Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179V3F4

Protein Details
Accession A0A179V3F4    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-56GVKLGHRRRLQQRVAKEKKDBasic
65-92GEFGNYSRKKRRYQWHPKPDPNAPRKPLHydrophilic
166-188LDEWKAKKSARKKARNSEAKASHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-52K
72-76RKKRR
170-181KAKKSARKKARN
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 11.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MASKHGKTFWKSLKLICMILTPSVDVQSADVRREVLGVKLGHRRRLQQRVAKEKKDVPNRQAQHGEFGNYSRKKRRYQWHPKPDPNAPRKPLTAYAIFANEKRADLQYKGLSFPQMAIEIGRLWRELPEGEKKIAQARAIRARQEYKLALAEYEKSENYRSHVRYLDEWKAKKSARKKARNSEAKASHNATSSPQDTERSLESAEIKIESQLGNGLGDEILETVLPTQWVPVSPEQQMEHTCTAFVWPPSQKDIQNHMGRDRGIFDNTLAGLSNLERSMQGGGLEVVFEDAGMGCNVFWAEANHH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.54
3 0.46
4 0.4
5 0.32
6 0.31
7 0.28
8 0.2
9 0.17
10 0.17
11 0.17
12 0.13
13 0.13
14 0.18
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.2
19 0.19
20 0.21
21 0.2
22 0.15
23 0.19
24 0.19
25 0.23
26 0.32
27 0.36
28 0.43
29 0.46
30 0.53
31 0.57
32 0.66
33 0.7
34 0.69
35 0.74
36 0.78
37 0.84
38 0.8
39 0.77
40 0.75
41 0.75
42 0.78
43 0.76
44 0.7
45 0.71
46 0.69
47 0.69
48 0.68
49 0.59
50 0.54
51 0.48
52 0.45
53 0.35
54 0.35
55 0.37
56 0.36
57 0.41
58 0.45
59 0.49
60 0.54
61 0.63
62 0.7
63 0.72
64 0.78
65 0.83
66 0.85
67 0.89
68 0.9
69 0.87
70 0.86
71 0.85
72 0.82
73 0.8
74 0.73
75 0.67
76 0.6
77 0.57
78 0.52
79 0.46
80 0.39
81 0.31
82 0.28
83 0.28
84 0.27
85 0.24
86 0.24
87 0.2
88 0.19
89 0.19
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.22
94 0.22
95 0.22
96 0.23
97 0.23
98 0.21
99 0.18
100 0.18
101 0.14
102 0.11
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.11
115 0.18
116 0.2
117 0.21
118 0.22
119 0.22
120 0.26
121 0.28
122 0.27
123 0.22
124 0.26
125 0.34
126 0.35
127 0.37
128 0.35
129 0.36
130 0.35
131 0.35
132 0.29
133 0.22
134 0.21
135 0.19
136 0.16
137 0.14
138 0.14
139 0.12
140 0.13
141 0.11
142 0.1
143 0.12
144 0.13
145 0.15
146 0.21
147 0.21
148 0.23
149 0.26
150 0.26
151 0.28
152 0.34
153 0.39
154 0.39
155 0.39
156 0.37
157 0.4
158 0.41
159 0.44
160 0.47
161 0.49
162 0.53
163 0.62
164 0.69
165 0.74
166 0.82
167 0.85
168 0.82
169 0.81
170 0.77
171 0.71
172 0.67
173 0.59
174 0.5
175 0.41
176 0.37
177 0.29
178 0.26
179 0.23
180 0.21
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.2
185 0.19
186 0.16
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.11
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.11
218 0.15
219 0.17
220 0.19
221 0.22
222 0.23
223 0.25
224 0.26
225 0.27
226 0.25
227 0.22
228 0.21
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.18
233 0.2
234 0.21
235 0.24
236 0.29
237 0.33
238 0.35
239 0.38
240 0.44
241 0.47
242 0.5
243 0.51
244 0.49
245 0.49
246 0.46
247 0.41
248 0.38
249 0.31
250 0.27
251 0.25
252 0.22
253 0.2
254 0.2
255 0.19
256 0.15
257 0.12
258 0.11
259 0.1
260 0.13
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08