Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6DHZ1

Protein Details
Accession A0A5N6DHZ1    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-140MDTKTWLQQTKKRQKKIEKERVRKLAEEHydrophilic
284-309DVSEVKVKKPKKKKAKTTKRRAVMDEBasic
361-381SLTRQRRAAFKKRQKARPEDIHydrophilic
628-651KGSGKMKTEKRLKKIEEEKKREAMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-89KRKREERNAAIRK
123-136KKRQKKIEKERVRK
289-304KVKKPKKKKAKTTKRR
367-377RAAFKKRQKAR
628-648KGSGKMKTEKRLKKIEEEKKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MADALSIEQNNKIRVALGLKPLPVPGADATSGPTFKESEHDGSSSSSEDDEPGSTLESREALASSNWKKMQDEAEAKRKREERNAAIRKARDEAQRNTKLQGATLGEAADADMDTKTWLQQTKKRQKKIEKERVRKLAEELEERARAAEYTAEDLAGVKVGHAVGDFDGGEDHILTLKDTTIDENEEEGDELENLELKEKERTTEKLELKKRKPVYDPTEENTGILAQYDEEIEGKKRKRFTLDAQGSTVEEREAKRQEVSEKLKKNAISLDFAEETPTSDYMDVSEVKVKKPKKKKAKTTKRRAVMDEDDLFPTAESTGTPNGSSMEVDANNGEPVPAPAPRKSVSEDISFVDDDDLQASLTRQRRAAFKKRQKARPEDIARQLREEASQTPMEVEGENEEEPGLVIDETSEFVSNLQKPTLPERRERRTTTPAEEPRVSSEGPGIKDEPVEDGDVDMERSYNDIEDEEDLKARIKSEEATVNQQISGTGLEEESTLDQGLGATLSMLKQRGLVKSSDAADHNSLIRDRQRFLQEKNRLETEAEKRARLQRERDRASGKLNQMSAREREEYARWENKQRDQQDARHMAEVFNKEYKPDVQLKYVDEFGRAMNQKEAFKHLSHQFHGKGSGKMKTEKRLKKIEEEKKREAMSALDSSQHTGMNNAMGATARKNRQAGIRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.26
4 0.31
5 0.33
6 0.34
7 0.35
8 0.34
9 0.32
10 0.27
11 0.24
12 0.17
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.18
17 0.21
18 0.21
19 0.19
20 0.19
21 0.16
22 0.16
23 0.2
24 0.22
25 0.23
26 0.25
27 0.26
28 0.25
29 0.27
30 0.28
31 0.25
32 0.2
33 0.16
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.13
38 0.13
39 0.12
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.13
50 0.21
51 0.24
52 0.32
53 0.34
54 0.35
55 0.36
56 0.38
57 0.42
58 0.42
59 0.48
60 0.48
61 0.56
62 0.61
63 0.62
64 0.66
65 0.67
66 0.64
67 0.65
68 0.66
69 0.66
70 0.7
71 0.77
72 0.77
73 0.79
74 0.75
75 0.68
76 0.62
77 0.59
78 0.57
79 0.55
80 0.56
81 0.59
82 0.65
83 0.63
84 0.61
85 0.6
86 0.5
87 0.43
88 0.4
89 0.32
90 0.25
91 0.24
92 0.22
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.1
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.12
105 0.18
106 0.24
107 0.31
108 0.43
109 0.53
110 0.63
111 0.71
112 0.76
113 0.82
114 0.86
115 0.91
116 0.91
117 0.91
118 0.91
119 0.92
120 0.92
121 0.85
122 0.75
123 0.68
124 0.64
125 0.58
126 0.52
127 0.46
128 0.42
129 0.39
130 0.37
131 0.33
132 0.26
133 0.2
134 0.17
135 0.16
136 0.11
137 0.13
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.09
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.09
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.08
181 0.07
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.16
186 0.16
187 0.19
188 0.21
189 0.24
190 0.28
191 0.37
192 0.43
193 0.47
194 0.56
195 0.64
196 0.65
197 0.71
198 0.7
199 0.67
200 0.66
201 0.67
202 0.65
203 0.64
204 0.64
205 0.58
206 0.59
207 0.53
208 0.47
209 0.37
210 0.29
211 0.19
212 0.15
213 0.11
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.1
221 0.17
222 0.22
223 0.26
224 0.3
225 0.33
226 0.38
227 0.43
228 0.47
229 0.51
230 0.55
231 0.53
232 0.5
233 0.47
234 0.41
235 0.36
236 0.29
237 0.18
238 0.13
239 0.11
240 0.16
241 0.18
242 0.19
243 0.2
244 0.22
245 0.25
246 0.31
247 0.38
248 0.41
249 0.44
250 0.45
251 0.48
252 0.46
253 0.44
254 0.4
255 0.34
256 0.28
257 0.24
258 0.25
259 0.22
260 0.22
261 0.22
262 0.16
263 0.16
264 0.14
265 0.13
266 0.1
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.14
274 0.14
275 0.16
276 0.23
277 0.28
278 0.36
279 0.46
280 0.55
281 0.61
282 0.71
283 0.8
284 0.85
285 0.91
286 0.93
287 0.94
288 0.93
289 0.9
290 0.84
291 0.76
292 0.71
293 0.64
294 0.58
295 0.49
296 0.41
297 0.33
298 0.28
299 0.25
300 0.18
301 0.14
302 0.08
303 0.06
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.04
323 0.05
324 0.06
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.2
332 0.22
333 0.22
334 0.22
335 0.22
336 0.2
337 0.21
338 0.19
339 0.16
340 0.13
341 0.1
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.1
349 0.14
350 0.16
351 0.17
352 0.19
353 0.27
354 0.35
355 0.46
356 0.51
357 0.57
358 0.65
359 0.73
360 0.8
361 0.8
362 0.81
363 0.77
364 0.76
365 0.73
366 0.71
367 0.71
368 0.7
369 0.62
370 0.55
371 0.49
372 0.39
373 0.33
374 0.28
375 0.19
376 0.15
377 0.15
378 0.13
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.1
383 0.09
384 0.06
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.1
403 0.12
404 0.13
405 0.13
406 0.14
407 0.15
408 0.24
409 0.32
410 0.31
411 0.38
412 0.46
413 0.54
414 0.6
415 0.64
416 0.63
417 0.62
418 0.64
419 0.6
420 0.62
421 0.59
422 0.57
423 0.53
424 0.47
425 0.42
426 0.4
427 0.34
428 0.24
429 0.23
430 0.21
431 0.21
432 0.22
433 0.19
434 0.17
435 0.18
436 0.17
437 0.15
438 0.12
439 0.12
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.07
446 0.06
447 0.05
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.12
460 0.13
461 0.13
462 0.12
463 0.11
464 0.12
465 0.15
466 0.21
467 0.22
468 0.27
469 0.29
470 0.28
471 0.27
472 0.26
473 0.22
474 0.16
475 0.14
476 0.09
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.04
491 0.03
492 0.04
493 0.05
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.12
498 0.16
499 0.2
500 0.22
501 0.22
502 0.22
503 0.25
504 0.27
505 0.26
506 0.24
507 0.24
508 0.23
509 0.24
510 0.22
511 0.21
512 0.2
513 0.2
514 0.25
515 0.25
516 0.26
517 0.31
518 0.39
519 0.42
520 0.48
521 0.55
522 0.58
523 0.61
524 0.65
525 0.61
526 0.53
527 0.49
528 0.5
529 0.47
530 0.48
531 0.43
532 0.39
533 0.42
534 0.48
535 0.56
536 0.55
537 0.58
538 0.58
539 0.66
540 0.7
541 0.73
542 0.7
543 0.63
544 0.63
545 0.61
546 0.56
547 0.51
548 0.48
549 0.45
550 0.44
551 0.47
552 0.44
553 0.41
554 0.37
555 0.33
556 0.34
557 0.34
558 0.35
559 0.39
560 0.43
561 0.42
562 0.49
563 0.55
564 0.6
565 0.66
566 0.63
567 0.65
568 0.63
569 0.66
570 0.68
571 0.69
572 0.62
573 0.57
574 0.55
575 0.46
576 0.46
577 0.44
578 0.37
579 0.35
580 0.32
581 0.29
582 0.31
583 0.32
584 0.31
585 0.36
586 0.35
587 0.35
588 0.39
589 0.41
590 0.41
591 0.44
592 0.38
593 0.31
594 0.29
595 0.24
596 0.29
597 0.28
598 0.27
599 0.28
600 0.32
601 0.34
602 0.36
603 0.42
604 0.36
605 0.35
606 0.41
607 0.43
608 0.46
609 0.46
610 0.51
611 0.48
612 0.47
613 0.54
614 0.5
615 0.49
616 0.47
617 0.5
618 0.48
619 0.53
620 0.57
621 0.59
622 0.66
623 0.68
624 0.71
625 0.75
626 0.75
627 0.77
628 0.81
629 0.82
630 0.82
631 0.82
632 0.82
633 0.79
634 0.76
635 0.67
636 0.57
637 0.49
638 0.44
639 0.4
640 0.34
641 0.3
642 0.29
643 0.3
644 0.3
645 0.28
646 0.22
647 0.18
648 0.18
649 0.16
650 0.16
651 0.13
652 0.13
653 0.13
654 0.14
655 0.19
656 0.26
657 0.28
658 0.34
659 0.36
660 0.39
661 0.45