34
336 0.37
337 0.35
338 0.33
339 0.29
340 0.25
341 0.21
342 0.19
343 0.16
344 0.12
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.09
375 0.09
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.14
397 0.18
398 0.18
399 0.2
400 0.2
401 0.19
402 0.19
403 0.21
404 0.18
405 0.13
406 0.11
407 0.09
408 0.11
409 0.13
410 0.13
411 0.15
412 0.22
413 0.25
414 0.26
415 0.27
416 0.25
417 0.27
418 0.31
419 0.34
420 0.34
421 0.42
422 0.5
423 0.55
424 0.59
425 0.56
426 0.52
427 0.45
428 0.43
429 0.35
430 0.32
431 0.31
432 0.33
433 0.36
434 0.36
435 0.35
436 0.32
437 0.3
438 0.26
439 0.26
440 0.2
441 0.17
442 0.17
443 0.17
444 0.18
445 0.17
446 0.15
447 0.1
448 0.11
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.07
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.05
457 0.05
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.08
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.1
478 0.11
479 0.14
480 0.19
481 0.2
482 0.21
483 0.2
484 0.18
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.13
489 0.12
490 0.1
491 0.09
492 0.11
493 0.11
494 0.12
495 0.09
496 0.14
497 0.18
498 0.23
499 0.3
500 0.31
501 0.32
502 0.34
503 0.35
504 0.32
505 0.32
506 0.35
507 0.31
508 0.33
509 0.32
510 0.3
511 0.3
512 0.29
513 0.26
514 0.19
515 0.17
516 0.15
517 0.16
518 0.16
519 0.14
520 0.15
521 0.14
522 0.13
523 0.12
524 0.1
525 0.08
526 0.07
527 0.1
528 0.08
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.09
534 0.09
535 0.05
536 0.06
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.06
541 0.07
542 0.06
543 0.07
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.09
548 0.16
549 0.17
550 0.22
551 0.29
552 0.34
553 0.38
554 0.41
555 0.43
556 0.44
557 0.5
558 0.51
559 0.5
560 0.48
561 0.45
562 0.43
563 0.41
564 0.34
565 0.27
566 0.21
567 0.14
568 0.11
569 0.12
570 0.11
571 0.1
572 0.1
573 0.1
574 0.11
575 0.11
576 0.1
577 0.1
578 0.08
579 0.09
580 0.09
581 0.1
582 0.09
583 0.1
584 0.11
585 0.1
586 0.11
587 0.09
588 0.09
589 0.11
590 0.12
591 0.14
592 0.15
593 0.17
594 0.16
595 0.17
596 0.18
597 0.14
598 0.13
599 0.1
600 0.08
601 0.06
602 0.06
603 0.05
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.06
611 0.05
612 0.06
613 0.11
614 0.18
615 0.21
616 0.23
617 0.24
618 0.3
619 0.33
620 0.33
621 0.3
622 0.24
623 0.23
624 0.21
625 0.2
626 0.13
627 0.12
628 0.15
629 0.15
630 0.15
631 0.15
632 0.16
633 0.16
634 0.17
635 0.24
636 0.29
637 0.3
638 0.36
639 0.44
640 0.47
641 0.52
642 0.5
643 0.43
644 0.35
645 0.33
646 0.27
647 0.17
648 0.12
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.05
654 0.08
655 0.12
656 0.12
657 0.13
658 0.15
659 0.16
660 0.18
661 0.23
662 0.3
663 0.35
664 0.45
665 0.48
666 0.54
667 0.54
668 0.54
669 0.52
670 0.46
671 0.45
672 0.41
673 0.39
674 0.37
675 0.36
676 0.34
677 0.31
678 0.29
679 0.28
680 0.3
681 0.36
682 0.37
683 0.4
684 0.42
685 0.42
686 0.42
687 0.4
688 0.38
689 0.34
690 0.35
691 0.4
692 0.45
693 0.5
694 0.58
695 0.56
696 0.58
697 0.59
698 0.57
699 0.56
700 0.53
701 0.49
702 0.42
703 0.4
704 0.33
705 0.28
706 0.22
707 0.14
708 0.1
709 0.11
710 0.1
711 0.08
712 0.1
713 0.11
714 0.14
715 0.2
716 0.23
717 0.29
718 0.3
719 0.34
720 0.38
721 0.47
722 0.48
723 0.43
724 0.4
725 0.32
726 0.3
727 0.25
728 0.19
729 0.1
730 0.05
731 0.03
732 0.03
733 0.03
734 0.04
735 0.05
736 0.07
737 0.08
738 0.08
739 0.09
740 0.09
741 0.1
742 0.12
743 0.11
744 0.09
745 0.08
746 0.08
747 0.07
748 0.07
749 0.06
750 0.03
751 0.03
752 0.03
753 0.03
754 0.03
755 0.04
756 0.04
757 0.05
758 0.06
759 0.08
760 0.1
761 0.11
762 0.15
763 0.21
764 0.22
765 0.3
766 0.3
767 0.33
768 0.35
769 0.4
770 0.38
771 0.34
772 0.34
773 0.28
774 0.28
775 0.24
776 0.21
777 0.17
778 0.16
779 0.2
780 0.18
781 0.15
782 0.16
783 0.16
784 0.17
785 0.16
786 0.16
787 0.11
788 0.13
789 0.12
790 0.11
791 0.13
792 0.12
793 0.13
794 0.1
795 0.1
796 0.09
797 0.1
798 0.12
799 0.1
800 0.09
801 0.09
802 0.09
803 0.1
804 0.12
805 0.12
806 0.1
807 0.11
808 0.1
809 0.12
810 0.13
811 0.16
812 0.14
813 0.16
814 0.19
815 0.18
816 0.22
817 0.21
818 0.24
819 0.2
820 0.19
821 0.18
822 0.15
823 0.15
824 0.13
825 0.14
826 0.11
827 0.13
828 0.14
829 0.14
830 0.15
831 0.16
832 0.16
833 0.19
834 0.2
835 0.17
836 0.17
837 0.19
838 0.27
839 0.34
840 0.38
841 0.4
842 0.44
843 0.49
844 0.52
845 0.52
846 0.48
847 0.42
848 0.4
849 0.4
850 0.4
851 0.36
852 0.32
853 0.3
854 0.25
855 0.24
856 0.23
857 0.19
858 0.15
859 0.15
860 0.2
861 0.2
862 0.2
863 0.22
864 0.18
865 0.18
866 0.17
867 0.17
868 0.12
869 0.13
870 0.12
871 0.08
872 0.08
873 0.07
874 0.07
875 0.08
876 0.11
877 0.11
878 0.2
879 0.22
880 0.25
881 0.27
882 0.27
883 0.29
884 0.29
885 0.34
886 0.27
887 0.27
888 0.24
889 0.24
890 0.23
891 0.2
892 0.17
893 0.12
894 0.11
895 0.09
896 0.1
897 0.1
898 0.13
899 0.15
900 0.16
901 0.17
902 0.18
903 0.19
904 0.17
905 0.16
906 0.2
907 0.22
908 0.26
909 0.28
910 0.31
911 0.32
912 0.35
913 0.34
914 0.3
915 0.26
916 0.24
917 0.23
918 0.2
919 0.18
920 0.14
921 0.14
922 0.13
923 0.11
924 0.08
925 0.07
926 0.07
927 0.07
928 0.07
929 0.07
930 0.07
931 0.08
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.07
936 0.07
937 0.06
938 0.06
939 0.07
940 0.07
941 0.07
942 0.07
943 0.07
944 0.07
945 0.07
946 0.07
947 0.06
948 0.06
949 0.09
950 0.09
951 0.09
952 0.1
953 0.1
954 0.11
955 0.12
956 0.15
957 0.15
958 0.16
959 0.17
960 0.17
961 0.19
962 0.18
963 0.16
964 0.13
965 0.13
966 0.12
967 0.11
968 0.11
969 0.12
970 0.14
971 0.18
972 0.21
973 0.24
974 0.26
975 0.27
976 0.27
977 0.25
978 0.24
979 0.21
980 0.18
981 0.18
982 0.15
983 0.14
984 0.14
985 0.12
986 0.13
987 0.12
988 0.13
989 0.09
990 0.1
991 0.1
992 0.1
993 0.14
994 0.19
995 0.24
996 0.25
997 0.28
998 0.34
999 0.35
1000 0.4
1001 0.42
1002 0.41
1003 0.42
1004 0.46
1005 0.47
1006 0.42
1007 0.49
1008 0.5
1009 0.48
1010 0.48
1011 0.45
1012 0.45
1013 0.44
1014 0.47
1015 0.41
1016 0.4
1017 0.41
1018 0.39
1019 0.4
1020 0.36
1021 0.35
1022 0.3
1023 0.29
1024 0.24
1025 0.19
1026 0.19
1027 0.17
1028 0.23
1029 0.25
1030 0.31
1031 0.37
1032 0.46
1033 0.55
1034 0.61
1035 0.7
1036 0.72
1037 0.79
1038 0.79
1039 0.8
1040 0.75
1041 0.72
1042 0.65
1043 0.6
1044 0.52
1045 0.47
1046 0.4
1047 0.36
1048 0.39
1049 0.36
1050 0.4
1051 0.36
1052 0.41
1053 0.44
1054 0.54
1055 0.57
1056 0.57
1057 0.63
1058 0.67
1059 0.72
1060 0.68
1061 0.64
1062 0.59
1063 0.53
1064 0.5
1065 0.42
1066 0.35
1067 0.27
1068 0.25
1069 0.2
1070 0.14
1071 0.15
1072 0.13
1073 0.14
1074 0.17
1075 0.21
1076 0.22
1077 0.25
1078 0.3
1079 0.31
1080 0.36
1081 0.41
1082 0.41
1083 0.46
1084 0.51
1085 0.54
1086 0.58
1087 0.57
1088 0.54
1089 0.51
1090 0.48
1091 0.43
1092 0.41
1093 0.37
1094 0.3
1095 0.3
1096 0.28
1097 0.24
1098 0.23
1099 0.18
1100 0.15
1101 0.13
1102 0.11
1103 0.11
1104 0.13
1105 0.14
1106 0.15
1107 0.2
1108 0.22
1109 0.26
1110 0.35
1111 0.36
1112 0.37
1113 0.46
1114 0.53
1115 0.57
1116 0.64
1117 0.65
1118 0.61
1119 0.64
1120 0.69
1121 0.65
1122 0.62
1123 0.56
1124 0.51
1125 0.56
1126 0.57
1127 0.55
1128 0.54
1129 0.51
1130 0.55
1131 0.57
1132 0.59