FuNGI

A0A5N6DBA0

Protein Details

Accession

A0A5N6DBA0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
592-611	SGSFALKRVRRKEVRKGMVV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
601-603	RRK

Subcellular Location(s)

cysk 13, cyto 8, cyto_nucl 6, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035531 GTPBP1-like IPR034105 Lsm3 IPR010920 LSM_dom_sf IPR027417 P-loop_NTPase IPR047575 Sm IPR001163 Sm_dom_euk/arc IPR000795 T_Tr_GTP-bd_dom IPR009000 Transl_B-barrel_sf IPR009001 Transl_elong_EF1A/Init_IF2_C
Gene Ontology	GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00009 GTP_EFTU PF01423 LSM
PROSITE	View protein in PROSITE PS51722 G_TR_2 PS52002 SM
CDD	cd04165 GTPBP1_like cd03694 GTPBP_II cd03708 GTPBP_III cd01730 LSm3

Amino Acid Sequences

MADTEDAGTTSVAEPLDLVRLSLDEIVFVKLRGDRELKGRLHAYDSHCNLVMGDVEETIYVVEEDENEEEIIRTIKRQEEMLFVRVPCINSLTSTTLSLPITKYSSMAPAGPKLTPEERRRGEIALSDFAEYAEKQQSHRSVAPSDSGYSTASVSRVHEDHAELEILDQLGLSDTPKPTRLKDLLLNIGDQQEDSLQILGSIIQTRIDEGHGEAIFDVGIEDGGESMGFDLTQWETALQRVREAAGTLPAHCRILVTYNVGGPEESQVRNDRMKGSCGKLLIRQPAETVEEMAELRIAVVGNVDAGKSTMLGVLVKGNLDDGRGKARVNLFRHKHEIESGRTSSVGMEIMGFDSHGEIVTSAQGRKLSWEEIGKRSAKVISFSDLAGHERYLRTTVFGMLSSSPNYCLLMVAANNGLIGMSKEHLGIALALNVPVMIIVTKIDICPPQILQETLSQLNKILKSPGARKIPIFVKDMDQTINTATQFVSQRICPIFQVSNVTGENLELVRTFLNILPHRGHYNADAPFELLINDTFSVPHVGTVVSGVAKSGVIHAGDTVLVGPDSLGQFTTTTIKSIERKRISVNACFAGQSGSFALKRVRRKEVRKGMVVLKKLDQPPKVYREFVAEVLILSHATTIKPRYQAMLHVGAVSQTCSVIDIDRPFIRTGDRALVAFRFVQRPEFLAPGDRVLFREGKTKGLGIVKSVGYDPDNPLNPEAKEANTK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.1
3	0.14
4	0.13
5	0.12
6	0.1
7	0.11
8	0.12
9	0.14
10	0.13
11	0.11
12	0.12
13	0.15
14	0.15
15	0.15
16	0.16
17	0.17
18	0.19
19	0.24
20	0.26
21	0.27
22	0.34
23	0.43
24	0.42
25	0.45
26	0.47
27	0.42
28	0.43
29	0.47
30	0.46
31	0.47
32	0.49
33	0.46
34	0.43
35	0.41
36	0.36
37	0.31
38	0.26
39	0.17
40	0.15
41	0.11
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.09
46	0.07
47	0.05
48	0.05
49	0.05
50	0.06
51	0.08
52	0.09
53	0.11
54	0.1
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.13
59	0.12
60	0.13
61	0.16
62	0.21
63	0.22
64	0.25
65	0.26
66	0.32
67	0.36
68	0.38
69	0.39
70	0.34
71	0.35
72	0.35
73	0.34
74	0.26
75	0.24
76	0.2
77	0.17
78	0.21
79	0.21
80	0.2
81	0.21
82	0.2
83	0.21
84	0.21
85	0.22
86	0.19
87	0.19
88	0.2
89	0.19
90	0.19
91	0.17
92	0.2
93	0.19
94	0.21
95	0.21
96	0.22
97	0.24
98	0.24
99	0.24
100	0.25
101	0.31
102	0.37
103	0.41
104	0.47
105	0.48
106	0.52
107	0.53
108	0.5
109	0.44
110	0.41
111	0.38
112	0.33
113	0.3
114	0.26
115	0.24
116	0.23
117	0.23
118	0.17
119	0.16
120	0.19
121	0.19
122	0.19
123	0.26
124	0.3
125	0.34
126	0.38
127	0.38
128	0.34
129	0.35
130	0.37
131	0.32
132	0.3
133	0.25
134	0.22
135	0.19
136	0.17
137	0.16
138	0.14
139	0.13
140	0.12
141	0.13
142	0.16
143	0.16
144	0.16
145	0.17
146	0.17
147	0.18
148	0.18
149	0.16
150	0.12
151	0.12
152	0.12
153	0.1
154	0.09
155	0.07
156	0.05
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.09
161	0.1
162	0.13
163	0.18
164	0.21
165	0.22
166	0.3
167	0.32
168	0.33
169	0.37
170	0.41
171	0.43
172	0.42
173	0.41
174	0.33
175	0.32
176	0.28
177	0.22
178	0.16
179	0.09
180	0.09
181	0.08
182	0.07
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.07
188	0.08
189	0.07
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.1
195	0.09
196	0.08
197	0.13
198	0.12
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.09
204	0.08
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.04
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.07
223	0.1
224	0.15
225	0.14
226	0.14
227	0.14
228	0.15
229	0.15
230	0.15
231	0.13
232	0.14
233	0.15
234	0.15
235	0.17
236	0.18
237	0.17
238	0.17
239	0.16
240	0.1
241	0.13
242	0.13
243	0.14
244	0.14
245	0.14
246	0.15
247	0.15
248	0.14
249	0.11
250	0.12
251	0.13
252	0.12
253	0.13
254	0.16
255	0.19
256	0.21
257	0.23
258	0.25
259	0.23
260	0.27
261	0.3
262	0.3
263	0.29
264	0.29
265	0.29
266	0.29
267	0.33
268	0.36
269	0.33
270	0.3
271	0.28
272	0.28
273	0.28
274	0.23
275	0.19
276	0.12
277	0.11
278	0.1
279	0.1
280	0.08
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.03
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.08
308	0.07
309	0.11
310	0.12
311	0.12
312	0.15
313	0.2
314	0.26
315	0.3
316	0.38
317	0.39
318	0.42
319	0.48
320	0.46
321	0.41
322	0.39
323	0.39
324	0.34
325	0.35
326	0.32
327	0.26
328	0.25
329	0.25
330	0.19
331	0.15
332	0.11
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.08
350	0.09
351	0.09
352	0.11
353	0.12
354	0.11
355	0.13
356	0.17
357	0.2
358	0.22
359	0.27
360	0.26
361	0.25
362	0.25
363	0.24
364	0.2
365	0.19
366	0.17
367	0.15
368	0.15
369	0.15
370	0.15
371	0.14
372	0.15
373	0.13
374	0.12
375	0.11
376	0.1
377	0.11
378	0.11
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.11
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.09
394	0.08
395	0.07
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.05
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.04
422	0.04
423	0.02
424	0.02
425	0.03
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.06
430	0.07
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.12
435	0.13
436	0.13
437	0.14
438	0.15
439	0.17
440	0.19
441	0.2
442	0.16
443	0.17
444	0.2
445	0.2
446	0.18
447	0.17
448	0.16
449	0.21
450	0.26
451	0.33
452	0.35
453	0.36
454	0.35
455	0.4
456	0.42
457	0.41
458	0.39
459	0.31
460	0.29
461	0.29
462	0.3
463	0.25
464	0.2
465	0.17
466	0.15
467	0.16
468	0.13
469	0.11
470	0.1
471	0.13
472	0.15
473	0.15
474	0.16
475	0.14
476	0.19
477	0.2
478	0.2
479	0.16
480	0.19
481	0.18
482	0.18
483	0.23
484	0.19
485	0.21
486	0.21
487	0.21
488	0.17
489	0.16
490	0.15
491	0.1
492	0.1
493	0.06
494	0.07
495	0.06
496	0.06
497	0.08
498	0.08
499	0.16
500	0.17
501	0.2
502	0.22
503	0.24
504	0.26
505	0.26
506	0.25
507	0.2
508	0.25
509	0.24
510	0.23
511	0.21
512	0.2
513	0.19
514	0.18
515	0.15
516	0.1
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.1
524	0.09
525	0.09
526	0.08
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.08
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.08
539	0.07
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.07
546	0.05
547	0.05
548	0.04
549	0.04
550	0.06
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.08
556	0.09
557	0.14
558	0.12
559	0.13
560	0.14
561	0.18
562	0.25
563	0.32
564	0.42
565	0.42
566	0.44
567	0.48
568	0.55
569	0.55
570	0.54
571	0.52
572	0.44
573	0.4
574	0.38
575	0.33
576	0.27
577	0.22
578	0.17
579	0.13
580	0.14
581	0.14
582	0.16
583	0.22
584	0.26
585	0.35
586	0.4
587	0.5
588	0.56
589	0.64
590	0.74
591	0.78
592	0.8
593	0.77
594	0.76
595	0.75
596	0.72
597	0.68
598	0.6
599	0.53
600	0.53
601	0.54
602	0.55
603	0.5
604	0.5
605	0.53
606	0.57
607	0.58
608	0.52
609	0.46
610	0.46
611	0.45
612	0.39
613	0.33
614	0.25
615	0.21
616	0.2
617	0.19
618	0.12
619	0.09
620	0.09
621	0.08
622	0.08
623	0.12
624	0.16
625	0.2
626	0.24
627	0.25
628	0.28
629	0.28
630	0.33
631	0.35
632	0.37
633	0.32
634	0.29
635	0.29
636	0.26
637	0.25
638	0.2
639	0.15
640	0.09
641	0.08
642	0.09
643	0.09
644	0.09
645	0.14
646	0.15
647	0.21
648	0.23
649	0.25
650	0.25
651	0.26
652	0.27
653	0.24
654	0.26
655	0.27
656	0.26
657	0.24
658	0.26
659	0.26
660	0.25
661	0.26
662	0.26
663	0.25
664	0.24
665	0.28
666	0.27
667	0.29
668	0.3
669	0.3
670	0.27
671	0.28
672	0.28
673	0.28
674	0.3
675	0.28
676	0.26
677	0.28
678	0.3
679	0.26
680	0.33
681	0.3
682	0.31
683	0.33
684	0.32
685	0.33
686	0.36
687	0.36
688	0.3
689	0.35
690	0.3
691	0.3
692	0.29
693	0.27
694	0.22
695	0.25
696	0.27
697	0.29
698	0.33
699	0.34
700	0.36
701	0.38
702	0.36
703	0.38
704	0.35

A0A5N6DBA0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer