Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5JYW1

Protein Details
Accession C5JYW1    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-316IREGKKSKPYFLKRGEVKKEABasic
323-352EMSGKEKQRALERRRKKVAGKERKEMPWGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-119GKRKRPTASTGGISPKRAKVPG
289-352RRKERELIREGKKSKPYFLKRGEVKKEAVAKRFTEMSGKEKQRALERRRKKVAGKERKEMPWGR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
KEGG bgh:BDBG_07734  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MPISSKFNQRVRARLEEDEFEQFSGESTSDEGLEGGESVEDEEEEEENSAEDHSEEDDDEGEEDDDDDGDVEDSSSDINPSLNAISFGALAKAQASLGKRKRPTASTGGISPKRAKVPGRHSPTPSASSSGEKQEPEPELSEYQKHLAANAKKPPQKLTHRTSKHAPTIQSSRHAVSRKRTILEPPPVPKARDPRFDSVVLSHSTNGNSSTASNAAIHARKNYAFLDSYRKDEIAQLRKQVSTLQTKKHKTNYDERELARLKRQITSMSDRQRTFERKEMEREVLVQHRRKERELIREGKKSKPYFLKRGEVKKEAVAKRFTEMSGKEKQRALERRRKKVAGKERKEMPWGRRVVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.61
3 0.56
4 0.54
5 0.51
6 0.45
7 0.36
8 0.31
9 0.24
10 0.2
11 0.17
12 0.14
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.09
17 0.1
18 0.09
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.06
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.06
27 0.05
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.08
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.09
82 0.11
83 0.2
84 0.27
85 0.36
86 0.38
87 0.44
88 0.49
89 0.5
90 0.53
91 0.51
92 0.49
93 0.43
94 0.45
95 0.48
96 0.46
97 0.46
98 0.43
99 0.4
100 0.38
101 0.39
102 0.39
103 0.39
104 0.45
105 0.52
106 0.57
107 0.59
108 0.59
109 0.6
110 0.59
111 0.55
112 0.46
113 0.4
114 0.32
115 0.3
116 0.29
117 0.29
118 0.27
119 0.24
120 0.24
121 0.25
122 0.26
123 0.24
124 0.23
125 0.2
126 0.2
127 0.21
128 0.22
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.16
133 0.16
134 0.21
135 0.25
136 0.3
137 0.36
138 0.43
139 0.44
140 0.45
141 0.49
142 0.5
143 0.54
144 0.56
145 0.56
146 0.59
147 0.6
148 0.63
149 0.64
150 0.62
151 0.59
152 0.55
153 0.49
154 0.44
155 0.46
156 0.43
157 0.41
158 0.36
159 0.3
160 0.31
161 0.35
162 0.33
163 0.34
164 0.4
165 0.39
166 0.39
167 0.39
168 0.39
169 0.42
170 0.46
171 0.44
172 0.38
173 0.43
174 0.43
175 0.44
176 0.43
177 0.45
178 0.43
179 0.47
180 0.49
181 0.46
182 0.47
183 0.46
184 0.43
185 0.35
186 0.32
187 0.24
188 0.2
189 0.16
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.12
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.16
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.16
212 0.17
213 0.25
214 0.24
215 0.27
216 0.26
217 0.26
218 0.24
219 0.28
220 0.35
221 0.34
222 0.36
223 0.37
224 0.38
225 0.38
226 0.38
227 0.37
228 0.34
229 0.36
230 0.38
231 0.42
232 0.49
233 0.54
234 0.61
235 0.65
236 0.67
237 0.62
238 0.68
239 0.67
240 0.67
241 0.68
242 0.62
243 0.62
244 0.59
245 0.56
246 0.52
247 0.48
248 0.41
249 0.38
250 0.39
251 0.34
252 0.36
253 0.42
254 0.44
255 0.49
256 0.54
257 0.51
258 0.52
259 0.56
260 0.56
261 0.54
262 0.53
263 0.5
264 0.48
265 0.55
266 0.58
267 0.53
268 0.48
269 0.44
270 0.41
271 0.43
272 0.46
273 0.45
274 0.47
275 0.52
276 0.55
277 0.56
278 0.61
279 0.59
280 0.62
281 0.64
282 0.67
283 0.66
284 0.72
285 0.73
286 0.72
287 0.74
288 0.66
289 0.66
290 0.67
291 0.68
292 0.68
293 0.72
294 0.74
295 0.73
296 0.81
297 0.8
298 0.75
299 0.68
300 0.65
301 0.67
302 0.64
303 0.62
304 0.57
305 0.5
306 0.49
307 0.48
308 0.42
309 0.4
310 0.36
311 0.35
312 0.4
313 0.44
314 0.46
315 0.46
316 0.5
317 0.53
318 0.6
319 0.65
320 0.65
321 0.71
322 0.76
323 0.82
324 0.86
325 0.84
326 0.85
327 0.86
328 0.86
329 0.84
330 0.83
331 0.82
332 0.8
333 0.81
334 0.78
335 0.73
336 0.71