Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179V520

Protein Details
Accession A0A179V520    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-373SSTSNSSTSKKKSKKQTGSQSKFTAHydrophilic
443-471LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
448-464GKGFTKEKNKKKRGSYR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MALSKDVKKSSKKASTTSVKKSVASKPNNGKGVKEKSTSFSRKAALSPALLDAINDFLNAYGFNKTSKAFAVEQKENESITKAKIRTTGKTTTKTPFLVEIFEDWERNHKAQRSEEKEENSVDTDESDSSDSDSDASSSESSDSDVAMESAHSSSSSSESDSSDEDAEKAPVAQLNNLKRKHHGNSSSSSSDSGSDRARPQAKRTKLATKKSTLKAAAKLSSTSESSFESSSGSGSDSDSNSDSGSNSDSNSDSDSDSDSGSDSSSTSESVKSKKKPVSKSTDVAAAQIPLPESGENDSSDSSSSSSSSSSDSSDNDGSSGLRRSTESSATLEASSSPSDPSSDSSSNSSTSNSSTSKKKSKKQTGSQSKFTASSTTLNRNTFSTSTPNVVSTPLSTPAVSTSPAKRSGAKPTPLAQASELPHNHPSNAYIPYAYAERAHKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGPGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.73
3 0.75
4 0.77
5 0.75
6 0.69
7 0.67
8 0.68
9 0.68
10 0.67
11 0.65
12 0.65
13 0.66
14 0.72
15 0.76
16 0.71
17 0.66
18 0.65
19 0.67
20 0.64
21 0.58
22 0.52
23 0.5
24 0.6
25 0.62
26 0.56
27 0.53
28 0.49
29 0.48
30 0.47
31 0.47
32 0.4
33 0.35
34 0.32
35 0.28
36 0.26
37 0.23
38 0.21
39 0.15
40 0.14
41 0.12
42 0.1
43 0.09
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.12
51 0.14
52 0.14
53 0.16
54 0.17
55 0.2
56 0.21
57 0.27
58 0.35
59 0.39
60 0.41
61 0.44
62 0.44
63 0.4
64 0.37
65 0.33
66 0.27
67 0.25
68 0.3
69 0.27
70 0.28
71 0.35
72 0.38
73 0.42
74 0.46
75 0.51
76 0.51
77 0.56
78 0.58
79 0.56
80 0.56
81 0.51
82 0.47
83 0.42
84 0.35
85 0.32
86 0.28
87 0.24
88 0.23
89 0.22
90 0.22
91 0.17
92 0.23
93 0.25
94 0.26
95 0.3
96 0.31
97 0.36
98 0.44
99 0.54
100 0.55
101 0.59
102 0.63
103 0.61
104 0.59
105 0.55
106 0.48
107 0.39
108 0.31
109 0.24
110 0.19
111 0.16
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.12
161 0.18
162 0.26
163 0.34
164 0.38
165 0.38
166 0.4
167 0.46
168 0.47
169 0.5
170 0.49
171 0.45
172 0.46
173 0.51
174 0.49
175 0.43
176 0.39
177 0.31
178 0.25
179 0.22
180 0.19
181 0.15
182 0.16
183 0.17
184 0.23
185 0.29
186 0.29
187 0.36
188 0.43
189 0.46
190 0.5
191 0.53
192 0.57
193 0.59
194 0.67
195 0.65
196 0.63
197 0.67
198 0.63
199 0.64
200 0.59
201 0.54
202 0.5
203 0.48
204 0.43
205 0.35
206 0.32
207 0.28
208 0.25
209 0.22
210 0.17
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.1
256 0.12
257 0.18
258 0.25
259 0.29
260 0.36
261 0.42
262 0.49
263 0.55
264 0.62
265 0.65
266 0.64
267 0.62
268 0.56
269 0.56
270 0.48
271 0.4
272 0.32
273 0.23
274 0.17
275 0.16
276 0.14
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.13
307 0.15
308 0.12
309 0.11
310 0.12
311 0.16
312 0.18
313 0.2
314 0.2
315 0.19
316 0.2
317 0.2
318 0.19
319 0.16
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.12
329 0.17
330 0.17
331 0.18
332 0.21
333 0.22
334 0.23
335 0.23
336 0.21
337 0.16
338 0.16
339 0.19
340 0.19
341 0.22
342 0.28
343 0.35
344 0.44
345 0.52
346 0.59
347 0.66
348 0.74
349 0.81
350 0.84
351 0.87
352 0.88
353 0.87
354 0.87
355 0.79
356 0.71
357 0.62
358 0.52
359 0.43
360 0.34
361 0.32
362 0.3
363 0.35
364 0.37
365 0.38
366 0.38
367 0.36
368 0.38
369 0.33
370 0.31
371 0.28
372 0.25
373 0.27
374 0.26
375 0.26
376 0.23
377 0.23
378 0.21
379 0.17
380 0.17
381 0.17
382 0.17
383 0.16
384 0.16
385 0.17
386 0.18
387 0.17
388 0.19
389 0.21
390 0.25
391 0.3
392 0.32
393 0.34
394 0.37
395 0.46
396 0.51
397 0.5
398 0.5
399 0.5
400 0.57
401 0.53
402 0.51
403 0.42
404 0.39
405 0.37
406 0.41
407 0.37
408 0.33
409 0.38
410 0.38
411 0.36
412 0.31
413 0.32
414 0.27
415 0.29
416 0.26
417 0.19
418 0.19
419 0.2
420 0.21
421 0.19
422 0.19
423 0.2
424 0.22
425 0.25
426 0.25
427 0.24
428 0.26
429 0.3
430 0.33
431 0.39
432 0.37
433 0.37
434 0.42
435 0.42
436 0.47
437 0.5
438 0.52
439 0.54
440 0.63
441 0.71
442 0.77
443 0.85
444 0.87
445 0.9
446 0.91
447 0.9
448 0.9
449 0.89
450 0.89
451 0.88
452 0.82
453 0.72
454 0.62
455 0.61
456 0.53
457 0.47
458 0.37
459 0.3
460 0.28