Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179U6I2

Protein Details
Accession A0A179U6I2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-54DDDSRKSQKKSRDHTLTRVRNNQRRCRERRRQYIATLEQKVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR007233  TRAPPC  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0030008  C:TRAPP complex  
GO:0048193  P:Golgi vesicle transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04099  Sybindin  
CDD cd14856  TRAPPC4_synbindin  
Amino Acid Sequences MSTPTNLKKNNNNDDDSRKSQKKSRDHTLTRVRNNQRRCRERRRQYIATLEQKVQETDRLLNEARAEIAKLRSELMECRSHRPLDPDRDNQLAAGGGSSASSSSGGGGGGGGGRGVDSIDAAPWSISFGEMGGYRHVSGHDNQEEERELLDLLPSPIPAELDDSWVASSTFYDQTVDIGYNNVMPNPPPLQQVDILSSPSPALITKPCGTAACGSKPPDAIAADAGAATTPPTASLSLSTISTPTLTALQLQDLVLPNIPASLLIISSSSSSSSSIYTLSPADESTTSCAQAFIFISQQNFKGVDASVIERWLCCGFRQATDPREGCRVENNLLFQVLDFISGPQLGIERSWRNCFNFEAGMDGVYPKAVYSLIIINKAGGLIYNREFQSGLLKLSTNDYLVLAGTFHGIHAITRSLTPRLPTSPTTTSSASTTSTGTTIPSHAHALSSSSSIRSPLYPPNTTSSSSSLPPTGTTSTTGAETSTTSALPPNTTVPNPSQPITGIEVLETDKFRLTCFQTVTGTKFLLFTDPLMAGVETVMRKIYELYADYVMKNPFYQLEMPVRCDAFDRHVAGWVKGRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.72
3 0.7
4 0.7
5 0.67
6 0.66
7 0.67
8 0.7
9 0.73
10 0.73
11 0.76
12 0.77
13 0.77
14 0.82
15 0.86
16 0.86
17 0.85
18 0.87
19 0.86
20 0.84
21 0.88
22 0.88
23 0.88
24 0.88
25 0.89
26 0.89
27 0.9
28 0.92
29 0.93
30 0.92
31 0.88
32 0.85
33 0.85
34 0.84
35 0.82
36 0.76
37 0.68
38 0.62
39 0.56
40 0.51
41 0.42
42 0.36
43 0.3
44 0.29
45 0.28
46 0.29
47 0.28
48 0.29
49 0.28
50 0.25
51 0.24
52 0.2
53 0.19
54 0.18
55 0.2
56 0.21
57 0.2
58 0.21
59 0.21
60 0.22
61 0.24
62 0.26
63 0.31
64 0.31
65 0.37
66 0.41
67 0.42
68 0.42
69 0.46
70 0.51
71 0.52
72 0.58
73 0.59
74 0.58
75 0.59
76 0.56
77 0.48
78 0.4
79 0.3
80 0.21
81 0.15
82 0.1
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.04
103 0.03
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.07
117 0.08
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.15
125 0.16
126 0.23
127 0.24
128 0.25
129 0.25
130 0.27
131 0.27
132 0.25
133 0.23
134 0.15
135 0.12
136 0.1
137 0.11
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.11
147 0.1
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.13
173 0.15
174 0.16
175 0.15
176 0.16
177 0.18
178 0.19
179 0.2
180 0.19
181 0.18
182 0.18
183 0.16
184 0.15
185 0.13
186 0.11
187 0.1
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.18
197 0.2
198 0.22
199 0.22
200 0.25
201 0.26
202 0.27
203 0.27
204 0.26
205 0.24
206 0.2
207 0.16
208 0.13
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.13
303 0.13
304 0.15
305 0.2
306 0.23
307 0.25
308 0.31
309 0.32
310 0.28
311 0.31
312 0.31
313 0.26
314 0.27
315 0.27
316 0.23
317 0.24
318 0.24
319 0.2
320 0.19
321 0.18
322 0.13
323 0.12
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.09
336 0.13
337 0.16
338 0.2
339 0.24
340 0.25
341 0.26
342 0.27
343 0.25
344 0.23
345 0.2
346 0.18
347 0.15
348 0.14
349 0.12
350 0.11
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.1
360 0.12
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.11
367 0.07
368 0.07
369 0.09
370 0.11
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.17
375 0.16
376 0.21
377 0.19
378 0.18
379 0.14
380 0.15
381 0.14
382 0.17
383 0.17
384 0.12
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.06
391 0.05
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.07
399 0.08
400 0.08
401 0.1
402 0.12
403 0.14
404 0.15
405 0.17
406 0.19
407 0.21
408 0.24
409 0.25
410 0.29
411 0.31
412 0.32
413 0.34
414 0.32
415 0.3
416 0.28
417 0.27
418 0.22
419 0.19
420 0.17
421 0.13
422 0.13
423 0.12
424 0.12
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.12
429 0.14
430 0.13
431 0.14
432 0.13
433 0.14
434 0.14
435 0.15
436 0.14
437 0.13
438 0.13
439 0.14
440 0.15
441 0.15
442 0.17
443 0.23
444 0.29
445 0.3
446 0.32
447 0.37
448 0.38
449 0.38
450 0.37
451 0.33
452 0.29
453 0.28
454 0.28
455 0.24
456 0.22
457 0.21
458 0.22
459 0.2
460 0.18
461 0.19
462 0.19
463 0.18
464 0.18
465 0.17
466 0.14
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.11
471 0.1
472 0.1
473 0.13
474 0.14
475 0.14
476 0.15
477 0.17
478 0.2
479 0.2
480 0.23
481 0.25
482 0.32
483 0.34
484 0.33
485 0.31
486 0.28
487 0.3
488 0.31
489 0.28
490 0.2
491 0.17
492 0.18
493 0.18
494 0.2
495 0.18
496 0.14
497 0.16
498 0.16
499 0.17
500 0.22
501 0.25
502 0.28
503 0.3
504 0.33
505 0.34
506 0.38
507 0.41
508 0.38
509 0.34
510 0.28
511 0.26
512 0.23
513 0.21
514 0.19
515 0.16
516 0.15
517 0.15
518 0.15
519 0.15
520 0.15
521 0.11
522 0.1
523 0.13
524 0.11
525 0.11
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.13
530 0.15
531 0.15
532 0.17
533 0.2
534 0.23
535 0.25
536 0.26
537 0.29
538 0.29
539 0.26
540 0.24
541 0.23
542 0.19
543 0.21
544 0.22
545 0.23
546 0.31
547 0.33
548 0.37
549 0.4
550 0.39
551 0.36
552 0.36
553 0.34
554 0.3
555 0.33
556 0.33
557 0.29
558 0.37
559 0.39
560 0.38