Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A179V2X8

Protein Details
Accession A0A179V2X8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-122QMLYKLKHPPRESKPKSPAPTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-127KHPPRESKPKSPAPTPAKPKR
Subcellular Location(s) cyto 11, nucl 8, cyto_mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
KEGG bgh:BDBG_08906  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDTTLPRDRPSGRQTRGIFENPDPFAQVAHATTQDDDDAIDFEDTYDGLGDQLDEDQDAFNEDTFGGGEDEKQPVGKDFDFYGKTAQMSNVLDEEQMLYKLKHPPRESKPKSPAPTPAKPKRTGYELYQDPGYIPEIQAKSTVWGTGVGQKSKAEDSTLPSKPAAPAKKIMSLEEVEAQMRAQSKKPLGTEQPSVPPPPPQTAPQFPGAIPQGTVPLTMPLHDRPAPPPDGMQPLSLQEFPPLDQQRQYAQLGKDALAGQAFQRQQSFPPMEAMLPRPGMPPPPMHHQNRPPPSAAPQRPMRQVQHHHPKSQAPMGPPGKLPVTSGMPHNLAPLTEEQRKANLIEDAKRAKRNHKILLLSKGNGLMTPQDKNFITRIQLQQLVAATGNVTDPESEASLSEDFYYQVYSQIRGAPRQHPRQPLGHFAQTYLFQTGGRSAGGMGRRQFYTGDNHMQRMQQQVQRAVEAAKLRPKNKQLIIEGSLGKISFSNAKTPKPLLNIKRPDSSDGQKASNLKKGNHTAMSPSDRKSILKNIENVYGTLMQMEDHERSMPPPPDENDPGSVERHMEWRQKMQHLNQKLWSDMKVLEPIVPGSPTPHPFIAFLSYPKGKKAIPRIFRQIDQEQRVTILTMIIVHLDSLDVVQRAQLQPGESQPPLAVREEIDLFSHAVMPSLLGYVNEAPINIITGLLGLVIGQTHVQTVAKTRVGLGVLTMLLSRAELVKEGGTVEDELLKSWTELYNTFFDRLEPVFSDIFPGTINSGDDMYVWQFLAAVGIGASPEQQQRLVIAVKERVMETVAQSKTLPADMASQRLGNVNLFMRAIGLDVELLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.49
3 0.54
4 0.53
5 0.61
6 0.61
7 0.63
8 0.66
9 0.63
10 0.58
11 0.53
12 0.56
13 0.49
14 0.47
15 0.42
16 0.35
17 0.3
18 0.26
19 0.22
20 0.16
21 0.16
22 0.17
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.16
27 0.14
28 0.13
29 0.11
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.11
58 0.09
59 0.08
60 0.1
61 0.12
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.17
67 0.22
68 0.2
69 0.2
70 0.2
71 0.27
72 0.28
73 0.28
74 0.29
75 0.26
76 0.26
77 0.26
78 0.24
79 0.23
80 0.22
81 0.23
82 0.2
83 0.19
84 0.18
85 0.16
86 0.17
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.13
91 0.17
92 0.27
93 0.32
94 0.39
95 0.43
96 0.52
97 0.61
98 0.71
99 0.75
100 0.76
101 0.8
102 0.81
103 0.82
104 0.77
105 0.77
106 0.74
107 0.76
108 0.76
109 0.76
110 0.75
111 0.75
112 0.76
113 0.7
114 0.67
115 0.62
116 0.56
117 0.56
118 0.51
119 0.48
120 0.43
121 0.38
122 0.32
123 0.29
124 0.26
125 0.17
126 0.14
127 0.19
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.19
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.19
139 0.24
140 0.23
141 0.24
142 0.25
143 0.27
144 0.28
145 0.27
146 0.23
147 0.19
148 0.23
149 0.3
150 0.32
151 0.32
152 0.3
153 0.31
154 0.32
155 0.38
156 0.38
157 0.33
158 0.37
159 0.38
160 0.45
161 0.44
162 0.42
163 0.37
164 0.33
165 0.31
166 0.27
167 0.25
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.14
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.23
176 0.26
177 0.31
178 0.34
179 0.38
180 0.41
181 0.44
182 0.46
183 0.43
184 0.46
185 0.44
186 0.44
187 0.38
188 0.37
189 0.35
190 0.34
191 0.33
192 0.3
193 0.35
194 0.39
195 0.41
196 0.39
197 0.38
198 0.33
199 0.35
200 0.33
201 0.26
202 0.21
203 0.18
204 0.17
205 0.15
206 0.16
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.12
211 0.15
212 0.14
213 0.19
214 0.21
215 0.23
216 0.22
217 0.28
218 0.29
219 0.27
220 0.27
221 0.25
222 0.29
223 0.28
224 0.26
225 0.21
226 0.21
227 0.23
228 0.22
229 0.19
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.23
234 0.24
235 0.23
236 0.24
237 0.26
238 0.26
239 0.3
240 0.31
241 0.28
242 0.26
243 0.28
244 0.28
245 0.26
246 0.26
247 0.22
248 0.2
249 0.14
250 0.14
251 0.1
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.16
256 0.16
257 0.17
258 0.24
259 0.26
260 0.2
261 0.22
262 0.22
263 0.2
264 0.22
265 0.23
266 0.19
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.16
271 0.18
272 0.18
273 0.2
274 0.21
275 0.29
276 0.36
277 0.4
278 0.47
279 0.53
280 0.61
281 0.64
282 0.62
283 0.55
284 0.49
285 0.51
286 0.54
287 0.49
288 0.46
289 0.46
290 0.49
291 0.53
292 0.57
293 0.54
294 0.52
295 0.55
296 0.59
297 0.63
298 0.62
299 0.59
300 0.57
301 0.56
302 0.51
303 0.51
304 0.44
305 0.34
306 0.4
307 0.39
308 0.37
309 0.34
310 0.32
311 0.26
312 0.23
313 0.21
314 0.15
315 0.16
316 0.15
317 0.16
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.17
322 0.15
323 0.11
324 0.12
325 0.13
326 0.16
327 0.19
328 0.2
329 0.2
330 0.21
331 0.22
332 0.22
333 0.2
334 0.19
335 0.17
336 0.2
337 0.25
338 0.3
339 0.33
340 0.4
341 0.4
342 0.44
343 0.5
344 0.53
345 0.54
346 0.54
347 0.56
348 0.54
349 0.61
350 0.57
351 0.48
352 0.42
353 0.36
354 0.3
355 0.24
356 0.19
357 0.13
358 0.12
359 0.14
360 0.13
361 0.15
362 0.15
363 0.17
364 0.18
365 0.16
366 0.17
367 0.2
368 0.22
369 0.22
370 0.24
371 0.23
372 0.23
373 0.21
374 0.19
375 0.14
376 0.11
377 0.08
378 0.06
379 0.06
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.06
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.15
402 0.16
403 0.19
404 0.22
405 0.26
406 0.34
407 0.41
408 0.46
409 0.49
410 0.5
411 0.53
412 0.52
413 0.51
414 0.47
415 0.42
416 0.36
417 0.31
418 0.29
419 0.24
420 0.23
421 0.16
422 0.12
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.08
431 0.1
432 0.13
433 0.14
434 0.15
435 0.16
436 0.16
437 0.17
438 0.16
439 0.19
440 0.2
441 0.27
442 0.26
443 0.28
444 0.29
445 0.29
446 0.29
447 0.29
448 0.31
449 0.25
450 0.28
451 0.31
452 0.29
453 0.29
454 0.28
455 0.23
456 0.2
457 0.2
458 0.19
459 0.21
460 0.26
461 0.27
462 0.33
463 0.37
464 0.42
465 0.44
466 0.47
467 0.43
468 0.42
469 0.44
470 0.42
471 0.37
472 0.3
473 0.26
474 0.2
475 0.17
476 0.12
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.2
481 0.22
482 0.24
483 0.26
484 0.29
485 0.31
486 0.31
487 0.39
488 0.38
489 0.45
490 0.52
491 0.53
492 0.56
493 0.54
494 0.52
495 0.49
496 0.46
497 0.42
498 0.37
499 0.35
500 0.32
501 0.36
502 0.35
503 0.36
504 0.36
505 0.31
506 0.35
507 0.38
508 0.4
509 0.37
510 0.35
511 0.32
512 0.33
513 0.38
514 0.34
515 0.31
516 0.3
517 0.3
518 0.3
519 0.3
520 0.33
521 0.34
522 0.36
523 0.39
524 0.37
525 0.41
526 0.41
527 0.38
528 0.32
529 0.25
530 0.2
531 0.15
532 0.13
533 0.08
534 0.08
535 0.11
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.17
542 0.2
543 0.2
544 0.23
545 0.24
546 0.29
547 0.32
548 0.33
549 0.3
550 0.29
551 0.28
552 0.25
553 0.24
554 0.19
555 0.17
556 0.2
557 0.23
558 0.27
559 0.28
560 0.35
561 0.4
562 0.45
563 0.5
564 0.53
565 0.57
566 0.56
567 0.57
568 0.56
569 0.52
570 0.47
571 0.43
572 0.36
573 0.3
574 0.25
575 0.23
576 0.2
577 0.18
578 0.18
579 0.16
580 0.16
581 0.15
582 0.14
583 0.12
584 0.12
585 0.16
586 0.17
587 0.2
588 0.2
589 0.2
590 0.2
591 0.21
592 0.22
593 0.19
594 0.18
595 0.21
596 0.25
597 0.25
598 0.26
599 0.27
600 0.25
601 0.3
602 0.4
603 0.43
604 0.46
605 0.52
606 0.61
607 0.62
608 0.64
609 0.64
610 0.61
611 0.61
612 0.59
613 0.53
614 0.43
615 0.4
616 0.37
617 0.31
618 0.23
619 0.14
620 0.09
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.06
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.04
629 0.04
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.12
635 0.12
636 0.14
637 0.16
638 0.15
639 0.17
640 0.21
641 0.25
642 0.21
643 0.21
644 0.2
645 0.2
646 0.21
647 0.21
648 0.17
649 0.13
650 0.16
651 0.17
652 0.17
653 0.16
654 0.15
655 0.14
656 0.13
657 0.15
658 0.12
659 0.1
660 0.1
661 0.09
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.06
666 0.08
667 0.08
668 0.1
669 0.1
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.11
674 0.09
675 0.07
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.05
680 0.05
681 0.03
682 0.03
683 0.03
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.06
689 0.07
690 0.07
691 0.12
692 0.18
693 0.2
694 0.2
695 0.2
696 0.22
697 0.22
698 0.22
699 0.17
700 0.13
701 0.11
702 0.11
703 0.1
704 0.08
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.06
709 0.07
710 0.08
711 0.09
712 0.09
713 0.1
714 0.1
715 0.1
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.13
720 0.12
721 0.12
722 0.13
723 0.13
724 0.12
725 0.13
726 0.14
727 0.13
728 0.14
729 0.17
730 0.22
731 0.24
732 0.26
733 0.24
734 0.22
735 0.24
736 0.24
737 0.23
738 0.19
739 0.2
740 0.2
741 0.19
742 0.23
743 0.19
744 0.18
745 0.15
746 0.14
747 0.12
748 0.12
749 0.13
750 0.1
751 0.11
752 0.1
753 0.1
754 0.11
755 0.12
756 0.11
757 0.11
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.07
763 0.06
764 0.05
765 0.05
766 0.05
767 0.05
768 0.06
769 0.09
770 0.12
771 0.13
772 0.14
773 0.14
774 0.15
775 0.19
776 0.22
777 0.21
778 0.24
779 0.27
780 0.28
781 0.3
782 0.3
783 0.26
784 0.25
785 0.23
786 0.21
787 0.26
788 0.24
789 0.23
790 0.23
791 0.24
792 0.24
793 0.24
794 0.21
795 0.13
796 0.21
797 0.22
798 0.26
799 0.27
800 0.26
801 0.25
802 0.28
803 0.29
804 0.21
805 0.23
806 0.2
807 0.2
808 0.2
809 0.19
810 0.16
811 0.14
812 0.14
813 0.11
814 0.09